| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,818,531 | C→T | 5.1% | H211Y (CAT→TAT) | PP_1622 → | M23B subfamily metallopeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,818,531 | 0 | C | T | 5.1% | 288.6 / 4.2 | 98 | H211Y (CAT→TAT) | PP_1622 | M23B subfamily metallopeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/52); new base T (2/3); total (43/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.81e-01 | |||||||||||
GAATAAAGGCATTGATATCGCCGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCAAACCCGTCGATCCACTCCAGTTCCTGC > NC_002947/1818383‑1818678 | gAATAAAGGCATTGATATCGCCTGTGATTTGAGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGAGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGCCGAGCTGATCATCATCAAGCAAAGCTACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCa < 1:1483241/150‑1 (MQ=255)gAATAAAGGCATTGATATCGCCGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCTGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCa > 2:629757/1‑150 (MQ=255)gAATAAAGGCATTGATATCGCCGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTAAGTCCGTGCATCCGGTcc > 2:1047720/1‑149 (MQ=255) aTAAAGGCATTGATATCGCCGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATa < 1:1895514/150‑1 (MQ=255) gCATTGATATCGCCGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCa > 2:340639/1‑150 (MQ=255) aTTGATATCGCCGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTGCGGTTATGACCGTAgg < 2:1652331/150‑1 (MQ=255) ttGATATCGCCGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGc < 2:1183536/150‑1 (MQ=255) atatCGCCGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGt > 2:232935/1‑150 (MQ=255) ccGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTc > 2:1583548/1‑150 (MQ=255) ccGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTc < 1:1224857/150‑1 (MQ=255) cGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCg > 1:147409/1‑150 (MQ=255) ggTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCgg < 2:487117/150‑1 (MQ=255) ggTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCgg < 1:1774363/150‑1 (MQ=255) gTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCggg < 1:1082850/150‑1 (MQ=255) tGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGa < 2:147409/150‑1 (MQ=255) tGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGa < 2:67790/150‑1 (MQ=255) gATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAg < 2:11682/150‑1 (MQ=255) aTTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCTAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCTCACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAgg < 1:1590336/150‑1 (MQ=255) ttGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAgggg > 2:1302022/1‑150 (MQ=255) ttGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAgggg < 2:1527763/150‑1 (MQ=255) gCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑cagcagtt < 1:1013120/150‑3 (MQ=255) ccTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTc > 1:1292193/1‑150 (MQ=255) gTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAg < 1:232935/150‑1 (MQ=255) gTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAg < 1:340639/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTCATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCATACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAggcag < 2:310615/150‑1 (MQ=255) tgctgcGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAggcagg < 2:1231016/150‑1 (MQ=255) gctgcGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAggcaggg < 1:1302022/150‑1 (MQ=255) tgcGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTGCGGTTATGACCgta < 2:369785/110‑3 (MQ=255) tgcGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTGCGGTTATGACCgta > 1:369785/1‑108 (MQ=255) tgcGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAggcagggca < 2:617588/150‑1 (MQ=255) cGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGt < 2:890626/150‑1 (MQ=255) gTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTc < 2:1725715/150‑1 (MQ=255) tCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCg > 1:1713618/1‑150 (MQ=255) tGATGGTGCGGTGGCTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCAAGGGCGAGCTGATCAAAGTGAATCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGAt > 2:1005905/1‑150 (MQ=255) gATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGAtt < 2:1292193/150‑1 (MQ=255) aTGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAggg < 2:1250665/121‑1 (MQ=255) aTGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAggg > 1:1250665/1‑121 (MQ=255) tGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGc < 1:1513381/150‑1 (MQ=255) ggtggtTTATGCCGGGAGAGGATTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAAt > 2:1664945/1‑150 (MQ=255) gtggtTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGANATg < 2:1188394/150‑1 (MQ=255) ttATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTGCGGTTATGACCGTAgg > 2:161942/1‑91 (MQ=255) ttATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTGCGGTTATGACCGTAgg < 1:161942/91‑1 (MQ=255) tATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCt < 1:467284/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTa < 1:629757/150‑1 (MQ=255) ccGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAg > 1:1045375/1‑85 (MQ=255) ccGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAg < 2:1045375/85‑1 (MQ=255) ccGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACgg < 1:914369/150‑1 (MQ=255) ccGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACgg < 2:14725/150‑1 (MQ=255) cGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATgg < 2:609742/140‑1 (MQ=255) cGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATgg > 1:609742/1‑140 (MQ=255) gTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CCGCATGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAg > 1:115499/1‑150 (MQ=255) gTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCGAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATc > 2:1792136/1‑150 (MQ=255) gTTTGAGGGGCTACGACGAGCTGATCATCCTCAAGCACCGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAAGCCGGGGGTTCGGGAGCGG‑CAGCAGCTCACGGCAGGGCCGTCCATTGCTGAACTGGGGTCTACCGGCACAGacc > 2:630125/1‑148 (MQ=255) tttGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCTATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCg > 1:1844684/1‑150 (MQ=255) tttGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCg > 2:1009241/1‑150 (MQ=255) ttGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCgg > 2:179957/1‑150 (MQ=255) aGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTGGGGCGGGGAGTGCCGGT‑TATGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGtgtg > 1:697343/1‑150 (MQ=255) gCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAggg > 2:1300807/1‑85 (MQ=255) gCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAggg < 1:1300807/85‑1 (MQ=255) cTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCt > 2:92445/1‑150 (MQ=255) cTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCt > 1:907434/1‑150 (MQ=255) aCGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGc > 1:3179/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCAttt < 2:197912/150‑1 (MQ=255) atcatcatcAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCgaga > 1:1420710/1‑148 (MQ=255) atcatcatcAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCgaga < 2:1420710/148‑1 (MQ=255) atcatcatcAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGAtt > 1:1699381/1‑150 (MQ=255) tcatcatcaAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTc < 2:819789/150‑1 (MQ=255) tcatcaAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTAAGGCAATAACCACAAGCGGTTGGTTCTGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTcgcc > 1:1775505/1‑150 (MQ=255) tcaAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTg > 2:344451/1‑53 (MQ=255) tcaAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTg < 1:344451/53‑1 (MQ=255) tcaAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTcg > 2:85757/1‑145 (MQ=255) tcaAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTcg < 1:85757/145‑1 (MQ=255) tcaAGCACAGAGACACCTACATCAGTAACTACGGTCATAAAAGCAGTCTGTAGTGGCAGGGGTGC‑GAGCTTATCTTTGGATGGCAGTCTAGTTCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCgccgcc > 2:1163221/1‑150 (MQ=255) caAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCa < 1:1047720/150‑1 (MQ=255) aaGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAg > 2:1921714/1‑150 (MQ=255) tcacaGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAggg < 1:240507/149‑1 (MQ=255) gCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAggg < 1:92445/150‑1 (MQ=255) gCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAggg < 2:1699381/150‑1 (MQ=255) acaGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGACGCTTCTTTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCa > 2:240507/1‑150 (MQ=255) caGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCaa < 1:1321795/150‑1 (MQ=255) cTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAg > 2:1690153/1‑61 (MQ=255) cTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAg < 1:1690153/61‑1 (MQ=255) cTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCAAACCCGTCGa < 2:900488/150‑1 (MQ=255) tCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCAAAcc < 2:237267/139‑1 (MQ=255) tCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCAAAcc > 1:237267/1‑139 (MQ=255) tCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCAAACCCGTCGATCCAc > 1:487152/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCCTACGGTCATGACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGTCAAACCCGTCGATCCAc < 2:645351/150‑1 (MQ=255) gTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAggcag > 2:622642/1‑57 (MQ=255) gTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAggcag < 1:622642/57‑1 (MQ=255) tGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCTATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCAAACCCGTCGATCCACTCCa < 2:1844684/150‑1 (MQ=255) tGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCga < 2:412278/114‑1 (MQ=255) tGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCga > 1:412278/1‑114 (MQ=255) cTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGCGCACAGATCGGGTGAAGCTACATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCAAACCCGTCGATCCACTCCAGtt > 2:124428/1‑150 (MQ=255) tACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTg > 2:449588/1‑64 (MQ=255) tACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTg < 1:449588/64‑1 (MQ=255) tACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGGCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCAAACCCGTCGATCCACTCCAGTTc > 1:516911/1‑150 (MQ=255) gTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTcgcc < 2:526558/114‑1 (MQ=255) gTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTcgcc > 1:526558/1‑114 (MQ=255) gTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCAAACCCGTCGATCCACTCCAGTTCCTGc < 1:179957/150‑1 (MQ=255) | GAATAAAGGCATTGATATCGCCGGTGATTTGGGACAGCCTGTTTTTGCTGCGTCTGATGGTGCGGTGGTTTATGCCGGGAGTGGTTTGAGGGGCTACGGCGAGCTGATCATCATCAAGCACAGCGACACCTACGTCAGTGCCTACGGTCATAACCGCAGGCTGTTGGTTCGGGAGGGG‑CAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGTCGATTGCTGAAATGGGGTCTACGGGCACAGATCGGGTGAAGCTGCATTTCGAGATTCGCCGCCAGGGCAAACCCGTCGATCCACTCCAGTTCCTGC > NC_002947/1818383‑1818678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |