Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 500,941 | G→A | 5.1% | A108T (GCC→ACC) | PP_0412 → | polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 500,941 | 0 | G | A | 5.1% | 233.2 / 2.3 | 80 | A108T (GCC→ACC) | PP_0412 | polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/36); new base A (2/2); total (42/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.77e-01 |
GTACAACGGCGAAATGGCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGCAGTTCCCGGGCAAGCGCGGC > NC_002947/500793‑501090 | gTACAACGGCGAAATGGCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGc > 1:1764503/1‑150 (MQ=255) gTACAACGGCGAAATGGCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGAGAAAGCAACGTGGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGc > 2:1296616/1‑150 (MQ=255) cAACGGCGAAATGGCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTTTGACGTGTAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGa > 2:739265/1‑150 (MQ=255) cAACGGCGAAATGGCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGa < 2:435325/150‑1 (MQ=255) aaCGGCGAAATGGCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGAc > 2:447598/1‑150 (MQ=255) gCGAAATGGCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACg > 2:1017380/1‑150 (MQ=255) gAAATGGCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTg < 1:750655/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGt < 2:427154/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGAATGACGTGAGATCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGt > 2:529731/1‑150 (MQ=255) aaGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTTCGGCGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCTTCCCTGTGCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAg > 1:1376949/1‑150 (MQ=255) aaagggcGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTg > 2:653905/7‑150 (MQ=255) gACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACCTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGtgtg < 1:529731/150‑1 (MQ=255) aaGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCGATTCAGCCTTGCGGTGTGGGcttc < 2:1284946/150‑1 (MQ=255) aaGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGcttc > 1:229572/1‑150 (MQ=255) tgtCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTATGGGCTTCTTCGTCt < 2:1662033/150‑1 (MQ=255) gtCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTg < 2:526451/150‑1 (MQ=255) ggAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCa < 1:447598/150‑1 (MQ=255) gAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCAc > 1:96193/1‑150 (MQ=255) aaCCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACg < 1:739265/150‑1 (MQ=255) tGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCa < 1:381203/112‑1 (MQ=255) tGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCa > 2:381203/1‑112 (MQ=255) gTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGcttct < 1:306678/130‑1 (MQ=255) gTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGcttct > 2:306678/1‑130 (MQ=255) gTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATg < 2:1764503/150‑1 (MQ=255) agagGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCANGGc < 2:1196682/150‑1 (MQ=255) gTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTAc > 2:1770802/1‑150 (MQ=255) gAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGTCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAAc < 2:1032572/150‑1 (MQ=255) gTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGc > 1:255492/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGcc < 2:1779977/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGcc > 2:1235226/1‑150 (MQ=255) gCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATgg > 2:1895876/1‑137 (MQ=255) gCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATgg < 1:1895876/137‑1 (MQ=255) gCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGa > 1:994028/1‑150 (MQ=255) cAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACa > 2:981359/1‑150 (MQ=255) gTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACCACGCCGACCAGCTCAAGACCGccc > 1:363843/1‑150 (MQ=255) ttGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCttcttc < 1:97153/100‑1 (MQ=255) ttGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCttcttc > 2:97153/1‑100 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGc > 2:52441/1‑61 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGc < 1:52441/61‑1 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCa < 2:1653034/70‑1 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCa > 1:1653034/1‑70 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTa > 2:1771892/1‑119 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTa < 1:1771892/119‑1 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCccacc > 1:87219/1‑150 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGACCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGc > 2:246686/1‑116 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGACCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGc < 1:247379/116‑1 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGACCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGc < 1:246686/116‑1 (MQ=255) gacgaAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGACCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGc > 2:247379/1‑116 (MQ=255) aGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATGCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTg < 1:1201327/150‑1 (MQ=255) gCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTggg > 1:1620039/1‑150 (MQ=255) aTGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGcc > 1:794904/1‑150 (MQ=255) aTGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCCGGTGCCATTCa > 1:1103683/1‑65 (MQ=255) aTGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCCGGTGCCATTCa > 1:1103544/1‑65 (MQ=255) aTGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCCGGTGCCATTCa < 2:1103683/65‑1 (MQ=255) aTGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCCGGTGCCATTCa < 2:1103544/65‑1 (MQ=255) ttCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGCGCCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGAt > 1:1590901/1‑150 (MQ=255) gAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTc < 1:981359/150‑1 (MQ=255) gggCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCGATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGGCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCTACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTgg < 2:316529/148‑1 (MQ=255) gCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCt > 1:1186468/1‑146 (MQ=255) gCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCt < 2:1186468/146‑1 (MQ=255) gCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGa < 2:96193/150‑1 (MQ=255) cTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTgg > 1:842320/1‑147 (MQ=255) cTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTgg < 2:842320/147‑1 (MQ=255) gACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGAATCCGCGCCGTGTTCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACAcc < 2:1590901/150‑1 (MQ=255) cccAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCaa < 2:618519/150‑1 (MQ=255) ccAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAg < 2:794904/150‑1 (MQ=255) ccAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGAGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAg > 1:526103/1‑150 (MQ=255) cAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCATGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGc > 1:770066/1‑150 (MQ=255) cAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGTCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGc > 2:1036544/1‑150 (MQ=255) aGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGCa > 2:1088196/1‑150 (MQ=255) ccTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGCAGtt > 2:77944/1‑150 (MQ=255) tGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCACGACCGCCCCCACCAGCAGGGCCGAGTTCTGGGACACCAAGCAGGTcc > 1:59908/1‑150 (MQ=255) gTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAACACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGCAGTTccc > 2:722816/1‑150 (MQ=255) tCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGAGACTTTTTCTGGGACACCAAGCAGTTCCCgg < 1:1296616/150‑1 (MQ=255) cAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGCAGTTCCCGGGCaa < 1:77944/150‑1 (MQ=255) aaTGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTgg < 1:1446417/126‑1 (MQ=255) aaTGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTgg > 2:1446417/1‑126 (MQ=255) aaTGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATGTCTGGGACACCAAGCAGTTCCCGGGCAAg > 1:1645430/1‑150 (MQ=255) aTGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGCAGTTCCCGGGCAAgc < 1:653905/150‑1 (MQ=255) aGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCAACCGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGCAGTTCCCTGGCAAGcgcg < 2:1164614/150‑1 (MQ=255) gCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGAGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGCAGTTCCCGGGCAAGCGCGGc < 2:526103/150‑1 (MQ=255) | GTACAACGGCGAAATGGCCAAGGTCAAGGCAATGGTCGACACCAAGAGTGTGTCGTGGAACCTGGTAGAGGTTGAGTCGCCAGAGCTGGCGCGCGGTTGCGACGAAGGCATGTTCGAAGAGCTCGACCCAGCCCTGTTCGGCAATGAGGCCGACTACGTGCCTGGTGCCATTCAGCCTTGCGGTGTGGGCTTCTTCGTCTGGTCCACGGTCATGGCCTACAACGCCGACAAGCTCAAGACCGCCCCCACCAGCTGGGCCGATTTCTGGGACACCAAGCAGTTCCCGGGCAAGCGCGGC > NC_002947/500793‑501090 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |