| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,864,795 | G→A | 6.2% | A29A (GCG→GCA) | hda → | DnaA regulatory inactivator Hda |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,864,795 | 0 | G | A | 6.2% | 241.2 / 4.4 | 81 | A29A (GCG→GCA) | hda | DnaA regulatory inactivator Hda |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/40); new base A (2/3); total (38/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
GGGTATAGACTTTGCAGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACGTGGCGAGCCCGCTGT > NC_002947/1864646‑1864941 | gggTATAGACTTTGCAGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCg < 1:1268272/150‑1 (MQ=255) gTATAGACTTTGCAGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGc > 1:931481/1‑150 (MQ=255) taGACTTTGCCGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCAtt < 1:291991/150‑1 (MQ=255) aGACTTTGCAGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTg < 2:931481/150‑1 (MQ=255) aGACTTTGCAGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCCGCAGCATTg < 1:1389934/150‑1 (MQ=255) aCTTTGCAGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTggg < 2:1719424/150‑1 (MQ=255) tttGCAGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGtt > 1:1323977/1‑150 (MQ=255) ttGCAGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTa < 2:1080984/150‑1 (MQ=255) tGCAGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCCGCAGCATTggcgccc < 2:1879791/150‑6 (MQ=255) gATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCg > 1:419009/1‑150 (MQ=255) aCCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTa > 1:1284097/1‑150 (MQ=255) aCCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTa > 2:1771638/1‑150 (MQ=255) aCCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCATGCGGGGTGATGCAACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCCATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTa > 1:1468006/1‑150 (MQ=255) ccAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTAt > 1:1215631/1‑150 (MQ=255) cAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCg < 1:1248665/124‑1 (MQ=255) cAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCg > 2:1248665/1‑124 (MQ=255) cAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATg > 1:223279/1‑150 (MQ=255) cAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATg > 2:411617/1‑150 (MQ=255) cAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATg > 1:427139/1‑150 (MQ=255) aaaGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTggg < 2:1191479/131‑1 (MQ=255) aaaGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTggg > 1:1191479/1‑131 (MQ=255) ggCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGTGTTACGTCGAGCGGCTATGCGaa < 1:258422/150‑1 (MQ=255) cccccAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGc < 2:707915/150‑1 (MQ=255) ccccAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGaa > 2:1200556/1‑147 (MQ=255) ccccAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGaa < 1:1200556/147‑1 (MQ=255) ccccAGCGGTCCCATCGACCGCCTGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGcc > 2:941045/1‑150 (MQ=255) cccAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTgg > 1:308597/1‑123 (MQ=255) cccAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTgg < 2:308597/123‑1 (MQ=255) tCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCACCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGc < 1:502551/150‑1 (MQ=255) cGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTgg > 2:1362447/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCga < 2:1563055/150‑1 (MQ=255) cgcccgcGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCgaga > 2:621582/1‑150 (MQ=255) gcccgcGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCgaga < 1:1331615/149‑1 (MQ=255) gcccgcGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCgaga > 2:1331615/1‑149 (MQ=255) cccgcGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGc < 2:419009/150‑1 (MQ=255) ccgcGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATGCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGcc > 2:1313362/1‑150 (MQ=255) gcgAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCtt < 1:941045/150‑1 (MQ=255) gcgAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCtt < 2:1760627/150‑1 (MQ=255) gAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTAt < 1:555505/150‑1 (MQ=255) aGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCATGGGCGGTCTCACCACCTTTATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATc < 2:50560/150‑1 (MQ=255) gCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCt > 2:768455/1‑150 (MQ=255) aTGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGATGCCGTCGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTAc < 1:250422/150‑1 (MQ=255) aTGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTAc < 2:1736910/150‑1 (MQ=255) aaCCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCtgt > 1:1424350/1‑150 (MQ=255) ccaccGATCCTGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTgg < 1:1612313/150‑1 (MQ=255) ccaccGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGGGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTgg < 1:1149209/150‑1 (MQ=255) cGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCa < 2:1323977/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAg < 1:416855/150‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCa < 1:488465/150‑1 (MQ=255) ccccTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGtt < 2:1470243/150‑1 (MQ=255) ccTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTgg > 2:1909952/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCgg < 1:1232301/84‑1 (MQ=255) cTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCgg > 2:1232301/1‑84 (MQ=255) tGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCt > 1:1612442/1‑127 (MQ=255) tGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCt < 2:1612442/127‑1 (MQ=255) tgCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCACGCAGGGTGTTGGCCGTTccc < 1:963637/150‑1 (MQ=255) gcgATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGtt < 1:356240/131‑1 (MQ=255) gcgATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGtt > 2:356240/1‑131 (MQ=255) cgATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCa > 2:1008378/1‑150 (MQ=255) gATGACGCCAGCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGATAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAg < 1:769553/150‑1 (MQ=255) gCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCGAGCAGTGTGTTGGCCGTTTCCACCTGCTGCAGgccgcc > 1:927796/1‑150 (MQ=255) tcaACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCt > 2:1676303/1‑150 (MQ=255) caACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCtt > 1:925668/1‑150 (MQ=255) ctactaTCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCa < 1:621582/150‑1 (MQ=255) ctactaTCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCa < 2:723990/150‑1 (MQ=255) ctaattaccGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCa < 1:465085/143‑1 (MQ=255) tactaTCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAg < 1:1909952/150‑1 (MQ=255) actaTCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGc < 1:768455/150‑1 (MQ=255) taTCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCCACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCaa > 2:643515/1‑150 (MQ=255) tCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGAACATACGTTGCGGACGCCGTCTGTACAGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACg > 2:66002/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCGGATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACGTg < 1:1771638/150‑1 (MQ=255) ggCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACGTGGc < 2:1561958/150‑1 (MQ=255) gcCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACGTGGCGAg > 1:1014292/1‑150 (MQ=255) cccAATGCCGCAGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCtgtg < 1:774548/79‑1 (MQ=255) cccAATGCCGCAGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCtgtg > 2:774548/2‑80 (MQ=255) ccAATGCCGCAGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACGTGGCGAGc > 2:659683/1‑150 (MQ=255) cAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACGTGGCGAGcc > 2:256746/1‑150 (MQ=255) aaTGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACGTGGCGAGccc > 1:421577/1‑150 (MQ=255) aaTGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAAAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACGTGGCGAGccc < 1:411617/150‑1 (MQ=255) tgcGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCtt > 1:957077/1‑126 (MQ=255) tgcGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCtt < 2:957077/126‑1 (MQ=255) tgcGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGATATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCa < 2:1810229/116‑1 (MQ=255) tgcGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGATATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCa > 1:1810229/1‑116 (MQ=255) tgcGGCATTGGGCTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACGTGGCGAGCCCGCTGt > 1:1327174/1‑150 (MQ=255) | GGGTATAGACTTTGCAGATTGTTCACCAAAGGCCCCCAGCGGTCCCGTCGACCGCCCGCGAGCATGAAACCACCGATCCAGTTGCCCCTGGGTGTGCGCCTGCGCGATGACGCCACCTTCATCAACTACTATCCGGGCGCCAATGCTGCGGCATTGGGTTACGTCGAGCGGCTATGCGAAGCCGACGCCGGCTGGACCGAGAGCCTTATCTACCTGTGGGGCAAGCAGGGTGTTGGCCGTTCCCACCTGCTGCAGGCCGCCACCCATCGCTTCCAGCAACGTGGCGAGCCCGCTGT > NC_002947/1864646‑1864941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |