| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 944,834 | G→A | 6.8% | P264L (CCC→CTC) | PP_0806 ← | surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 944,834 | 0 | G | A | 6.8% | 216.2 / 2.9 | 73 | P264L (CCC→CTC) | PP_0806 | surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/39); new base A (2/3); total (31/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
TGCCAGCCGCGTCTGCGGCGCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAGGGTGACATCAAGGTTTT > NC_002947/944688‑944978 | tGCCAGCCGCGTCTGCGGCGCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCt < 2:525475/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCGTCTGCGGCGCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTc < 1:1148408/150‑1 (MQ=255) ccAGCCGCGTCTGCGGCGCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCg > 1:64844/1‑150 (MQ=255) aGCCGCGTCTGCGGCGCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGGCCGCACCGGCCACCGCCGTGCCCAGCAATCCGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGc > 1:1069602/1‑150 (MQ=255) aGCCGCGTCTGCGGCGCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGACGGCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGc > 1:1069343/1‑150 (MQ=255) cgTCTGCGGCGCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGTGCCGAGCCCGGCTCGAc < 2:345137/150‑1 (MQ=255) cgTCTGCGGCGCGGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTGGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGTGCCGAGCCCGGCTCGAc < 2:390460/150‑1 (MQ=255) gTCTGCGGCGCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGAcc < 1:82510/150‑1 (MQ=255) ggcgCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAg < 2:1381084/150‑1 (MQ=255) ggcgCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGAAGCGAAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAg < 1:1646571/150‑1 (MQ=255) gcgcTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAgg < 2:830030/150‑1 (MQ=255) gcgcTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAgg > 2:1678542/1‑150 (MQ=255) aTCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTa > 1:176017/1‑150 (MQ=255) aTCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGAACGCAACAAGTCAAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTa > 2:1590820/1‑150 (MQ=255) tctcCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGAc > 1:132179/1‑135 (MQ=255) tctcCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGAc < 2:132179/135‑1 (MQ=255) tcCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTAccc < 1:812327/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCt < 1:414879/150‑1 (MQ=255) cgtcgCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCAt < 2:339361/146‑1 (MQ=255) gCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTAAt < 1:544090/150‑1 (MQ=255) ccGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATa > 2:1120229/1‑150 (MQ=255) ccGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATa < 2:1457794/150‑1 (MQ=255) ccGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATa > 2:461466/1‑150 (MQ=255) ccGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATa < 1:1120229/150‑1 (MQ=255) cGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCa > 2:3870/1‑150 (MQ=255) gCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAg > 1:41940/1‑150 (MQ=255) ggCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACCACCGGTAAGGGTCCTTTCCTGCTCATTGATAGCCAggtcggtc < 1:51842/150‑1 (MQ=255) cAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAg < 1:826070/150‑1 (MQ=255) aGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGCCGGCGCCAgt > 2:702378/1‑150 (MQ=255) gggTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAgtg < 1:387956/150‑1 (MQ=255) ggTAATGCTGAACTGGCCGTCCTCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAgtgg < 1:721583/150‑1 (MQ=255) ggTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAgt < 1:1501767/148‑1 (MQ=255) ggTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAgt > 2:1501767/1‑148 (MQ=255) aTGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCa < 2:1342464/150‑1 (MQ=255) cTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGtt < 1:1678542/150‑1 (MQ=255) tGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTg > 1:332997/1‑150 (MQ=255) tGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTg < 1:3870/150‑1 (MQ=255) gCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCgg > 1:1708378/1‑150 (MQ=255) ccGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGt < 2:64844/150‑1 (MQ=255) cGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCAAAAACGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTg < 1:1590820/150‑1 (MQ=255) gTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGc < 2:1421325/150‑1 (MQ=255) ccGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACa < 2:41940/150‑1 (MQ=255) cACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGcc > 2:537161/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCga < 2:1663371/150‑1 (MQ=255) ccAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAggtcggtc < 1:1171823/98‑1 (MQ=255) ccAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAggtcggtc > 2:1171823/1‑98 (MQ=255) ccAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCg > 1:24876/1‑123 (MQ=255) ccAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCg < 2:24876/123‑1 (MQ=255) ccAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCgaga > 1:1080535/1‑150 (MQ=255) cAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGgt > 2:944787/1‑66 (MQ=255) cAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGgt < 1:944787/66‑1 (MQ=255) cAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGAc > 2:1320493/1‑150 (MQ=255) cAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTAGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGAc < 1:461466/150‑1 (MQ=255) tACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCAACACCTGTAAGGGTTTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTAcc < 1:1551973/150‑1 (MQ=255) gcCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTc > 2:1450399/1‑102 (MQ=255) gcCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTc < 1:1450399/102‑1 (MQ=255) cTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCgtcagtca > 2:380524/1‑150 (MQ=255) cGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAgg < 1:16254/150‑1 (MQ=255) cACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAGGGt < 2:281300/150‑1 (MQ=255) aCGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGCTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAGGGTg > 2:1892481/1‑150 (MQ=255) ggAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAGGGTGAc > 1:1721991/1‑150 (MQ=255) cttaccggTCGTGCCGAGCCCGGCTCGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAGGGTGAc > 1:1334334/8‑150 (MQ=255) aaaCCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCCGTCAGGGTGACAt > 1:891219/1‑150 (MQ=255) ccGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAGGGTGACATCat < 1:380524/150‑2 (MQ=255) cGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTCCCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAGGGTGACATCAAg < 1:482831/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCTCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAGGGTGACATCAAgg < 2:176017/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGcc > 2:158491/1‑111 (MQ=255) gTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGcc < 1:158491/111‑1 (MQ=255) tCGTGCCGAGCCCGGCTCGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGc < 1:977239/52‑1 (MQ=25) tCGTGCCGAGCCCGGCTCGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGc > 2:977239/1‑52 (MQ=21) aGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAGGGTGACATCAAGGtttt > 2:200564/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCg < 2:325834/83‑1 (MQ=255) gCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCg > 1:325834/1‑83 (MQ=255) | TGCCAGCCGCGTCTGCGGCGCTGATCTCCAGGGCCTGGCCGTCGCTTTGTGGCGGTTGCAGGGTAATGCTGAACTGGCCGTCCGCACCGGCCACCGCAGTGCCCAGCAATACGCCACCTGCGCCTCGCACGGAAACCGTCGAGCCGGGCTCGGCACGACCGGTAAGGGTGTTACCCTGCTCATTGATAGCCAGGTCGGTCGGCGCCAGTGGTGCAGTTGCGTCCGGTGCAGTGACAGCGCCAGGCGCCGAGACATTACCGGCGGCGTCAGTCAGGGTGACATCAAGGTTTT > NC_002947/944688‑944978 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |