Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,171,711 | G→A | 5.6% | intergenic (+203/+200) | PP_5484 → / ← PP_1924 | hypothetical protein/phosphinothricin N‑acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,171,711 | 0 | G | A | 5.6% | 238.7 / 2.2 | 82 | intergenic (+203/+200) | PP_5484/PP_1924 | hypothetical protein/phosphinothricin N‑acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/33); new base A (3/2); total (47/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAG > NC_002947/2171562‑2171853 | aGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCACAACTTGGCTACCATCCTCTGTCGACGGCtgg > 2:1546329/1‑150 (MQ=255) gTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCtggt < 1:689572/150‑1 (MQ=255) tGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCACCAGCTGTCGACAGCtgatg < 1:1828873/150‑1 (MQ=255) gggggTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGACACAGCTTGCTAGTCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCtggtgg < 1:831735/150‑1 (MQ=255) gTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTAcc < 1:1138036/150‑1 (MQ=255) gggCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGt < 2:899659/150‑1 (MQ=255) cGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGa < 1:1830618/150‑1 (MQ=255) cGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGa < 1:391979/150‑1 (MQ=255) tAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTa > 1:756611/1‑150 (MQ=255) ccGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTTGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAgg > 2:153127/1‑150 (MQ=255) ccGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAgg < 1:153127/150‑1 (MQ=255) ttACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGtt < 2:837270/150‑1 (MQ=255) tttATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGACGACAGCTGTCGCGCCGAGACGGCTGGCTATCCCCACTTGGGTACGATCAGCTGGCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGGTTGGGGTAAgg > 2:1683024/1‑150 (MQ=255) tGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACg > 1:439274/1‑150 (MQ=255) gTCAGCAACACCAAGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACCGACGGCTATCCCGCGACATCGTCCATCAGCGGGCGACTGCCGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACgg < 1:704542/150‑1 (MQ=255) aGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGccc > 2:1683780/1‑150 (MQ=255) gCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGcccc < 2:1276247/150‑1 (MQ=255) acCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGTTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCaa > 2:829293/1‑150 (MQ=255) ccGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTaa < 1:138799/111‑1 (MQ=255) ccGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTaa > 2:138799/1‑111 (MQ=255) ccGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCCGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAAc < 2:1071603/150‑1 (MQ=255) cGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAAcc > 1:1118217/1‑150 (MQ=255) cGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAAcc > 1:1118195/1‑150 (MQ=255) aGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCa < 2:972548/150‑1 (MQ=255) gCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGGAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCAt > 1:946036/1‑150 (MQ=255) tCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACGGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAgc < 2:1535188/150‑1 (MQ=255) tCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAgc < 2:464347/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACCGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAgc < 2:1283655/150‑1 (MQ=255) ccATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCTCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGATGACGGTGACATGGTGTGTAG‑ATCTGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGACTACATAGCGCa > 2:49640/1‑150 (MQ=255) ccATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCGATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCa > 1:627772/1‑150 (MQ=255) aTGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTaa > 1:648472/1‑115 (MQ=255) aTGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTaa < 2:648472/115‑1 (MQ=255) cAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAg < 2:381631/150‑1 (MQ=255) cAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTGGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAg < 1:530822/150‑1 (MQ=255) aaTAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGTTACAGCCAGTCTGTATT‑AAACCAGATCCTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCAGCTGCATAGCGCGTCCAgg > 1:1663696/1‑150 (MQ=255) tAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGGCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGt > 2:124219/1‑150 (MQ=255) aGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGtt > 1:321673/1‑150 (MQ=255) aGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGtt > 1:321139/1‑150 (MQ=255) ccGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTtgg > 1:664754/1‑150 (MQ=255) cGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTtggt < 2:1118217/150‑1 (MQ=255) cGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTtggt < 2:1118195/150‑1 (MQ=255) gACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGCGAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTtggtg > 1:1550468/1‑150 (MQ=255) ctcCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAgcc < 2:956579/150‑1 (MQ=255) tcCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAATGATCGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATGGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAgccc > 1:214923/1‑149 (MQ=255) tcCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAgccg > 1:1722105/1‑150 (MQ=255) ccgccgAGACGGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCg < 2:1287160/90‑1 (MQ=255) ccgccgAGACGGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCg > 1:1287160/1‑90 (MQ=255) ccgAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTggtggt > 1:1797050/1‑139 (MQ=255) ccgAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTggtggt < 2:1797050/139‑1 (MQ=255) gagaCAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCACCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGccccccc > 2:144778/1‑150 (MQ=255) aCAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATc > 1:367520/1‑150 (MQ=255) gCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAgc > 2:1403315/1‑113 (MQ=255) gCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAgc < 1:1403315/113‑1 (MQ=255) gCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACg < 2:1722105/150‑1 (MQ=255) tGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACggg > 2:718701/1‑150 (MQ=255) aTCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGCCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCt > 2:864826/1‑150 (MQ=255) ccccACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCttt < 1:296526/150‑1 (MQ=255) ccccACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCttt > 1:507687/1‑150 (MQ=255) cccACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAg > 1:194835/1‑60 (MQ=255) cccACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAg < 2:194835/60‑1 (MQ=255) cccACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTg > 1:315247/1‑150 (MQ=255) cccACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTg > 1:1407524/1‑150 (MQ=255) ccACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTgg > 2:1650015/1‑150 (MQ=255) aCTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGt > 1:1548531/1‑150 (MQ=255) tGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGa < 1:1163357/150‑1 (MQ=255) gCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGAtt > 2:147593/1‑150 (MQ=255) gCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGAtt < 2:340353/150‑1 (MQ=255) cTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTgg > 1:525508/1‑142 (MQ=255) 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cATCAGCTGACGACCCCTGACTGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGc > 2:465089/1‑150 (MQ=255) aTCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCaaa < 1:737865/76‑1 (MQ=255) aTCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCaaa > 2:737865/1‑76 (MQ=255) aTCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGcc > 1:1286222/1‑150 (MQ=255) aTCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCATTGGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGcc > 1:1788005/1‑150 (MQ=255) cAGCTGTCGACAGCTGATGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTa < 1:1424328/107‑1 (MQ=255) cAGCTGTCGACAGCTGATGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTa > 2:1424328/1‑107 (MQ=255) cTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTtgg > 2:1270442/1‑98 (MQ=255) cTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTtgg < 1:1270442/98‑1 (MQ=255) cTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCa > 2:1744371/1‑150 (MQ=255) aCAGGTGGTGGTACCGGTTGACCGTTAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAg < 2:946036/150‑1 (MQ=255) aCAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAg < 1:718701/150‑1 (MQ=255) aCAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCCTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAg > 2:1087737/1‑150 (MQ=255) | AGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAC‑CGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAG > NC_002947/2171562‑2171853 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |