| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 660,595 | T→C | 6.8% | G546G (GGT→GGC) | speA → | biosynthetic arginine decarboxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 660,595 | 0 | T | C | 6.8% | 242.2 / 5.3 | 88 | G546G (GGT→GGC) | speA | biosynthetic arginine decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/39); new base C (3/3); total (46/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.49e-01 | |||||||||||
CCGATGCGGCGTGCGGTATTGCAGGACCTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCATCGAAGACATGCTGCGCTACGTGCAC > NC_002947/660446‑660739 | ccGATGCGGCGTGCGGTATTGCAGGACCTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTggtgggt > 2:9714/1‑150 (MQ=255)ccGATGCGGCGTGCGGTATTGCAGGACCTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTggtgggt < 1:1460090/150‑1 (MQ=255) cGGTATTTCAGGACCTAACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTCGGCACCCACCAGGaac < 2:975338/150‑2 (MQ=255) ttGCAGGACCTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTg < 2:121675/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGACCTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATAAACCCGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTCGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTg < 2:899812/150‑1 (MQ=255) gCAGGACCTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTggg > 1:1228789/1‑150 (MQ=255) ggACCTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGa > 2:1638193/1‑150 (MQ=255) gACCTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGAAGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGAc > 1:38737/1‑150 (MQ=255) aCCTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACa > 1:900001/1‑150 (MQ=255) aCCGGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGATTTCCTggtaggca < 2:764398/150‑7 (MQ=255) ccTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACAt > 2:428759/1‑150 (MQ=255) ccTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACAt < 2:1531958/150‑1 (MQ=255) tGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGc > 2:995193/1‑150 (MQ=255) gACTGGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGca > 2:507164/1‑150 (MQ=255) ttGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTggg < 2:1326022/138‑1 (MQ=255) ttGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTggg > 1:1326022/1‑138 (MQ=255) ttGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACaa > 2:695909/1‑150 (MQ=255) ttGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACaa > 1:1362502/1‑150 (MQ=255) ttGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACaa > 2:153433/1‑150 (MQ=255) tGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGCCGAGACGAGTCTCTTCCGCTCTGAGGCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTCCCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAAc < 2:988725/150‑1 (MQ=255) tGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAAc < 2:1228789/150‑1 (MQ=255) gATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATAGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGCAATCCTGGGTGACATGCCCAACCTg > 1:572742/1‑150 (MQ=255) aTTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGt > 1:14393/1‑150 (MQ=255) aTTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGt > 2:1820827/1‑150 (MQ=255) aTTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCATGGGTGACATGcacatcgcgt > 2:404793/1‑144 (MQ=255) ttCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGtt < 1:153433/150‑1 (MQ=255) tCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTc < 2:14393/150‑1 (MQ=255) tCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTc < 1:1004434/150‑1 (MQ=255) tCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTc < 2:582977/150‑1 (MQ=255) ccGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGCGCCGAGATTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCg < 2:1893423/150‑1 (MQ=255) ccGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCg < 1:9714/150‑1 (MQ=255) gACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGt < 2:1817453/150‑1 (MQ=255) gACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTCAGGCGCCCAGGCAGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGACTAATAGGACATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGt > 1:34985/1‑150 (MQ=255) cAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGa < 1:503521/126‑1 (MQ=255) cAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGa > 2:503521/1‑126 (MQ=255) gATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCGTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGa > 2:991520/1‑150 (MQ=255) ttaaCGAGTTCGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGAtt < 2:404726/148‑1 (MQ=255) tCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTAGGCACCCACCAGGaa < 2:1447184/110‑1 (MQ=255) tCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTAGGCACCCACCAGGaa > 1:1447184/1‑110 (MQ=255) 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gACGAGCAGAGCATCGAAACCAGGTTGCCGTGTCAGGCGTTGAACGAGGGTGCGGATTACCTGTCAGCTATCGTTCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTAc < 1:975544/150‑1 (MQ=255) gACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTAc < 2:1139855/150‑1 (MQ=255) gagcagagcaTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGaa < 1:1270500/140‑1 (MQ=255) gagcagagcaTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGaa > 2:1270500/1‑140 (MQ=255) gcagagcaTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGaa > 1:850024/1‑150 (MQ=255) cagagcaTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAAt > 1:1839911/1‑150 (MQ=255) gagcaTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGa > 1:69470/1‑120 (MQ=255) gagcaTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGa < 2:69470/120‑1 (MQ=255) agcaTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTgg < 1:1570554/94‑1 (MQ=255) agcaTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTgg > 2:1570554/1‑94 (MQ=255) agcaTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGcc > 1:677203/1‑150 (MQ=255) caTCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGa < 2:850024/150‑1 (MQ=255) tCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGAc > 2:734174/1‑95 (MQ=255) tCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGAc < 1:734174/95‑1 (MQ=255) tCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACGTTGTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCCACg > 1:205953/1‑150 (MQ=255) tCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGAATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACg > 2:642019/1‑150 (MQ=255) cAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCgt < 1:1638193/150‑1 (MQ=255) cAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCgt < 1:120553/150‑1 (MQ=255) cAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCgt > 2:1149183/1‑150 (MQ=255) cATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTa < 1:695909/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCa < 1:1300878/150‑1 (MQ=255) cGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGt > 2:80362/1‑98 (MQ=255) cGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGt < 1:80362/98‑1 (MQ=255) 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aaGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTAGGCACCCACCAGGaa > 2:681135/1‑54 (MQ=21) ggaggGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGGACTCATAGGTGACGTGGACAACCTGTTCGGTGACAACGATTAGGTGCAAATCAACTCTCTTTCCGACCGCTACGTGTACAAAGCCAATATCGAATCCCa > 2:366610/1‑150 (MQ=255) ggaggGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCa < 1:995193/150‑1 (MQ=255) ggTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGac > 1:1458179/1‑150 (MQ=255) gTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGaca > 2:668035/1‑150 (MQ=255) tGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGACATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCAACGacac > 2:615/1‑150 (MQ=255) tGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGacac > 1:754986/1‑150 (MQ=255) aGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCa < 1:855568/150‑1 (MQ=255) tACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCATCGaa < 1:991520/150‑1 (MQ=255) ctgctgGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCATCGAAGAc > 2:1526152/1‑150 (MQ=255) tgctgGGTGTGTTCCTGGCGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGANGGCANCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCATCGAAGACa < 1:366610/150‑1 (MQ=255) ctgGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCATCGAAGACAtg < 2:1362502/150‑1 (MQ=255) ggCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCg > 1:459550/1‑72 (MQ=255) ggCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCg < 2:459550/72‑1 (MQ=255) gtgtTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCATCGAAGACATGCTgcgc > 1:750792/1‑150 (MQ=255) gatttCCTGGTAGGCACCCACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCATCGAAGACATGCTgcgc > 2:170190/4‑150 (MQ=255) tCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCATCGAAGACATGCTGCGCTACg > 2:1225715/1‑150 (MQ=255) gtgggtgCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCATCGAAGACATGCTGCGCTACGTGCAc < 2:6457/150‑1 (MQ=255) | CCGATGCGGCGTGCGGTATTGCAGGACCTGACTTGCGATTCCGACGGCAAGATCAACCAGTACGTTGACGAGCAGAGCATCGAAACCAGCATGCCGGTGCATGCGGTGAAGGAGGGTGAGGATTACCTGCTGGGCGTGTTCCTGGTGGGTGCCTACCAGGAAATCCTGGGTGACATGCACAACCTGTTCGGTGACACCGATTCGGTGAACATCTACCAGAATGCCGACGGCAGCGTGTACCACGCCGGTATCGAAACCCACGACACCATCGAAGACATGCTGCGCTACGTGCAC > NC_002947/660446‑660739 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |