| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 77,503 | A→T | 10.8% | V14E (GTG→GAG) | rsmB ← | ribosomal RNA small subunit methyltransferase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 77,503 | 0 | A | T | 10.8% | 238.5 / 15.1 | 85 | V14E (GTG→GAG) | rsmB | ribosomal RNA small subunit methyltransferase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/37); new base T (6/3); total (44/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
AGCAGCTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCAGGGCTT > NC_002947/77359‑77652 | agcagcTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCg < 2:1636650/150‑1 (MQ=255) gcTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCa < 1:102333/150‑1 (MQ=255) gcTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCa > 1:158795/1‑150 (MQ=255) tgCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAgcgc > 2:1750679/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACg < 2:158795/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACgg < 1:1240974/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGGCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACggg > 2:742256/1‑150 (MQ=255) cagcagGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGggc > 1:279410/1‑150 (MQ=255) cagcagGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGGCAGGCCGCGGTCGCGCTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCACCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGggc > 2:1267893/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCg < 1:589362/130‑1 (MQ=255) gTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCg > 2:589362/1‑130 (MQ=255) gAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAg < 1:984014/150‑1 (MQ=255) gAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTCTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAg < 1:1877650/150‑1 (MQ=255) aGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAgg < 2:1460717/150‑1 (MQ=255) cGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGTGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGt < 1:1632004/150‑1 (MQ=255) gTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTg > 2:1800650/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACCGCGGCCCGCGCACGGGCGGCGGCGGGGCGTGGGTTc > 1:950057/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTc > 1:1070288/1‑150 (MQ=255) 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tACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCAc > 1:1549536/1‑150 (MQ=255) gAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCAGCTTg > 1:755308/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGcc < 1:1327579/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCcggc < 2:1549536/150‑1 (MQ=255) cTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAAc > 2:1692328/1‑150 (MQ=255) cTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAAc > 2:1692472/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCg > 1:1351186/1‑84 (MQ=255) gTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCg < 2:1351186/84‑1 (MQ=255) tCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGCGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTtctc < 1:808461/150‑1 (MQ=255) gCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGTCATA‑CATCCATCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCgcgg > 2:543444/1‑150 (MQ=255) ccGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCgcggc < 1:755933/150‑1 (MQ=255) ccGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCgcggc < 1:156136/150‑1 (MQ=255) gTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTg < 2:484080/150‑1 (MQ=255) tCGCGTTCATCTACCT‑TGTCAAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGt > 2:691321/1‑150 (MQ=255) cgcgTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGtt < 2:279410/150‑1 (MQ=255) gTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGaa > 1:1511045/1‑150 (MQ=255) gTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGaa < 1:194047/150‑1 (MQ=255) cATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAg < 2:1740172/150‑1 (MQ=255) aTCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAgg > 2:109301/1‑150 (MQ=255) ccT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACt > 1:545460/1‑150 (MQ=255) ccT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGGGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACt > 1:76284/1‑150 (MQ=255) t‑tGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGa > 2:703080/1‑150 (MQ=255) t‑tGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTAACtaa > 1:789657/1‑148 (MQ=255) t‑tGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTACCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGa > 1:903909/1‑150 (MQ=255) tGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGaa < 2:1070288/150‑1 (MQ=255) tGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGaa < 1:1762181/150‑1 (MQ=255) aGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGTG‑CTCAGCGGcaa < 2:1046581/55‑3 (MQ=37) 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1:963894/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTc > 1:63469/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTGGT‑CACAGCGGCGAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCGCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGGAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa < 2:950057/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 1:25861/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 1:1414368/1‑150 (MQ=255) tggCCGCTGTG‑CTCAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGCAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 2:937879/3‑150 (MQ=255) tggCCGCTGTG‑CTCAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGtac > 1:27783/3‑148 (MQ=255) tggCCGCTGTG‑CTCAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATAGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGGTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 2:853862/3‑150 (MQ=255) tGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGAACGGGCGGCGGCGAGGCGTGCGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGAACCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAg < 1:125064/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAgg < 2:63469/150‑1 (MQ=255) gCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGCCAATCTCTCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTc > 2:65043/1‑150 (MQ=255) cTGTG‑CTCAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCa < 2:27783/150‑1 (MQ=255) gAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCGATGCCTTGCCGCCAGGCAGTGGCAGGCGGGTCAGGCTCAgg < 2:545460/150‑1 (MQ=255) cacaGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCAGGGCt > 2:637720/1‑150 (MQ=255) acaGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAAt > 2:1056461/1‑107 (MQ=255) acaGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAAt < 1:1056461/107‑1 (MQ=255) acaGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTGCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCAGGGCtt < 1:1875069/150‑1 (MQ=255) | AGCAGCTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCT‑TGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAG‑CACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCAGGGCTT > NC_002947/77359‑77652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |