Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 922,760 | G→C | 5.0% | Q91E (CAG→GAG) | PP_0803 ← | protein secretion ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 922,760 | 0 | G | C | 5.0% | 251.6 / 3.4 | 79 | Q91E (CAG→GAG) | PP_0803 | protein secretion ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/32); new base C (2/2); total (45/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 |
GGTCAGGAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCACCTCGAACCAG > NC_002947/922616‑922908 | ggtcaggAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCa < 1:1915394/150‑1 (MQ=255) gtcaggAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGTAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAg > 2:839891/1‑150 (MQ=255) gtcaggAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAg > 2:692390/1‑150 (MQ=255) ggAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCAcc < 1:1822658/150‑1 (MQ=255) gagaGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCt > 2:1242295/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCcg > 2:1128682/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCcgcg > 2:1441501/1‑150 (MQ=255) ctctCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCCCGCTGGACGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGAcc < 1:1475314/150‑1 (MQ=255) tctcCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCa > 1:375275/1‑150 (MQ=255) tctcCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCa > 2:489860/1‑150 (MQ=255) tcCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAgg > 1:1117528/1‑150 (MQ=255) tcCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAgg < 1:1060582/150‑1 (MQ=255) tcCAGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCAGGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAgg > 2:1205626/1‑150 (MQ=255) ggAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCAc > 2:515147/1‑150 (MQ=255) tCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCGGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCgg > 1:106336/1‑150 (MQ=255) tCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCgg > 1:105817/1‑150 (MQ=255) gCTTGCCGATCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTTGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGc > 2:22074/1‑150 (MQ=255) gCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCAt < 1:692390/150‑1 (MQ=255) gCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCAt < 1:1242295/150‑1 (MQ=255) cACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTgcgc < 2:443627/150‑1 (MQ=255) aCCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGcgcg > 1:1115724/1‑150 (MQ=255) ctctGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTGGGCGTGGATTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGcgac > 2:927902/1‑150 (MQ=255) tctGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAgg > 2:1024969/1‑120 (MQ=255) tctGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAgg < 1:1024969/120‑1 (MQ=255) gcctgcAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATa < 2:12664/150‑1 (MQ=255) gcctgcAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATa < 2:645837/150‑1 (MQ=255) gcctgcAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATa < 1:839891/150‑1 (MQ=255) ctgcAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCa < 2:1736823/113‑1 (MQ=255) ctgcAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCa > 1:1736823/1‑113 (MQ=255) ctgcAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATAcc < 2:1117528/150‑1 (MQ=255) gggCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGa > 1:618452/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCTGGCCCTGGCGGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGaa > 2:25437/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGTTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACAATACCGCCCTCGaa > 2:788991/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAAc < 2:1881929/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCAGGTCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCGCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAAc > 1:1454145/1‑150 (MQ=255) ccTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGcc < 2:588146/142‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGcc > 1:588146/1‑142 (MQ=255) ctggctggCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGa > 1:1356541/1‑150 (MQ=255) tggctggcCCTGGCGGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGAc < 2:106336/150‑1 (MQ=255) tggctggcCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGAc < 2:105817/150‑1 (MQ=255) tggctggcCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGAc < 1:1441501/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCt < 2:57599/99‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCt > 1:57599/1‑99 (MQ=255) cTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGATTTAACGCGACCAGGTCACCTTCGGCCCCGCCCCCCTGCGCGACAATGCCGCCCCCGAACGACTGCATGAcc > 1:798302/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTg < 2:605128/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGc > 1:1762071/1‑150 (MQ=255) gcgGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACATTAAGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTcg > 1:1453896/1‑150 (MQ=255) gCCTCGCTTTCACCCACGCTGGGAGCCGTCTTGGGCGGGCCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCCCTCGCCCAGGTCACCTTCGCCCGCGATGCTCCGACCGAGGATACCGCCCTCCAACGCCTGACGGGCCTGTTCCCGCGCACTTgca > 2:910567/1‑148 (MQ=255) ccTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGaa < 1:25437/150‑1 (MQ=255) cTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAAt > 2:1291035/1‑150 (MQ=255) cTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAAt > 1:56053/1‑150 (MQ=255) cGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGa < 1:489860/150‑1 (MQ=255) tttCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTc < 2:135438/70‑1 (MQ=255) tttCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTc > 1:135438/1‑70 (MQ=255) tttCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCt > 1:1645051/1‑150 (MQ=255) aCCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTc < 2:1800872/105‑1 (MQ=255) aCCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTc > 1:1800872/1‑105 (MQ=255) aCCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGcc > 2:1436922/1‑150 (MQ=255) cccACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGa < 2:1447357/142‑1 (MQ=255) cccACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGa > 1:1447357/1‑142 (MQ=255) cccACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCt > 1:342968/1‑150 (MQ=255) cGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGc < 2:1645051/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTg > 2:42558/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGTCCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATCCCACCCTAGCAAGAATGACTGAAGTGCTAATGCGAATTTAGGATTACTGTTTCTTTTCCGGTGGATACCTc < 2:1454145/150‑1 (MQ=255) cTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTc > 1:1198535/1‑150 (MQ=255) ttGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCCCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCCGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCg > 2:272927/1‑150 (MQ=255) tcgggtcgAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCTGCCACGCTCATCTGCGCGGCGATAACGCCCTCGAACGACTGAAATACCTGCTCTCGCGAAGTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGGGGGTACCTCGGTcg > 1:307081/1‑149 (MQ=255) tcgggtcgAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACGTTGCCTGTGCAGGTGGATAGCTCggcga > 2:1354872/1‑147 (MQ=255) tcgggtcgAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCa > 1:1038146/1‑150 (MQ=255) ctggtcgAGCGCGGCCAGGTGCTGGCCCAGCTCGACCCGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTg < 2:686452/134‑1 (MQ=37) ctggtcgAGCGCGGCCAGGTGCTGGCCCAGCTCGACCCGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTg > 1:686452/3‑136 (MQ=37) ctggtcgAGCGCGGCCAGGTGCTGGCCCAGCTCGACCATGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTcgc < 1:55183/104‑1 (MQ=25) ctggtcgAGCGCGGCCAGGTGCTGGCCCAGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTcgc > 2:55183/3‑106 (MQ=25) cgggtcgAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCGCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCAc < 2:508414/150‑1 (MQ=255) gtcgAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCg > 2:485866/1‑142 (MQ=255) gtcgAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCg < 1:485866/142‑1 (MQ=255) aGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCACCTCGAAc < 2:375275/150‑1 (MQ=255) tGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGCAAGAATGGATGGACTGCTATCACGCTCTTAGTATGCCCTATCCTGTGCCGGTGAAGACCTCGTTCACCTCGAACCAg < 2:1453896/150‑1 (MQ=255) tGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCACCTCGAACCAg < 1:1354872/150‑1 (MQ=255) | GGTCAGGAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCACCTTCGGCCACGCTCATCTGCGCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCACCTCGAACCAG > NC_002947/922616‑922908 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |