Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 809,807 | C→G | 6.0% | P124R (CCC→CGC) ‡ | PP_0696 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 809,807 | 0 | C | G | 6.0% | 205.7 / 4.6 | 68 | P124R (CCC→CGC) ‡ | PP_0696 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/30); new base G (2/2); total (36/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.90e-01 |
ATCGATTTTGAGGTCAGGCCGGCATCGGTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGACCCCTCTTACCTGCTGCTCAAGGACATGCT > NC_002947/809659‑809954 | aTCGATTTTGAGGTCAGGCCGGCATCGGTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGccc > 1:86326/1‑150 (MQ=255) ttGAGGTCAGGCCGGCATCGGTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTc < 1:1900738/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCGGCATCGGTAACCAGCGCACCTTCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGcc > 1:989825/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCGGCATCGGTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGcc > 1:1680271/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGCATCGGTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCg > 2:1236948/1‑150 (MQ=255) gCATCGGTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGCGGTTCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCg > 1:1384461/1‑150 (MQ=255) aTCGGTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGt < 2:299164/150‑1 (MQ=255) tCGGTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATACCGCCGCAATCAACTGGGGTAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTg > 2:543574/1‑150 (MQ=255) cGGTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTgc > 1:1243499/1‑150 (MQ=255) ggTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCCCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTgcc < 2:721142/150‑1 (MQ=255) gTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTgccg > 2:1390208/1‑150 (MQ=255) gTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTgccg > 2:1322006/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACcg > 1:509008/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACcg > 1:1627617/1‑150 (MQ=255) gAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCgcgc < 1:20158/150‑1 (MQ=255) cgcCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCtttt > 1:164878/1‑150 (MQ=255) gcCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGCTCCCGCGCCCGGCCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTc > 1:1707293/1‑150 (MQ=255) ccTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCg > 1:1096528/1‑150 (MQ=255) tGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCt < 2:1627617/150‑1 (MQ=255) aCCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAg > 1:1248760/1‑150 (MQ=255) cccccAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGtt > 2:237199/1‑150 (MQ=255) ccccAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTgcc > 2:30613/1‑125 (MQ=255) ccccAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTgcc < 1:30613/125‑1 (MQ=255) ccccGGCCCGCGCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGGGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTtgc < 2:333806/150‑1 (MQ=255) cccAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCGGGCTGCTctt < 1:1897395/107‑3 (MQ=255) cccAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCGGGCTGCTctt > 2:1897395/1‑105 (MQ=255) cccAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTtgc < 1:1390208/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTtgctg < 2:164878/150‑1 (MQ=255) aGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATGCCGCGCCCGGGTAGACGTTCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTtgctgc < 2:989825/150‑1 (MQ=255) aGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGATCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTtgctgc > 1:1454165/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTg > 1:1037817/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCgg < 2:86326/150‑1 (MQ=255) ggCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCctgc > 1:12066/1‑150 (MQ=255) ggCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCctgc < 1:173582/150‑1 (MQ=255) ccGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCctgctg < 2:1361286/150‑1 (MQ=255) ccGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCctgctg > 1:1361286/1‑150 (MQ=255) aaTCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGAAAAAAGCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCtggt < 2:1096528/150‑1 (MQ=255) tCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCtggtgg > 1:1099457/1‑150 (MQ=255) tCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCtggtgg < 2:1243499/150‑1 (MQ=255) tCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCtggtgg < 2:1099457/150‑1 (MQ=255) cccGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGc < 1:237199/150‑1 (MQ=255) gcCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGTCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTg < 2:1037817/150‑1 (MQ=255) gcCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTg < 1:191174/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAg < 2:1372978/150‑1 (MQ=255) gCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTtgctgc < 2:165234/105‑1 (MQ=255) gCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTtgctgc > 1:165234/1‑105 (MQ=255) gCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGc > 1:1020148/1‑150 (MQ=255) gtgGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGTGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTc < 2:509008/150‑1 (MQ=255) gCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTtgct > 2:852822/1‑95 (MQ=255) gCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTtgct < 1:852822/95‑1 (MQ=255) gCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCag > 1:1405390/1‑150 (MQ=255) cAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCaga < 2:508050/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGc < 2:1248760/150‑1 (MQ=255) ccgccgTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCcgcg > 2:1675519/1‑150 (MQ=255) ccgTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGAcc > 1:715805/1‑150 (MQ=255) ccgTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTAGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGAcc < 1:209783/150‑1 (MQ=255) gTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGTAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGAcccc > 1:1578729/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGACCCctct > 1:73094/1‑150 (MQ=255) tCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTc > 1:1185069/1‑61 (MQ=255) tCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTc < 2:1185069/61‑1 (MQ=255) tCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGACCCCTCTTACctgc < 1:472355/150‑1 (MQ=255) tCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTAGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGACCCCTCTTACctgc > 2:218178/1‑150 (MQ=255) ggCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGGCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGACCCCTCTTACCTgctgct < 2:1707293/150‑1 (MQ=255) acaAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGACCCCTCTTACCTGCTGCTCaa > 2:578363/1‑150 (MQ=255) acaAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGACCCCTCTTACCTGCTGCTCaa > 2:1741553/1‑150 (MQ=255) caAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGACCCCTCTTACCTGCTGCTCAAg < 1:1236948/150‑1 (MQ=255) ggagCAGCGGGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTgg < 1:1100776/97‑1 (MQ=255) ggagCAGCGGGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTgg > 2:1100776/2‑98 (MQ=255) gcCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGACCCCCCCTCCCCGCTGCTCACGGACAtgct > 2:775485/1‑150 (MQ=255) | ATCGATTTTGAGGTCAGGCCGGCATCGGTAACCAGCGAAGCGCCTGTCACCCCCCAGGCCCGCTCCGGCGAGCGGCCGAAAATCGAGATCCCGCGCCCGGGCAGTGTGGCAAAACCCGCCGTCAAGCCTGTCGAGGCACAAGAGCAGCCCGCTGCTCCGCGCCCGGCGCCGGTGCCGCCACCGCGCTTTTCGCTGCAGTTGCTGCGTGCCGGCAGTTGCCTGCTGCTGGTGGAACTGGCCACTGGTCAGCCGTTCCAGAGCCGCGACCCCTCTTACCTGCTGCTCAAGGACATGCT > NC_002947/809659‑809954 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |