Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,903,384 | A→T | 6.1% | Q1298L (CAG→CTG) | PP_1703 → | assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,903,384 | 0 | A | T | 6.1% | 235.6 / 6.4 | 82 | Q1298L (CAG→CTG) | PP_1703 | assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/37); new base T (3/2); total (43/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.15e-01 |
GCAAGCGGCGGGGCACCTGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGAAGTGCTCCAAGATGGG > NC_002947/1903235‑1903533 | gCAAGCGGCGGGGCACCTGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATgcgca > 1:71868/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCGGGGCACCTGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCCGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCGGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATgcgcagc > 1:1595480/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCGGGGCACCTGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATgcgcagc > 1:775577/1‑150 (MQ=255) ggCACCTGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGACGTCCGATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCa < 1:115433/150‑1 (MQ=255) gCACCTGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAg < 1:109462/150‑1 (MQ=255) cACCTGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAgg > 1:1654599/1‑150 (MQ=255) aCCTGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAggg > 2:784018/1‑150 (MQ=255) cTGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGAt > 2:1081319/1‑150 (MQ=255) tGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTCGCATGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGAtg > 1:1277978/1‑150 (MQ=255) gCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCATGGAtgt < 1:1418396/150‑1 (MQ=255) gCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGAtgt > 2:178788/1‑150 (MQ=255) ggCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTgg > 1:920916/1‑150 (MQ=255) tGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATg > 1:1777557/1‑150 (MQ=255) cacGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATgcggc < 2:1654599/150‑1 (MQ=255) acGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATgcggcg > 1:1523389/1‑150 (MQ=255) acGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATgcggcg > 2:1414183/1‑150 (MQ=255) acGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCCATGCGCTGCGCATCGCCacacacat > 2:966047/1‑133 (MQ=255) acGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCCATGCGCTGCGCATCGCCacacacat < 1:966047/140‑8 (MQ=255) acGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGAACTAAAAACAGCGGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATgcggcg > 1:1314875/1‑150 (MQ=255) cGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGt < 2:557903/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCGATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGtt > 1:348481/1‑150 (MQ=255) tctcGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCggg > 1:1010494/1‑150 (MQ=255) tcGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGTGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGAGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTg > 1:128252/1‑150 (MQ=255) tcGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTg > 2:759392/1‑150 (MQ=255) tgcgGGTCCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGAGGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGa < 1:282113/149‑1 (MQ=255) gcgGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGAt > 2:1648756/1‑150 (MQ=255) gACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTg > 2:648028/1‑148 (MQ=255) gACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTg < 1:648028/148‑1 (MQ=255) ccAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGAtt > 2:1487203/1‑145 (MQ=255) ccAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGAtt < 1:1487203/145‑1 (MQ=255) ccAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGATGCGCCGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGc > 1:615417/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCACAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCg > 1:1276621/1‑137 (MQ=255) cAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCACAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCg < 2:1276621/137‑1 (MQ=255) aGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCTGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCg > 1:1075629/1‑150 (MQ=255) ggTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGa > 2:594748/1‑150 (MQ=255) tCGAGAAGAGCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGc < 2:615417/150‑1 (MQ=255) agaagaTCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATg < 1:178788/150‑1 (MQ=255) gaagaTCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATgg > 1:1494610/1‑150 (MQ=255) gaTCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGcag > 1:177179/1‑148 (MQ=255) cTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCggat < 1:1862529/150‑1 (MQ=255) tATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCggatg < 2:1321446/150‑1 (MQ=255) aTGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCGAGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCGAGGGAGGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCggctgg > 1:1788163/1‑150 (MQ=255) tgtgCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCggatgga > 1:950765/1‑150 (MQ=255) gtgCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCggatggat > 2:1327351/1‑150 (MQ=255) gtgCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCggatggat < 1:220395/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCgg > 1:1604332/1‑104 (MQ=255) tCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCgg < 2:1604332/104‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCGGGATGGATGCGGcggcggcggcgg > 2:1574976/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGgcggctgcggc < 2:775577/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTa < 2:1421133/150‑1 (MQ=255) cAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTAt < 1:1398301/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTc < 1:1648756/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTc < 1:784018/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTc > 2:1290288/1‑150 (MQ=255) gcgcTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGTCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCCaa < 2:71868/150‑1 (MQ=255) gcgcTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGaa < 2:1777557/150‑1 (MQ=255) gCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGATAGTCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCaa > 1:1367091/1‑150 (MQ=255) cAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAg < 2:1494610/150‑1 (MQ=255) aaTGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAgg < 1:594748/150‑1 (MQ=255) ggCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCATGAGCAAGGCCa < 2:177179/150‑1 (MQ=255) tGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGc < 2:965385/145‑1 (MQ=255) tGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGc > 1:965385/1‑145 (MQ=255) tGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGc < 2:565333/150‑1 (MQ=255) gggggCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCg < 1:1081319/150‑1 (MQ=255) ggCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGATTGAGCAAGGCCCGGCGCTATCGgcg > 1:861776/1‑150 (MQ=255) tATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGAt < 1:1677949/150‑1 (MQ=255) aTTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGAtg > 1:779248/1‑150 (MQ=255) tttCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGAtgt > 1:1839926/1‑150 (MQ=255) tCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGTATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATgtgt < 2:236209/150‑1 (MQ=255) cTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTa < 2:1277978/150‑1 (MQ=255) tATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCCGGCGTTATCGGCGCGATGTGTAc < 2:950765/150‑1 (MQ=255) tATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTAc < 2:1075629/150‑1 (MQ=255) tATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCCGCGGCGGCTGCGCCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTAc < 2:1052372/150‑1 (MQ=255) tATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGAGTTGCGGGTGATTGTCGCGGGGCAGGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTAc > 2:1655208/1‑150 (MQ=255) tgtgtgGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGaa > 1:1016313/1‑150 (MQ=255) tgtgtgGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGaa < 1:644813/150‑1 (MQ=255) tgtgtgGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGaa < 2:1010494/150‑1 (MQ=255) tgtgtgGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGAGGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGaa < 1:511283/150‑1 (MQ=255) gtgGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGAAGTg > 1:143395/1‑150 (MQ=255) ctgGCCATGCGCTGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCAGGGGGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGAAGTg > 2:1315768/2‑150 (MQ=255) tgGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGGTGCGGCTGGGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGAAGTGc > 2:1402159/1‑150 (MQ=255) ggCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGAAGTGCt > 2:362865/1‑150 (MQ=255) gCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGAAGTGCTc > 1:596356/1‑150 (MQ=255) caTGCGCTGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCtt < 1:1448719/103‑1 (MQ=255) caTGCGCTGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCtt > 2:1448719/2‑104 (MQ=255) gcagcgcaTGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGAAGTGCTCCAAGATg < 1:759392/150‑1 (MQ=255) gcagcgcaTGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGAACTAAAGTGCTCCAAGATg > 2:1481401/1‑150 (MQ=255) agcgcaTGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGAAGTGCTCCAAGATggg > 1:1051344/1‑150 (MQ=255) | GCAAGCGGCGGGGCACCTGCGGCTGGACACGGCGTTCTCGCGGGACCAGGTCGAGAAGATCTATGTGCAGCAGCGCATGCTCGAGCAGGGTGCGCTGTTGTGGCAATGGCTGGAGGCGGGGGCGTATTTCTATGTGTGTGGCGATGCGCAGCGCATGGCCAGGGATGTGGATGCGGCGTTGCGGGTGATTGTCGCCGAGCATGGCCGGATGGATGCGGCGGCGGCTGCGGCTTATGTCGAAGGCTTGAGCAAGGCCAGGCGTTATCGGCGCGATGTGTACTGAAGTGCTCCAAGATGGG > NC_002947/1903235‑1903533 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |