| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,996,057 | C→G | 9.8% | intergenic (‑260/+25) | PP_mr26 ← / ← rfbC | C4 ncRNA/dTDP‑4‑dehydrorhamnose 3,5‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,996,057 | 0 | C | G | 9.8% | 239.1 / 16.6 | 82 | intergenic (‑260/+25) | PP_mr26/rfbC | C4 ncRNA/dTDP‑4‑dehydrorhamnose 3,5‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/40); new base G (5/3); total (39/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.09e-01 | |||||||||||
TCTTTGGGAAATGGCCTACAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCAGGCAATGCAGCGCTC > NC_002947/1995916‑1996204 | tCTTTGGGAAATGGCCTACAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGGTAGCGCAGcca < 2:55655/150‑2 (MQ=255) tttGGGAAATGGCCTACAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACCAGGCTGCGCTACCGCAGCCCtt > 1:245805/1‑150 (MQ=255) tttGGGAAATGGCCTACAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCtt > 1:1148319/1‑150 (MQ=255) tttGGGAAATGGCCTACAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGACACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCtt < 1:1098654/150‑1 (MQ=255) ggAAATGGCCTACAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTcc < 1:1088294/150‑1 (MQ=255) ccTACAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAAc > 1:716932/1‑150 (MQ=255) tACAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCg > 1:1911693/1‑150 (MQ=255) cAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGTAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGtt > 2:336706/1‑150 (MQ=255) cAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGtt > 1:264415/1‑150 (MQ=255) ggaaggGGCAAATTCTGATTATTGGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGt < 1:574565/150‑1 (MQ=255) ggggCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGaa < 1:651995/150‑1 (MQ=255) gggCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCTCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAAc > 1:100052/1‑150 (MQ=255) gggCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAAc > 2:723002/1‑150 (MQ=255) gggCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAAc > 2:758890/1‑150 (MQ=255) gCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAg > 1:183339/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCCTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTc < 2:1301354/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCCTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTc < 2:1301649/150‑1 (MQ=255) aTTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTTTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTGGTCGAACAGTTCg > 2:492217/1‑150 (MQ=255) aTTCTGATTATTCGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGGTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCg < 1:686715/150‑1 (MQ=255) ttCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCgg > 1:545940/1‑150 (MQ=255) tCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGc < 2:1924218/150‑1 (MQ=255) tGATTATTTGCCAGCCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTGAGTCTACCAGTCCGGAGt > 2:339857/1‑150 (MQ=255) gATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTc > 2:1503566/1‑150 (MQ=255) attattTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCa < 2:1487068/150‑1 (MQ=255) tttGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATTGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCa > 2:516201/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCaa > 1:641578/1‑150 (MQ=255) tGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAAt < 1:1909783/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATg > 1:622643/1‑150 (MQ=255) cAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTCTCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGc < 1:1259777/150‑1 (MQ=255) aGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTTAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCt > 1:376219/1‑150 (MQ=255) gCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTg < 2:1497753/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTg < 1:748455/150‑1 (MQ=255) cttcttAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTg < 2:545940/150‑1 (MQ=255) cttcttAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCC‑CTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGc < 1:294398/150‑1 (MQ=255) cttAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCa < 2:1745952/150‑1 (MQ=255) ttAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTACACCACATTGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAg > 2:259467/1‑150 (MQ=255) gtgtGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGTAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCtt < 1:336706/150‑1 (MQ=255) gtgtGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCtt > 2:641574/1‑150 (MQ=255) tgtgAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCACGCCGGTCCTTGCCAGACAAGCTTg < 2:1911693/150‑1 (MQ=255) gAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTa < 1:641574/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCGCCACTATCGGCAAGCCCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCGGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTa < 2:1688228/149‑1 (MQ=255) aaaaaCGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTAc < 2:1631536/150‑1 (MQ=255) aaCGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGa < 1:827789/150‑1 (MQ=255) 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aCTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGAt < 1:758890/150‑1 (MQ=255) tATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTGGGTACGGAGTCGATgg > 2:972296/1‑150 (MQ=255) ttggCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGc < 1:516201/148‑1 (MQ=255) tCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGc < 2:135323/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGc < 2:632032/127‑1 (MQ=255) gCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGc > 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cGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTg < 1:1524549/122‑1 (MQ=255) tGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCAtt < 1:81391/138‑1 (MQ=255) tGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCAtt > 2:81391/1‑138 (MQ=255) cATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCg > 2:893545/1‑150 (MQ=255) aTGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCgg > 2:1395089/1‑150 (MQ=255) aTGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCgg > 2:923383/1‑150 (MQ=255) tgtTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATc < 1:923383/150‑1 (MQ=255) gtTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCa < 2:183339/150‑1 (MQ=255) agagACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTcc > 1:1576871/1‑150 (MQ=255) ggagaagggCTGCGGTAGCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCa > 1:1690898/8‑150 (MQ=255) gagaCAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCa < 2:100052/150‑1 (MQ=255) gagaagggCTGCGGTAGCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCAg < 1:931534/144‑1 (MQ=255) gagaagggCTGCGGTAGCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCAg > 2:931534/7‑150 (MQ=255) agaCAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCAg < 2:641578/150‑1 (MQ=255) gaCAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCAgg > 1:1808056/1‑150 (MQ=255) aCAAGGCCGCGTTACTGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAACCAAAGCGACCCCCAGCTGGACCTTGCCAGACCAGCTTCCTACGGAGTCGATGGCCTATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCAGGc < 1:1077283/150‑1 (MQ=255) aagggCTGCGGTAGCGCAGCCTTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCAGGCa > 2:1397232/4‑150 (MQ=255) agggCTGCGGTAGCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTAc > 1:1504939/3‑103 (MQ=255) agggCTGCGGTAGCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTAc < 2:1504939/101‑1 (MQ=255) gggCTGCGGTAGCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCAGGCAAt > 2:1471957/2‑150 (MQ=255) gCTGCGCTACCGCAGCCCATCTACGCTAAAAACGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCACAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTTTTACGGCGACGATGGGCGAGTCGATAACCACTGTCTGTTCATTCCAGGGACTGc > 2:562767/1‑150 (MQ=255) tACCGCAGCCCTTCTTCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTACGGTATGATTCCAGGCAATGCAGCGCTc < 2:376219/150‑1 (MQ=255) | TCTTTGGGAAATGGCCTACAAGGAAGGGGCAAATTCTGATTATTTGCCAGGCCATGCAGCGGTTGCTTCTTAGTGGCGTGTGAAAAACGCCACTATCGGCAAGACCCGGTATGGCATGTGTTCAGAGACAAGGCTGCGCTACCGCAGCCCTTCTCCGCTAAAACCGTTAGTCGAACAGTTCGGCGTCAGCCAATGCGACCCCAAGCTGGTCCTTGCCAGACAAGCTTGGTACGGAGTCGATGGGCCATTCGATACCCACTGCCGGATCATTCCAGGCAATGCAGCGCTC > NC_002947/1995916‑1996204 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |