| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 572,521 | A→G | 5.8% | I191T (ATC→ACC) | PP_0486 ← | GntR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 572,521 | 0 | A | G | 5.8% | 300.7 / 5.7 | 103 | I191T (ATC→ACC) | PP_0486 | GntR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (50/47); new base G (4/2); total (54/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.07e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
AGGCCGCGCGCAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGTACCTGCCCCAAG > NC_002947/572372‑572670 | aggcCGCGCGCAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGa < 1:626161/150‑1 (MQ=255) gcCGCGCGCAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATg < 1:185496/150‑1 (MQ=255) gcCGCGCGCAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATg < 1:822546/150‑1 (MQ=255) ccGCGCGCAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATgg > 2:83382/1‑150 (MQ=255) ccGCGCGCAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGCTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATgg > 2:675658/1‑150 (MQ=255) cgcgcAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGcca > 1:1890683/1‑150 (MQ=255) gcgcAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGccac > 1:1544210/1‑150 (MQ=255) gcAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGa < 2:1770599/141‑1 (MQ=255) gcAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGccacca < 1:751151/150‑1 (MQ=255) aaTGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATgg > 2:487009/1‑142 (MQ=255) aaTGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATgg < 1:487009/142‑1 (MQ=255) aaTGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACcagc > 1:1762277/1‑150 (MQ=255) cTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGccc < 1:824384/150‑1 (MQ=255) cTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGccc < 1:819733/150‑1 (MQ=255) tCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCa > 2:360552/1‑150 (MQ=255) gggATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGt < 2:1172273/150‑1 (MQ=255) gATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCTACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTg < 2:1428359/150‑1 (MQ=255) tGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTggg < 2:833717/150‑1 (MQ=255) gAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGgc < 2:1557245/150‑1 (MQ=255) aGCCCGTGTTCGTCCATGGCGATGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGgcg < 1:61347/150‑1 (MQ=255) cccGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGcc > 1:1461217/1‑150 (MQ=255) gTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAg < 2:511528/150‑1 (MQ=255) gTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAg < 2:1518450/150‑1 (MQ=255) gTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAg > 2:725253/1‑150 (MQ=255) ccATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGAAAATGTTGGTCTCCAGCGGTCAGta < 2:1607753/150‑1 (MQ=255) cATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGtac > 2:1773583/1‑150 (MQ=255) cATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGtac < 2:714883/150‑1 (MQ=255) gCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCACATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTAcc > 1:858357/1‑150 (MQ=255) gACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGAt > 2:1316641/1‑105 (MQ=255) gACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGAt < 1:1316641/105‑1 (MQ=255) gccgcGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACctgctg > 1:1705916/1‑150 (MQ=255) ccgcGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCtgctgc > 2:374436/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCa > 2:1914675/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCACATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCa < 2:858357/150‑1 (MQ=255) aGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCCGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGa < 1:439885/150‑1 (MQ=255) gcCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGTGACTCGCACAGCAACACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTACTGCCAGCGAGCAt > 2:809043/1‑150 (MQ=255) gcCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCAt > 1:1722591/1‑150 (MQ=255) gcCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCAt > 2:1639995/1‑150 (MQ=255) cGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCa < 2:1158026/150‑1 (MQ=255) ggCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAg < 1:83382/150‑1 (MQ=255) ggCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGACCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAg < 1:675658/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAgg < 1:374436/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAgg > 1:1892317/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGGTGGCCATcagcag > 2:1883192/1‑97 (MQ=255) ccAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGGTGGCCATcagcag < 1:1883192/97‑1 (MQ=255) 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ctTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTc < 1:934208/150‑1 (MQ=255) ctTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACACTCTGTCACATAGTc < 1:12027/150‑1 (MQ=255) ctTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATAAGGCAGCCAGCGCTGTATCAGCAGTACGCCGGTTTTTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTc < 1:1773583/150‑1 (MQ=255) ttCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCg > 2:287652/1‑150 (MQ=255) caacatgggCTGCTGGTGGCCATCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCg > 1:785003/8‑150 (MQ=255) cAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGt > 2:1299622/1‑148 (MQ=255) cAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGt < 1:1299622/148‑1 (MQ=255) gctgctGGTGGCCATCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGTACCTg > 1:530169/1‑150 (MQ=255) gctgctGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGGCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGTACCTg > 2:1807604/1‑150 (MQ=255) gctgctGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATc < 1:1680892/88‑1 (MQ=255) gctgctGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATc > 2:1680892/1‑88 (MQ=255) gctgctGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACCTAGTCGAGCACCtc > 2:362799/1‑149 (MQ=255) gctgctGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGTACCTg > 1:313035/1‑150 (MQ=255) ctgctgGTGGCCATCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTc < 1:937707/132‑1 (MQ=255) ctgctgATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGTACCTGc < 1:381788/150‑1 (MQ=255) tgctgATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGa > 1:730656/1‑62 (MQ=255) tgctgATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGa < 2:730656/62‑1 (MQ=255) ctgATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGTACCTGcccc < 2:1251953/150‑1 (MQ=255) tgATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGTACCTGCCCCa > 2:572080/1‑150 (MQ=255) aTGGCCACCAGCAGCCCAGGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGTACCTGCCCCAAg > 2:319694/1‑150 (MQ=255) | AGGCCGCGCGCAATGCCTCCGGGATGAGCCCGTGTTCGTCCATGGCGACGCCGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCTGTGGGCCAGGGATATGATGCCCGGGTAGCAGAGCGACTCGCACAGCACCACATCGTCACTCTTCGACAGGCTGCTGATGGCCACCAGCAGCCCATGTTGGGCGCCAGCGGTCAGTACTACCTGCTGCCAGCGAGCATCAGGCAGCCAGCGCTGTATCCAGGTCGCACCGGCTTGTTTGTGGGACGTGTGACCACCCTCTGTCACATAGTCGAGTACCTGCCCCAAG > NC_002947/572372‑572670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |