| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,310,449 | G→C | 7.9% | L364V (CTG→GTG) | PP_1144 ← | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,310,449 | 0 | G | C | 7.9% | 214.6 / 8.1 | 72 | L364V (CTG→GTG) | PP_1144 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/37); new base C (4/2); total (33/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.51e-01 | |||||||||||
GATGCTGGTGGTCATGACCATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGACAGCCAGGCGGTTTTCGCTGGCCTGATGT > NC_002947/1310300‑1310597 | gATGCTGGTGGTCATGACAATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAg < 2:514653/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGGTCATGACCATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAgg > 2:482690/1‑150 (MQ=255) gtggtCATGACCATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCCGGCTGGTGGCCACGAGCCACGGTGCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑gg > 1:1373889/1‑150 (MQ=255) gtggtCATGACCATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCAGGCAGAACTCGGCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑gg > 1:1349178/1‑150 (MQ=255) gtggtCATGACCATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGATGGGGTCTATAATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGAGGTTTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑gg < 1:890548/150‑1 (MQ=255) tCATGACCATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCACGACCT‑GGTTGc < 2:53710/150‑1 (MQ=255) aTGACCCTGCGCAGCCCGCCCAGGTCGGTGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCCCGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTCGTTACGAAACAGAACTCGTCGCCACCACAGCGCGCAACTCCGTCGT‑GGTTGCgg > 2:530613/1‑150 (MQ=255) aTGACCATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGCTGGGGTCGTTCATCCGTTGCATGGTGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCACCCAGGTCGG‑GGTTGCgg > 2:549523/1‑150 (MQ=255) aTGACCATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGATGGGGTCTTTCTTCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCGCCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCgg < 2:1118048/150‑1 (MQ=255) aTGACCATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGGCGT‑GGGTGCgg > 2:1384569/1‑150 (MQ=255) gcccgcccAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCACGACCT‑GGTTGCgc < 1:638825/137‑2 (MQ=255) gcccgcccAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCACGACCT‑GGTTGCgc > 2:638825/1‑136 (MQ=255) cccgcccAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGAt < 1:823939/150‑1 (MQ=255) cccgcccAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTGCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCTACCAAGGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGAt < 1:549523/150‑1 (MQ=255) ccgcccAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGAtg > 2:1480598/1‑150 (MQ=255) gcccAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGAtgtg < 1:267410/150‑1 (MQ=255) gcccAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGAtgtg < 1:319258/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGt > 1:22877/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGtt < 1:482690/150‑1 (MQ=255) gTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTCTTTGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGc < 1:1485076/150‑1 (MQ=255) tCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGAGGGTAGCGGCATTGATGTGGTTGGCg > 1:1898906/1‑150 (MQ=255) cGATGGGGGCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGa < 1:565648/150‑1 (MQ=255) gATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGAt < 2:128227/150‑1 (MQ=255) gTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCtt > 1:1479721/1‑150 (MQ=255) gTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCtt < 1:570597/150‑1 (MQ=255) tttCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGag > 1:1358351/1‑150 (MQ=255) tttCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAG‑GCTGAAGAGCATCCTAGGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGag > 2:1483604/1‑150 (MQ=255) tCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGagca > 2:1465322/1‑150 (MQ=255) aTCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGAGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGagcagc > 1:1760136/1‑150 (MQ=255) tCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCt > 1:250945/1‑150 (MQ=255) tCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCt > 1:1441345/1‑150 (MQ=255) cGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCg > 2:153722/1‑150 (MQ=255) gCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCAc < 1:1414187/150‑1 (MQ=255) cATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCAcc < 1:1121273/150‑1 (MQ=255) atgatgCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCg > 2:1037471/1‑150 (MQ=255) atgatgCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGAGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCg < 2:1760136/150‑1 (MQ=255) gcTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGTGCGCAACCAgg < 1:1449944/83‑1 (MQ=255) gcTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGTGCGCAACCAgg > 2:1449944/1‑83 (MQ=255) gcTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTc > 2:1489535/1‑136 (MQ=255) gcTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTc < 1:1489535/136‑1 (MQ=255) gcTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGAGGTTGGCGATCACCGTGAGCATCGCGTCACCGGcgtcgt > 1:746182/1‑150 (MQ=255) aGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAgg < 1:1384569/150‑1 (MQ=255) aGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAgg < 2:1373889/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCgg < 1:1324081/76‑1 (MQ=255) ttCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCgg > 2:1324081/1‑76 (MQ=255) gcgGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCtt > 1:1660115/1‑150 (MQ=255) ggCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCa > 1:1777841/1‑113 (MQ=255) ggCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCa < 2:1777841/113‑1 (MQ=255) ggCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGa > 1:847868/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGaaa < 2:847868/150‑1 (MQ=255) gTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATg < 2:250945/150‑1 (MQ=255) ttCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATgg < 1:153722/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGAt > 1:1855283/1‑150 (MQ=255) cTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATg > 1:1511967/1‑150 (MQ=255) tGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAGCCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGt > 2:1600682/1‑150 (MQ=255) ggTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTc < 1:164876/150‑1 (MQ=255) aCCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTg < 1:1846124/132‑1 (MQ=255) aCCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTg > 2:1846124/1‑132 (MQ=255) aCCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAgg < 1:1252670/150‑1 (MQ=255) cacacaGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCtt > 1:730736/1‑81 (MQ=255) cacacaGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCtt < 2:730736/81‑1 (MQ=255) acacaGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGt > 2:1479891/1‑136 (MQ=255) acacaGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGt < 1:1479891/136‑1 (MQ=255) cacaGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACa > 2:109972/1‑150 (MQ=255) aGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGa < 2:1368811/150‑1 (MQ=255) aGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGa < 2:822001/150‑1 (MQ=255) cTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGACAGc < 2:1479721/150‑1 (MQ=255) ccaccaAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAAc < 1:1111520/135‑1 (MQ=255) ccaccaAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAAc > 2:1111520/1‑135 (MQ=255) caAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGACAGCCAGGCGGtttt < 1:1282975/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGACAGCCAGGCGGTTTTCGCt < 2:22877/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGCTGGCGATCACCTTGAGCAGATCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGACAGCCAGGCGGTTTTCGCt < 2:452799/150‑1 (MQ=255) cgcgcAACCAGGTCGT‑GGGTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGACAGCCAGGCGGTTTTCGCTg < 2:1443905/150‑1 (MQ=255) cgcAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGACAGCCAGGCGGTTTTCGCTGGc < 2:156549/150‑1 (MQ=255) cgcAACCACGACCT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGACAGCCAGGCGGTTTTCGCTGGc > 1:1158777/1‑150 (MQ=255) aGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGACAGCCAGGCGGTTTTCGCTGGCCTGATGt < 2:1430016/150‑1 (MQ=255) ggTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCtt < 2:1830143/46‑1 (MQ=255) ggTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCtt > 1:1830143/1‑46 (MQ=255) | GATGCTGGTGGTCATGACCATGCGCCGCCCGCCCAGGTCGATGGGGTCTTTCATCCGTTGCATGATGCGCTGGGCCAGGTGGCGGGCTTCGTCGCGGCTGTTCAGGCTGGTGACCACACAGAACTCGTCGCCACCAAAGCGCGCAACCAGGTCGT‑GGTTGCGGGTAGCGGCCTTGATGTGGTTGGCGATCACCTTGAGCAGCTCGTCACCGGCGTCGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATACGCTTGAAATGGTCGATGTCGAGGAACATGACAGCCAGGCGGTTTTCGCTGGCCTGATGT > NC_002947/1310300‑1310597 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |