| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,741,977 | C→G | 7.4% | intergenic (‑23/+61) | PP_1538 ← / ← PP_1539 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,741,977 | 0 | C | G | 7.4% | 290.5 / 13.1 | 95 | intergenic (‑23/+61) | PP_1538/PP_1539 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/42); new base G (3/4); total (49/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
GTGACTGAAGAGGGAAAGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTCGAACCTTCCG > NC_002947/1741836‑1742119 | gTGACTGAAGAGGGAAAGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCGATATGGCGGCaaa < 2:1311864/150‑3 (MQ=255)gTGACTGAAGAGGGAAAGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCGATATGGCGGCaaa < 2:1692706/150‑3 (MQ=255)gTGACTGAAGAGGGAAAGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGt < 1:461508/150‑1 (MQ=255) gACTGAAGAGGGAAAGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCCTATCGCGGCAGTGa > 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agagGGAAAGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTGCGTCCTGCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTCCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATagag > 2:1657215/1‑150 (MQ=255) agagGGAAAGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATagag > 2:1251260/1‑150 (MQ=255) gagGGAAAGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGt < 2:837204/150‑1 (MQ=255) ggAAAGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGga < 2:1565738/150‑1 (MQ=255) aaaGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGgagg > 2:930588/1‑149 (MQ=255) aaaGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGgaga > 1:358673/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGagag < 2:225293/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGagag < 1:997728/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCGTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAggg < 1:1251260/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAgggg < 1:1760431/150‑1 (MQ=255) cTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGGCATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGt < 2:1231432/150‑1 (MQ=255) gCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTAc > 2:240817/1‑150 (MQ=255) ttAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGCGGAGAGGGGTTACAg > 2:1520100/1‑150 (MQ=255) aaCCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCg > 1:1584659/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGGCACAGCggggtg > 2:586778/1‑150 (MQ=255) cGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCggggtggg < 1:163453/150‑1 (MQ=255) cGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCggggtggg < 1:240817/150‑1 (MQ=255) cGTCGGGTGACGGTATCGCGTCCTTCTAGGATGGCTTGGCGCATCGGCGCGCGGGACAGGCGCGGGCGTTCCCGTTCTTGACACATAGCTTCGCCTTTTTCGCCACATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCgaggtggg < 2:799410/150‑1 (MQ=255) gTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCggggtgggg > 2:1302857/1‑150 (MQ=255) gTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCggggtgggg < 2:1765390/150‑1 (MQ=255) ggTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACa < 1:1850595/150‑1 (MQ=255) tGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTAc < 2:1300599/132‑1 (MQ=255) tGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTAc > 1:1300599/1‑132 (MQ=255) tGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGa > 1:650254/1‑150 (MQ=255) aCTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGAtg > 1:777785/1‑150 (MQ=255) ttCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGctct > 1:1047036/1‑150 (MQ=255) ccGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACCGCCGGGGGGGGTACAGATGTGCTCTgg > 2:904626/1‑150 (MQ=255) cGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTggg < 2:1584659/150‑1 (MQ=255) cGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTggg < 2:650254/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCGATATGGCGGCaaag > 1:300174/1‑92 (MQ=255) ttCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCGATATGGCGGCaaag < 2:300174/95‑4 (MQ=255) ttCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGAt < 1:695445/135‑1 (MQ=255) ttCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGAt > 2:695445/1‑135 (MQ=255) ttCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTaa > 2:1596066/1‑150 (MQ=255) ccAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTAGAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAaga < 1:1838683/150‑1 (MQ=255) ccAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAaga > 1:1183853/1‑150 (MQ=255) aGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGc > 1:11368/1‑150 (MQ=255) aTGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGCGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTgg < 2:1215666/150‑1 (MQ=255) aTGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTgg < 1:1302857/150‑1 (MQ=255) aTGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTgg < 1:1657215/150‑1 (MQ=255) tCGGACCATCGGCCCGCTGAACGGGATCGGGCGTTCCTTTGATTGAGACATATCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGGGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGGACCg > 2:1709145/1‑150 (MQ=38) 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tttGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCAct > 2:538177/1‑150 (MQ=255) ttGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGt > 2:1381763/1‑127 (MQ=255) ttGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGt < 1:1381763/127‑1 (MQ=255) ttGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTAcc > 1:318938/1‑150 (MQ=255) ttGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTAcc > 2:721877/1‑150 (MQ=255) agaCATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTgg < 1:538177/150‑1 (MQ=255) tAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCgg > 1:367367/1‑150 (MQ=255) aGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGt < 2:1806785/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTc > 1:392512/1‑150 (MQ=255) tCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGt < 2:392512/150‑1 (MQ=255) cGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTc < 1:63240/150‑1 (MQ=255) cGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTc < 1:429578/150‑1 (MQ=255) cGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGAGCAATAACACTGAATTCGGGCGTTCAGAGCTGGCACCGGGGAGTGCGCAAACGTCGTCAGCCACTGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTc < 1:1383280/150‑1 (MQ=19) gCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTCg > 1:1916231/1‑150 (MQ=255) ccTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGt < 2:1564225/111‑1 (MQ=255) ccTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGGTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGt > 1:1564225/1‑111 (MQ=255) cactGCCGCGATATGGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTCGaa > 2:181493/4‑150 (MQ=255) cTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTCGaa < 2:318938/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTCGaa > 2:174917/1‑150 (MQ=255) cTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTCGaa < 2:1518302/150‑1 (MQ=255) actGCCGCGATATGGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGt < 1:128344/139‑1 (MQ=255) actGCCGCGATATGGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGt > 2:128344/3‑141 (MQ=255) cgccATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGTGTTAATAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAg < 2:1163060/107‑1 (MQ=255) cgccATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAg > 1:1163060/1‑107 (MQ=255) cgccATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTCGAACCTTcc < 2:367367/150‑1 (MQ=255) gccATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTGGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTCGAACCTTCCg > 2:895348/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGc > 1:959093/1‑92 (MQ=255) tCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGc < 2:959093/92‑1 (MQ=255) | GTGACTGAAGAGGGAAAGCCTGGCTTAACCGGGCGTCGGGTGACTGTCTTCCGTCCTTCCAGGATGGCTCGGACCATCGGCCCGCTGAACAGGATCGGGCGTTCCTTTGCTTGAGACATAGCTTCGCCTTTGCCGCCATATCGCGGCAGTGAATAGAGTGGAGAGGGGTTACAGCGGGGTGGGGTACAGATGTGCTCTGGGGTTAAGAGCTGGCACCGGGGCGTGCGCAAGCGTTGTCAGCCATGGCGCGGCACTCTACCTGGTGCGGTCCGTCGAACCTTCCG > NC_002947/1741836‑1742119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |