Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,724,495 | T→A | 9.5% | intergenic (+20/+29) | PP_1517 → / ← PP_1518 | RND family transporter/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,724,495 | 0 | T | A | 9.5% | 272.9 / 15.4 | 94 | intergenic (+20/+29) | PP_1517/PP_1518 | RND family transporter/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/44); new base A (6/3); total (47/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.45e-01 |
GCGTAGTGTGTTCTACGGGCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAGCGCCTTCTCGGTCAC > NC_002947/1724352‑1724643 | gcgTAGTGTGTTCTACGGGCCGCTGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGccct < 1:942555/150‑1 (MQ=255) cgTAGTGTGTTCTACGGGCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGccctc < 1:320608/150‑1 (MQ=255) tgtgtTCTACGGGCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTAAGccctcccc > 1:411841/1‑147 (MQ=255) tgtgtTCTACGGGCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTAAGccctcccc < 2:411841/148‑2 (MQ=255) tgtTCTACGGGCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTcgc < 1:1155344/150‑1 (MQ=255) ttCTACGGGCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGATGGCTTAGCCCTCCCTTCGCgg > 1:1234603/1‑150 (MQ=255) tACGGGCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTa > 1:394601/1‑150 (MQ=255) aCGGGCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTaa < 1:1007062/150‑1 (MQ=255) gCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAAccc > 2:375997/1‑150 (MQ=255) gCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAAccc < 1:259380/150‑1 (MQ=255) cGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:803158/150‑1 (MQ=255) cGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:682184/150‑1 (MQ=255) gATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCATGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGGGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCt > 2:263197/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 1:131176/150‑1 (MQ=255) gTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 1:787305/1‑150 (MQ=255) gatgatGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgcgcgc > 2:1185387/1‑150 (MQ=255) gATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAATGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgcgggc > 1:256669/1‑150 (MQ=255) gATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGATTAGCCCGCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgcgcgc > 2:1589674/1‑150 (MQ=255) gATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGCTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgcgcgc > 2:111522/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGaa < 1:1442098/150‑1 (MQ=255) aTGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGaa < 1:1459740/150‑1 (MQ=255) ggcTGATCGTGGCGACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACcttc < 1:708555/150‑1 (MQ=255) gcTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAACGCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACcttct > 1:1367290/1‑150 (MQ=255) tGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTg < 2:703604/150‑1 (MQ=255) tGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTg < 1:196192/150‑1 (MQ=255) tGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTg < 1:1513301/150‑1 (MQ=255) tGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGATGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTg > 2:913262/1‑150 (MQ=255) tGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTCCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTg < 1:74547/150‑1 (MQ=255) gATCGTGGCCACGGTGCTGACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTgg < 1:1688281/150‑1 (MQ=255) tCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGcc > 1:769842/1‑150 (MQ=255) ggCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGc < 1:180187/150‑1 (MQ=255) ccACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGTTCTTCCTTCGAGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAATACCTTCTTGGCCAGGCTg < 2:367031/150‑1 (MQ=255) ccACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTg < 1:260751/150‑1 (MQ=255) cACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTAAGccctccccctgc < 2:1070161/101‑6 (MQ=255) cACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTAAGccatccccctgc > 1:1070161/1‑96 (MQ=255) aCGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGc < 1:1569794/89‑1 (MQ=255) aCGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGc > 2:1569794/1‑89 (MQ=255) ggTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAg > 2:401412/1‑150 (MQ=255) gTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAgc < 2:711257/150‑1 (MQ=255) gTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCACGGCTGGTAgc > 1:80594/1‑150 (MQ=255) cTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAgccgc > 1:1872042/1‑150 (MQ=255) tACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGccgccg > 2:145172/1‑150 (MQ=255) acTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTa < 1:499377/140‑1 (MQ=255) acTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTa > 2:499377/1‑140 (MQ=255) acTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACATTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTg > 1:1506211/1‑150 (MQ=255) tgctgTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGcc > 1:1388322/1‑150 (MQ=255) tgctgTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGATCCTACTGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGTCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGcc < 2:885298/150‑1 (MQ=255) ctgTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCgg < 1:145172/150‑1 (MQ=255) tgTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCggg < 2:769842/150‑1 (MQ=255) tgTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCggg > 2:1449533/1‑150 (MQ=255) cTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTg < 2:587456/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGCAGGAGGGCTGCAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTgg < 2:394601/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTgg > 1:487029/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGaa > 1:508931/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGaa < 1:473915/150‑1 (MQ=255) gCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAAt < 2:80594/150‑1 (MQ=255) 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tGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGcc > 2:1698918/1‑150 (MQ=255) gAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCa < 2:316069/150‑1 (MQ=255) ggCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATcc > 1:300761/1‑150 (MQ=255) ccgcgaagggAGGGCTAAGCCCTCCCCTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAg > 1:1838391/8‑150 (MQ=255) gCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAgc > 2:87817/1‑82 (MQ=255) gCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAgc < 1:87817/82‑1 (MQ=255) gCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAgcg > 2:1780895/1‑150 (MQ=255) gCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAgcg > 2:571236/1‑150 (MQ=255) aGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAGCGcc > 1:1274703/1‑150 (MQ=255) gggAGGGCTAAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAGCGCCTtc > 1:886062/1‑150 (MQ=255) ggAGGGCTAAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATg < 2:1779698/101‑1 (MQ=255) ggAGGGCTAAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATg > 1:1779698/1‑101 (MQ=255) ggAGGGCTAAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAAGCCATCCAGCGCCTtct > 1:386303/1‑150 (MQ=255) aGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAGCGCCTTCTCg < 1:1780895/150‑1 (MQ=255) gggCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAGCGCCTTCTCgg < 1:375997/150‑1 (MQ=255) gCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAGCGCCTTCTCGGTc < 2:1705693/150‑1 (MQ=255) ttAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAGCGCCTTCTCGGTCAc > 2:1814187/1‑150 (MQ=255) | GCGTAGTGTGTTCTACGGGCCGATGGCGGTGGCGATCATGGGCGGGCTGATCGTGGCCACGGTGCTTACACTGCTGTTCCTGCCGGCGTTGTATGCGGCGTGGTTCAGGGTGAAGAAGGGCTGAAGGCCGCAGGGGGAGGGCTTAGCCCTCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGCGCCGAAGACCTTCTTGGCCAGGCTGGTAGCCGCCGCTGCCGGGTTCTGGCGAATGTTCTGCTCCTGTTTGCCGATCATCTCGAACAGGCCATCCAGCGCCTTCTCGGTCAC > NC_002947/1724352‑1724643 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |