| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 978,341 | C→A | 6.0% | L109M (CTG→ATG) ‡ | iscR → | DNA‑binding transcriptional regulator IscR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 978,341 | 0 | C | A | 6.0% | 213.0 / 2.3 | 67 | L109M (CTG→ATG) ‡ | iscR | DNA‑binding transcriptional regulator IscR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/29); new base A (2/2); total (36/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
GTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGACAAGATTG > NC_002947/978195‑978488 | gTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCtgt < 2:1090737/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCGGTGGCTCCCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACGATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGGCGGCGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCTGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCtgtg < 2:600767/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCtgtg < 1:535109/150‑1 (MQ=255) cccAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCaccacccgcg > 2:729281/2‑146 (MQ=255) ccAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTgtgg < 1:843952/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTgtggt < 1:1448830/150‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTgtggtg > 1:1069892/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGc < 1:1101070/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCg > 1:1233245/1‑150 (MQ=255) aGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTcagccagc < 2:1616811/150‑1 (MQ=255) cgGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCAt < 2:500630/150‑1 (MQ=255) gggCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGa > 1:952672/1‑150 (MQ=255) ggCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGaa < 1:955548/150‑1 (MQ=255) aTGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTc < 2:1069892/150‑1 (MQ=255) tGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTcc > 1:1526106/1‑150 (MQ=255) ggAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCt > 2:1064594/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTgtgg > 2:1522051/1‑106 (MQ=255) ggTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTgtgg < 1:1522051/106‑1 (MQ=255) gTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGc < 1:1230383/150‑1 (MQ=255) gACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTc < 2:1233245/150‑1 (MQ=255) gACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATCAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTc > 2:1335883/1‑150 (MQ=255) cgGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAgc < 1:1877916/150‑1 (MQ=255) gTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAgcgc > 1:751520/1‑150 (MQ=255) tCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGcc > 1:275139/1‑150 (MQ=255) cAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCg > 1:331792/1‑150 (MQ=255) caCGAGTCGGTCGCCGCCACCGGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCCTGCCGGTGATACCTGGCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATGCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGt < 2:301004/149‑1 (MQ=255) aaCGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTTATACCTGCCTGACCCACCACCTCTGGTGCGACCTCAGCCAGCACATCCATCAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGt > 2:740392/1‑150 (MQ=255) aaCGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGt > 2:92215/1‑150 (MQ=255) gAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGAt < 1:678613/150‑1 (MQ=255) ggTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCa > 2:1677264/1‑150 (MQ=255) gTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAg < 2:290138/150‑1 (MQ=255) gTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCCTCAAGCGCCGTGGTGTTCAg < 2:1368256/150‑1 (MQ=255) gTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACAGgtggtgggt > 1:246861/1‑74 (MQ=255) gTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACAGgtggtgggt < 2:246861/77‑4 (MQ=255) tCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTc > 2:1727842/1‑128 (MQ=255) tCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTc < 1:1727842/128‑1 (MQ=255) tCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAgg > 2:1884080/1‑150 (MQ=255) gcGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGCTGTCTGCCATGCCGGTGATGCCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAACCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAgg < 2:1016693/149‑1 (MQ=255) gACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCtgtg > 2:1700271/1‑68 (MQ=255) gACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCtgtg < 1:1700271/68‑1 (MQ=255) gCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACAGgtggtgg < 1:1187263/69‑2 (MQ=255) gCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACAGgtggtgg > 2:1187263/1‑68 (MQ=255) gCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGATGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTc > 1:1187787/1‑150 (MQ=255) cACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGc > 1:1677602/1‑150 (MQ=255) cccGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGccc > 1:196917/1‑150 (MQ=255) tGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGGGCGCCCTCAGCCAGCAGGTCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGCTGTACGGGAAGTCGCCCAgcgc > 1:1038248/1‑150 (MQ=255) ccAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGc < 1:136683/141‑1 (MQ=255) ccAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGc > 2:136683/1‑141 (MQ=255) ggggCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGa < 1:1653699/150‑1 (MQ=255) ggCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGAcc < 1:1677264/150‑1 (MQ=255) tGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCg > 1:1494220/1‑150 (MQ=255) gACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCgt < 1:1587849/150‑1 (MQ=255) gACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCgt > 1:1560084/1‑150 (MQ=255) tGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTc > 1:350960/1‑150 (MQ=255) ccATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGTCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGc < 2:1835822/150‑1 (MQ=255) cATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCa > 1:1778376/1‑150 (MQ=255) cGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACg > 2:940636/1‑150 (MQ=255) gTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAg > 2:592655/1‑111 (MQ=255) gTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAg < 1:592655/111‑1 (MQ=255) aCCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGcc > 1:1449575/1‑150 (MQ=255) ctgcctgACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCa > 1:263133/1‑150 (MQ=255) tgACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTgg > 1:1863191/1‑150 (MQ=255) gACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGa > 1:867186/1‑150 (MQ=255) ccaccaCCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCCGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAAGCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTTGAAGGACGAACCGCCCCGCTGAACaa > 1:218420/1‑150 (MQ=255) ccaccaCCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGAt < 1:914475/85‑1 (MQ=255) ccaccaCCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGAt > 2:914475/1‑85 (MQ=255) ccaccaCCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGACaa < 1:214718/150‑1 (MQ=255) caccacCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGACAAg > 2:824768/1‑150 (MQ=255) accaccTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGACAAGa < 1:824768/150‑1 (MQ=255) caccTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGACAAGAtt < 2:1449575/150‑1 (MQ=255) accTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCCGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGACAAGATTg < 1:1884080/150‑1 (MQ=255) accTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGACAAGATTg > 2:1876716/1‑150 (MQ=255) accTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGAAAGTCGCCCAGCGCAAGGACCTCCGCCGTGTCGCAGGCGGAACCGCCCAGCTGGACAAGATTg > 1:676369/1‑150 (MQ=255) cTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGACAAGAtt < 2:1147158/147‑1 (MQ=255) cTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGACAAGAtt > 1:1147158/1‑147 (MQ=255) | GTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCGGTGATACCTGCCTGACCCACCACCTGTGGTGCGACCTCAGCCAGCAGATCCATGAATTCCTCAGCGGCATAAGCCTGGCCGACCTCGTCAAGCGCCGTGATGTGCAGGAAGTCGCCCAGCGCCAGGACCTGCGCCGTGTCGCAGGACGAACCGCCCAGCTGGACAAGATTG > NC_002947/978195‑978488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |