Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,693,834 | C→G | 6.9% | R87R (CGC→CGG) ‡ | PP_1489 → | CheW domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,693,834 | 0 | C | G | 6.9% | 270.0 / 10.2 | 87 | R87R (CGC→CGG) ‡ | PP_1489 | CheW domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/40); new base G (3/3); total (44/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.39e-01 |
AAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGC > NC_002947/1693686‑1693983 | aaGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCACCCATGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGcc > 1:627826/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCctggtg > 2:1333248/1‑150 (MQ=255) ccGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGTCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCAGGcgggtgctg < 2:59224/150‑1 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTTCAACGCACCA‑GCACCAGGcgggtgctgg < 1:572015/150‑1 (MQ=255) gcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCAGGcgggtgctggt < 2:1515064/150‑1 (MQ=255) cgtgcacGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCtggtgctggtgc < 2:372781/144‑1 (MQ=255) gCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTa > 1:723924/1‑150 (MQ=255) gCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCg < 1:954886/150‑1 (MQ=255) cTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGa > 2:1217047/1‑150 (MQ=255) tCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAg > 2:803529/1‑150 (MQ=255) tCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAg < 1:94276/150‑1 (MQ=255) tCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAg > 2:803613/1‑150 (MQ=255) tCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATAACGTTTGC‑CGCCTTGAACTTTGGCCAGCAAGTCGGCAAAGTCATCA‑GGATCGGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAg > 1:424364/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTa > 1:860116/1‑143 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTa < 2:860116/143‑1 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggc > 2:1143539/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggc > 2:711642/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggc > 1:734878/1‑150 (MQ=255) aggcggtCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGACTTCTCGCACATCGTTGCTAGCTGGTTCCGGTCCAC‑ACCAGGCGCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggcg < 1:424945/144‑1 (MQ=255) aGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggcg < 1:830909/150‑1 (MQ=255) gATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCt < 1:24676/150‑1 (MQ=255) gATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCt > 2:1170074/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAg > 1:434185/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAg < 1:1324550/150‑1 (MQ=255) ctaGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCt > 1:141816/3‑150 (MQ=255) ccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGcc > 2:981805/1‑149 (MQ=255) ccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCt > 1:589214/1‑150 (MQ=255) cAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCtt < 1:315500/150‑1 (MQ=255) aGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTg < 1:1217047/150‑1 (MQ=255) gCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGc < 1:803613/150‑1 (MQ=255) gCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGc < 1:803529/150‑1 (MQ=255) gcctgGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGATAGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATc < 1:628207/150‑1 (MQ=255) gggTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTgg > 1:1392265/1‑150 (MQ=255) ggTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGcc > 1:1331619/1‑101 (MQ=255) ggTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGcc < 2:1331619/101‑1 (MQ=255) gcgGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCTCCTCAGCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAg < 2:627826/150‑1 (MQ=255) gcgGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑AGCCTTGACATTTTGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAg > 1:232765/1‑150 (MQ=255) gggAATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGc < 1:968938/150‑1 (MQ=255) ggCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGcc > 1:234977/1‑150 (MQ=255) 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aTCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGc < 2:1571484/150‑1 (MQ=255) aTCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCCACCATCC‑AGCCCAACGCCGGCGGCAGGGGGCGGTGCAACGCAAAG‑GCATTCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGc < 1:1867417/150‑1 (MQ=255) cGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGt < 2:889909/150‑1 (MQ=255) gTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGtt < 2:1659678/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTg < 1:1143539/150‑1 (MQ=255) gggtCCGGTCATCGACCGTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGa < 2:722434/147‑1 (MQ=255) gTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGAc < 2:234977/150‑1 (MQ=255) ttCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACg > 1:1215295/1‑150 (MQ=255) ccGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCACCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAACCTCCCATTATCCTGGATCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAg < 1:516084/150‑1 (MQ=255) ggTCATTGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAA‑GCGTCATTGACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTTGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCAAAACCCTGCGATGCCAACCGGCCGAGtt > 1:987421/1‑150 (MQ=255) 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tGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATgg > 2:1546532/1‑150 (MQ=255) gccTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTg > 1:413745/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGTACTACCGAGGCGGCCTGc > 2:1546518/1‑74 (MQ=255) cTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGTACTACCGAGGCGGCCTGc < 1:1546518/74‑1 (MQ=255) cTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGa < 1:1418655/150‑1 (MQ=255) tGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGaca < 2:1392265/150‑1 (MQ=255) 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cAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgcg > 2:517956/1‑150 (MQ=255) aGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATggg < 2:242480/131‑1 (MQ=255) aGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATggg > 1:242480/1‑131 (MQ=255) aGCCCGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTCTGGGGTGGACACAGGCGATgcgc < 2:947351/150‑1 (MQ=255) tGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGGTTAGTCTGAGGCTGTAGTATGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTgg < 1:1170074/150‑1 (MQ=255) cAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGc < 2:434185/150‑1 (MQ=255) agtgcacca‑gcaccaGGCGGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAATCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGcc > 1:428990/4‑150 (MQ=255) aCGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGccc > 1:1448728/1‑150 (MQ=255) aCGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGccc > 1:872433/1‑150 (MQ=255) aCGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGccc < 1:667113/150‑1 (MQ=255) aCCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTCAGGGGGCGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTg > 2:1589763/1‑150 (MQ=255) aCCA‑GCACCAGGCGGGTGCTGGTGCGCTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCCGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCACCATTGGGGGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTg > 1:1644835/1‑150 (MQ=255) ccA‑GCACCAGGCGGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTgc > 1:1710817/1‑150 (MQ=255) cA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTgcg > 1:1172083/1‑150 (MQ=255) aCCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAg < 2:734878/150‑1 (MQ=255) ccGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGa > 1:179178/1‑150 (MQ=255) ccGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGa > 1:1606059/1‑150 (MQ=255) cGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGAt < 2:424364/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCTTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGc < 1:1333248/150‑1 (MQ=255) | AAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGC‑CGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCA‑GCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGC > NC_002947/1693686‑1693983 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |