| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,695,065 | G→A | 5.3% | R330Q (CGG→CAG) | wspC → | biofilm formation methyltransferase WspC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,695,065 | 0 | G | A | 5.3% | 284.5 / 4.3 | 95 | R330Q (CGG→CAG) | wspC | biofilm formation methyltransferase WspC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/46); new base A (2/3); total (46/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.90e-01 | |||||||||||
TGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCG > NC_002947/1694916‑1695212 | tgcgtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGCGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCg > 2:592790/1‑150 (MQ=255) cgtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGGTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGGCAGGTACCCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGc > 1:1077852/1‑150 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt < 1:1458849/150‑1 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt < 1:655205/150‑1 (MQ=255) tCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTgg > 1:739919/1‑150 (MQ=255) acgacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTGGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGcc > 1:863547/1‑150 (MQ=255) gacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCaa < 2:1660758/150‑1 (MQ=255) acgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAAt < 1:92656/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCg < 2:234414/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCg < 2:444657/150‑1 (MQ=255) gCCCGCACCGGTTTATCCGCGGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGTGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGGGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCgg < 2:139821/150‑1 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 1:1195837/1‑150 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 2:325963/1‑150 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 2:1292887/1‑150 (MQ=255) cGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGGGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGACCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCggcca < 2:90468/150‑4 (MQ=255) cACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCa < 1:325963/150‑1 (MQ=255) cACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCa < 1:760349/150‑1 (MQ=255) ggTTGATCCGCAGCCCAGTGTGGCGTGGCTTCGTTCGTGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGa < 1:630518/150‑1 (MQ=255) tCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGc > 1:832798/1‑150 (MQ=255) tCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGc < 2:1077659/150‑1 (MQ=255) cGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCATAGAGTGGGCCAGCGAGTTGCTTGCCGGCATTACCCCGCTGGCCAATCCCGATGGCAGCGGGCAGGccc > 1:594666/1‑150 (MQ=255) gCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGc > 1:863717/1‑119 (MQ=255) gCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGAGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGc < 2:863717/119‑1 (MQ=255) cccAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGc > 1:160472/1‑150 (MQ=255) cccAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCCCGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGc < 1:1787721/150‑1 (MQ=255) cAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCg < 1:1411561/111‑1 (MQ=255) cAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCg > 2:1411561/1‑111 (MQ=255) aGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGaa < 1:641432/150‑1 (MQ=255) gtgtGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAg > 2:946551/1‑137 (MQ=255) gtgtGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAg < 1:946551/137‑1 (MQ=255) cGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc < 2:1871806/150‑1 (MQ=255) ttGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGGGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGc > 2:1528866/1‑150 (MQ=255) ccTCGTTCGCGGCGTGTGGTGCCGGTGGCGGCCAGCCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCGAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGTGGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAc < 1:446403/150‑1 (MQ=255) ccTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTat < 2:807551/150‑2 (MQ=255) ccTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAc > 2:776900/1‑150 (MQ=255) cTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAcc > 1:1044387/1‑150 (MQ=255) cggTTCGCGGCGTGCGCTGCCGGCAGCGGCACGGAGAGCGAGAGCCAGCGCGCACACCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAccc < 2:863547/148‑2 (MQ=255) gTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCGGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑a < 2:303148/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑Ag > 2:1086283/1‑150 (MQ=255) gcggcgTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCa < 2:1077852/150‑1 (MQ=255) gcggcgTGTGCTCACGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCa > 2:1662400/1‑150 (MQ=255) gcgTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTa > 1:1650492/1‑150 (MQ=255) tgtgCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCGGTAccc < 2:160472/150‑1 (MQ=255) tgctgcCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACccgc > 1:1409586/1‑150 (MQ=255) gctgcCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGTGGCCAGCGGGTGCCTGGCCGGGATTGCCCGGCTGGCCAATGCTGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAACGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACccgcc < 2:997798/150‑1 (MQ=255) tgcCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGt > 1:1325535/1‑150 (MQ=255) tgcCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGt > 2:165343/1‑150 (MQ=255) gTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGca > 1:818079/1‑150 (MQ=255) gTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGca < 1:845140/150‑1 (MQ=255) gcggcCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGACCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAg > 1:1101878/1‑150 (MQ=255) caggccagAGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCGGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGta > 2:784929/1‑150 (MQ=255) gccagCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGtacta > 2:441422/1‑150 (MQ=255) gacagCCCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCCGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATTCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACATGTGtacta < 2:594666/148‑1 (MQ=255) ccagCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGtactac < 1:985825/150‑1 (MQ=255) agCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActg < 2:1044387/150‑1 (MQ=255) gcgcGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActgg < 2:13204/150‑1 (MQ=255) gcgcGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActgg > 2:391237/1‑150 (MQ=255) gcgAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCTAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggct > 1:1800530/1‑150 (MQ=255) gcgAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggct < 2:1217801/150‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGTACAGGTGTACTActggctgg < 1:1086283/150‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggctgg < 1:1240147/150‑1 (MQ=255) ccGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATTCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGttt > 1:1878632/1‑150 (MQ=255) cgcgAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggctg < 1:1433369/144‑1 (MQ=255) cgcgAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggctg > 2:1433369/1‑144 (MQ=255) cgcgAGCACAGCCACGAGGGCGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTg > 2:644931/1‑150 (MQ=255) gcgAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGGAGGCCCGTAGCGAATGCC‑ACGAACGCGGTTGGTATTGCCCGCCGGCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGc > 1:1868429/1‑150 (MQ=255) aGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCa < 2:832798/150‑1 (MQ=255) cacaGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGt > 1:518131/1‑150 (MQ=255) acaGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTTCCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTg > 1:1252605/1‑150 (MQ=255) gCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCTCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATa < 1:376176/150‑1 (MQ=255) gCCACGAGGGCGCCAGCGAGTGGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATa < 2:640262/150‑1 (MQ=255) aCGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCg > 2:1740745/1‑150 (MQ=255) gAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACNGaa < 2:1195837/150‑1 (MQ=255) gAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGaa < 1:1528866/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGAt < 1:391237/150‑1 (MQ=255) aGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgcg > 2:1750930/1‑150 (MQ=255) gCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgcgc < 1:441422/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCgcagcg > 1:567074/1‑149 (MQ=255) tGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAgg > 2:1142454/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgc > 2:44641/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGncgc < 2:1194946/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc > 2:736637/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc < 2:1135367/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGCATGGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc < 2:597298/150‑1 (MQ=255) gcaccGGCATTGGCCAGCCGGACAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTGGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc > 2:393797/4‑150 (MQ=255) gCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTg > 2:1593612/1‑150 (MQ=255) gCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTg > 1:1534747/1‑150 (MQ=255) cGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAg < 2:1593754/150‑1 (MQ=255) cGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGATCACTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAg > 2:150654/1‑150 (MQ=255) ggCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc < 1:1431022/58‑1 (MQ=18) ggCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc > 2:1431022/1‑58 (MQ=18) ggCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGc < 1:165343/150‑1 (MQ=255) cccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATc < 1:1243301/150‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggctgg < 2:1706619/98‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggctgg > 1:1706619/1‑98 (MQ=255) ccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATAc < 2:439934/114‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATAc > 1:439934/1‑114 (MQ=255) ccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCg > 1:1770774/1‑150 (MQ=255) | TGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTG‑AGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCG > NC_002947/1694916‑1695212 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |