| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,144,411 | G→C | 6.5% | Q239H (CAG→CAC) | lpxK → | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,144,411 | 0 | G | C | 6.5% | 265.4 / 6.7 | 86 | Q239H (CAG→CAC) | lpxK | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/42); new base C (4/2); total (42/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GACCGCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGC > NC_002947/2144265‑2144556 | gACCGCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAgcgc > 1:207489/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCt < 2:10895/150‑1 (MQ=255) ccGCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCt > 1:953998/1‑150 (MQ=255) cGCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTg > 1:1723400/1‑150 (MQ=255) gCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGc > 1:1620276/1‑150 (MQ=255) cTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCACCGCATGCa > 1:213479/1‑150 (MQ=255) gTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCGTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCgg > 1:1554559/1‑150 (MQ=255) aGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTgg < 1:31511/150‑1 (MQ=255) aGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCACCGCATGCAGGCGCTgg < 2:213479/150‑1 (MQ=255) ggCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGc < 1:150545/150‑1 (MQ=255) cTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTggaag < 2:935442/150‑4 (MQ=255) ggcgGTGCTGTTCCACGGCGCCCGCGACGTCGGCACCGATGGCGTCCGTTTTTTTCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCACCGGCCACCGCATGCAGGCGCTGGCCggcgg < 2:681986/149‑4 (MQ=255) ggTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCgg > 2:954807/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCgg > 1:30333/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCgg < 2:622712/150‑1 (MQ=255) ttCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCg > 2:1021007/1‑150 (MQ=255) ttCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCg > 2:1021087/1‑150 (MQ=255) ttCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCg > 2:674727/1‑150 (MQ=255) ttCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCACCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCg < 2:1761067/142‑1 (MQ=255) ttCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCACCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCg > 1:1761067/1‑142 (MQ=255) aCGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAAc < 2:1772824/150‑1 (MQ=255) ggCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGt < 1:1463029/150‑1 (MQ=255) cAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttctt > 1:853038/1‑150 (MQ=255) agggAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCNAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttcttc < 1:676368/147‑1 (MQ=255) aGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttcttc < 1:674727/150‑1 (MQ=255) aGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttcttc > 2:1181215/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCCGCACCCTGCTGCTCGCGGGGGCCGGGATCGGCAACCCGCAACGTttcttc > 1:1867367/1‑150 (MQ=255) gCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCa < 1:1812212/150‑1 (MQ=255) cGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTNCaa < 2:1195043/150‑1 (MQ=255) gAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAac > 1:1093694/1‑150 (MQ=255) gCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCCGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGCACCGTCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCctgc > 2:911624/1‑150 (MQ=255) ccGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTgg < 1:1718688/150‑1 (MQ=255) cGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTggg < 2:594040/150‑1 (MQ=255) 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2:335506/1‑148 (MQ=255) tggtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTTGTCAACGTGCGCTGT‑GCTGGGGCAGATCGACTGCAGTATTGCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTg < 1:223603/149‑1 (MQ=255) cggtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTg < 2:1554559/150‑1 (MQ=255) cggtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTg < 1:759520/150‑1 (MQ=255) gtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGc > 1:735533/1‑150 (MQ=255) ctgcctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGcc < 2:853038/150‑1 (MQ=255) tgcctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAAcc < 2:1091112/106‑1 (MQ=255) tgcctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAAcc > 1:1091112/1‑106 (MQ=255) cctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCACCCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGt < 2:1903407/150‑1 (MQ=255) ctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATTGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTg > 2:1877851/1‑150 (MQ=255) tgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGc < 1:1407248/150‑1 (MQ=255) tCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCATGc > 1:1504224/1‑70 (MQ=255) tCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCATGc < 2:1504224/70‑1 (MQ=255) ggCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCtt < 1:1021087/150‑1 (MQ=255) ggCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCtt < 1:1021007/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCg > 1:654760/1‑83 (MQ=255) ccTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCg < 2:654760/83‑1 (MQ=255) ccTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGc > 1:1240/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGc > 2:651958/1‑150 (MQ=255) 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cGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATgc < 1:1458252/150‑1 (MQ=255) gTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATgcg > 1:355691/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTc < 1:139284/150‑1 (MQ=255) tGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAg < 2:1723400/150‑1 (MQ=255) tGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAg > 1:1695135/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGcc < 2:1695135/150‑1 (MQ=255) cGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATACGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGc > 1:1143995/1‑150 (MQ=255) gcg‑cTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTg < 2:842427/150‑1 (MQ=255) g‑cTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGc < 1:1753463/150‑1 (MQ=255) tCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCAAGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCt > 1:124955/1‑150 (MQ=255) gACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAg < 1:60506/93‑1 (MQ=255) gACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAg > 2:60506/1‑93 (MQ=255) gACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATgcg > 1:1214902/1‑123 (MQ=255) gACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATgcg < 2:1214902/123‑1 (MQ=255) cccGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATc > 1:702379/1‑97 (MQ=255) cccGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATc < 2:702379/97‑1 (MQ=255) ccgccgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCAc > 2:1743421/1‑150 (MQ=255) ccgccgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTGCTGCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCAc > 1:48993/1‑150 (MQ=255) ccgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGc > 1:1709663/1‑150 (MQ=255) ccgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTAGCTGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGc > 1:116841/1‑150 (MQ=255) cgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGcc > 1:56428/1‑150 (MQ=255) cgGCCACCGCATGCAGGCGCTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGcc > 2:433677/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGc < 1:1890075/141‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGc > 2:1890075/1‑141 (MQ=255) gCCACCGCATGCAGGCGCTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGc > 1:1805054/1‑150 (MQ=255) | GACCGCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCG‑CTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGC > NC_002947/2144265‑2144556 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |