Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,134,095 | A→T | 5.3% | intergenic (+34/+44) | PP_0995 → / ← gltS | membrane protein/glutamate:sodium symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,134,095 | 0 | A | T | 5.3% | 234.2 / 2.3 | 77 | intergenic (+34/+44) | PP_0995/gltS | membrane protein/glutamate:sodium symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/31); new base T (2/2); total (43/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
CCTGCATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAGGCGAG > NC_002947/1133950‑1134243 | cctgcATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGtt < 2:625099/150‑1 (MQ=255) tgcATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCt > 2:314767/1‑150 (MQ=255) cATTGCCGGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGTCGTTCTGa < 1:446286/150‑1 (MQ=255) cATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGa < 1:853708/150‑1 (MQ=255) ggtGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTAGGGTGTGCGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGTCGTTCTGag < 2:1259309/148‑2 (MQ=255) gCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCGGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGAttgc < 1:96771/150‑1 (MQ=255) ccGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGa < 2:1883503/144‑1 (MQ=255) ccGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGa > 1:1883503/1‑144 (MQ=255) gAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGcc < 1:314767/150‑1 (MQ=255) tGGGCGTGCAGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGAttg < 2:1777376/140‑1 (MQ=255) tGGGCGTGCAGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGAttg > 1:1777376/1‑140 (MQ=255) gCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTcaca < 2:1351590/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCATAGGTTCGt < 1:731476/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGt < 1:1064852/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGt < 1:509632/150‑1 (MQ=255) gggTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGc < 2:726929/135‑1 (MQ=255) gggTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGc > 1:726929/1‑135 (MQ=255) gggTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGa < 1:226156/150‑1 (MQ=255) tgtgtgGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGAttgcttgc > 1:1847636/1‑126 (MQ=255) tgtgtgGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGAttgcttgc < 2:1847636/126‑1 (MQ=255) gtgtgGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCAACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTc < 1:528515/150‑1 (MQ=255) gtgGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGc > 2:121519/1‑150 (MQ=255) tgGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCt > 2:289495/1‑150 (MQ=255) gTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTa > 2:1315196/1‑150 (MQ=255) aTGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAAc < 1:997240/150‑1 (MQ=255) aTGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAAc < 2:249860/150‑1 (MQ=255) tCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCg > 1:552070/1‑150 (MQ=255) tCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGcaa > 2:904494/1‑150 (MQ=255) gCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTTTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTTGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCa < 1:142640/150‑1 (MQ=255) gCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCa > 1:897706/1‑150 (MQ=255) tCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGt > 2:323023/1‑122 (MQ=255) tCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGt < 1:323023/122‑1 (MQ=255) tCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAg < 2:566564/150‑1 (MQ=255) tCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAg < 1:1324712/150‑1 (MQ=255) cGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCACAAAACCAAgg < 2:552070/150‑1 (MQ=255) ccGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAAt < 1:1315196/150‑1 (MQ=255) ccGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAAt > 1:55898/1‑150 (MQ=255) ccGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCGTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAAt > 2:773896/1‑150 (MQ=255) gACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGAAATGc > 2:1241068/1‑150 (MQ=255) aCGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGtt > 2:1416563/1‑111 (MQ=255) aCGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGtt < 1:1416563/111‑1 (MQ=255) ggTACTCGGTGCCTGGTGGGGCACCCGCCTGCTGCGTCGGTAGGCTGTACAGACCGGCCCCACTCTACTCACAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCCCGCTCCACAGGTTCGTTACCTCGCTTAACCCGCAGCACACCAAGGCAATGCCAg > 2:266864/1‑150 (MQ=255) tACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCATGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGt > 2:694028/1‑150 (MQ=255) cTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTACGTGACCTCGCTTAAcc > 2:567344/1‑122 (MQ=255) cTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTACGTGACCTCGCTTAAcc < 1:567344/122‑1 (MQ=255) tCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACaaa < 2:395061/130‑1 (MQ=255) tCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACaaa > 1:395061/1‑130 (MQ=255) ccTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACATCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGa > 1:109126/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGAt > 1:860189/1‑150 (MQ=255) tggtggGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTGGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAACCCAAGGCAATGCCAGGTACAGTTTGATc > 1:466105/1‑150 (MQ=255) tggtggGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATc > 2:705786/1‑150 (MQ=255) ggtggGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCa > 2:257541/1‑150 (MQ=255) gCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGa < 2:1292255/150‑1 (MQ=255) ccGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACAtt > 2:1674222/1‑150 (MQ=255) tgcGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGc > 1:1901930/1‑88 (MQ=255) tgcGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGc < 2:1901930/88‑1 (MQ=255) cGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCg > 1:1751918/1‑150 (MQ=255) gTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGACATGTTTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGa < 1:496196/150‑1 (MQ=255) gTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGa > 1:487724/1‑150 (MQ=255) ggCTGTACCGGCAGTCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATgaagaa > 2:559956/1‑150 (MQ=255) cTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCTATGAAGAACg > 2:334535/1‑150 (MQ=255) tGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAgcgc > 2:1115527/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGccccc > 2:127607/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATtga > 1:110560/1‑124 (MQ=255) gCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATtga < 2:110560/124‑1 (MQ=255) ggCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATc < 2:1916128/150‑1 (MQ=255) cccACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTAATTACCATGAAACTGAGGATTGCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGc > 1:1866572/1‑150 (MQ=255) cccACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAACTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGc > 1:800174/1‑150 (MQ=255) aCGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCGCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGAAGTCATTGATGATGTCGATGAAGAAGGCCCGCACCATCGGcacc > 1:585702/1‑150 (MQ=255) gCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGcaccac > 2:1720978/1‑150 (MQ=255) gCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGcaccac > 2:746461/1‑150 (MQ=255) aatCAGAACGTCGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCAccaccaa > 2:479126/3‑149 (MQ=255) aCTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAg > 2:1301673/1‑150 (MQ=255) tCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACa < 1:1338397/104‑1 (MQ=255) tCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACa > 2:1338397/1‑104 (MQ=255) cAGAACGTCGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGaa > 2:489300/1‑150 (MQ=255) aGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAg < 1:121519/150‑1 (MQ=255) acgacgTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGTTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAGGCg < 1:127607/150‑1 (MQ=255) gacgTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCGCCTATCATCGGCTTCCCCCGGAAGGCGAg < 2:550802/150‑1 (MQ=255) acgTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAgg < 2:1805500/65‑1 (MQ=255) acgTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAgg > 1:1805500/1‑65 (MQ=255) | CCTGCATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAGGCGAG > NC_002947/1133950‑1134243 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |