| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,347,665 | G→C | 6.4% | S308T (AGC→ACC) | PP_2064 → | multidrug RND transporter membrane fusion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,347,665 | 0 | G | C | 6.4% | 238.7 / 6.2 | 78 | S308T (AGC→ACC) | PP_2064 | multidrug RND transporter membrane fusion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/41); new base C (2/3); total (34/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.83e-01 | |||||||||||
TGCAGCCGGGTATGTATGCCGGCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAGCCCGTGGCGCAGGACAGCCTGCAG > NC_002947/2347518‑2347813 | tGCAGCCGGGTATGTATGCCGGCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGcc < 2:1120821/150‑1 (MQ=255) aGCCGGGTATGTATGCCGGCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCgg‑g > 1:925423/1‑150 (MQ=255) cGGGTATGTATGCCGGCGTGCGGCTGGCTGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGCTCACCCGG‑GTGc < 2:1681115/150‑1 (MQ=255) gggTATGTATGCCGGCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCa < 1:905170/150‑1 (MQ=255) ggcatgtatgCCGGCGTTCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTCGCCGTGCCGGCAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGCCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCac > 2:741794/4‑149 (MQ=255) ggTATGTATGCCGGCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTTCACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGCTCACCCGG‑GTGcca < 2:84424/150‑3 (MQ=255) ggTATGTATGCCGGCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAg < 2:1378500/150‑1 (MQ=255) ggTATGTATGCCGGCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAg < 1:1317720/150‑1 (MQ=255) ggTATGTATGCCGGCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAg < 1:1317652/150‑1 (MQ=255) tgtatgCCGCCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAATCCGTGATTACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTaa < 1:1171654/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCgg > 1:1378835/1‑150 (MQ=255) cGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGa < 2:1517756/150‑1 (MQ=255) ggCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCt < 2:1329846/150‑1 (MQ=255) gCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGCCCGCGCTGACAGTGACGGATAACGCGAGCACCGACACGGCCTTGGGGCAGACGGTGGTGGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTg > 2:1163544/1‑150 (MQ=255) gCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTg > 2:1513299/1‑150 (MQ=255) cTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTgg < 1:662518/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGCTCACCCGG‑GTGc > 2:45154/1‑123 (MQ=255) aTGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGCTCACCCGG‑GTGc < 1:45154/123‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGGCGGGAGTCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGCCCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAggg < 1:1745711/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCgg < 2:1921574/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCgg < 1:1314385/150‑1 (MQ=255) gcAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGt < 1:367156/150‑1 (MQ=255) cAGCCGTGGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTg < 2:336815/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCAcc > 1:31468/1‑150 (MQ=255) aCCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGAAATACAGCATGTCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCAcc > 1:230636/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTc < 1:847727/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCg < 2:1361996/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCg > 2:1072969/1‑150 (MQ=255) cGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGaa > 1:261040/1‑133 (MQ=255) cGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGaa < 2:261040/133‑1 (MQ=255) ccGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCgg > 2:144302/1‑87 (MQ=255) ccGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCgg < 1:144302/87‑1 (MQ=255) cGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCg > 2:1627293/1‑150 (MQ=255) gagATCACCTAGACCGCCTGTGGGGAGGCGGTGCGTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGTACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGGAACCCCCGGTGAGCGCGGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCgt < 2:410180/148‑1 (MQ=255) gATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGa > 2:1328406/1‑96 (MQ=255) gATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGa < 1:1328406/96‑1 (MQ=255) cACCTACACCGCCTATAGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTgtggt < 2:968742/150‑1 (MQ=255) aCCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTgtgttg > 1:190184/1‑150 (MQ=255) cTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTggtggt > 1:726203/1‑150 (MQ=255) tACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGTCCTGGCTGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGtt > 1:1261383/1‑150 (MQ=255) tACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTgtggtg > 1:277417/1‑147 (MQ=255) tACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTgtggtg < 2:277417/147‑1 (MQ=255) acacCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGttt > 1:336438/1‑150 (MQ=255) cGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCgg > 1:484621/1‑150 (MQ=255) gCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGATGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGc > 1:1262707/1‑150 (MQ=255) cTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCa < 1:1832985/150‑1 (MQ=255) gggCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTg > 2:1302160/1‑150 (MQ=255) gCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGGCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGaa > 2:1908797/1‑150 (MQ=255) cAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGAGACGGGAGGAATGCACCTCCGTCCTGAGGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGaaa > 1:1377178/1‑150 (MQ=255) cGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGa < 2:1769296/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGa < 1:1759409/150‑1 (MQ=255) ggTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAg > 2:1702827/1‑150 (MQ=255) ggTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAg > 2:1374204/1‑150 (MQ=255) tttGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGAt < 1:1072969/150‑1 (MQ=255) tttGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGAt < 1:61263/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCCACCCAGGACCCGGAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATg < 1:165090/150‑1 (MQ=255) tCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCa > 1:693183/1‑150 (MQ=255) tCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCa > 1:207342/1‑150 (MQ=255) cgACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGc < 2:336438/150‑1 (MQ=255) ccAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTgtggtg < 2:751358/112‑1 (MQ=255) ccAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTgtggtg > 1:751358/1‑112 (MQ=255) ccAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGt > 1:1218502/1‑150 (MQ=255) ccAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGt > 2:308049/1‑150 (MQ=255) ccagACCCGCAGCATGGCCCCCGGGTGAGCCGGCGTACCGCT‑ACCGGCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGCAGTGCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATTCCGGTc < 1:423534/147‑1 (MQ=255) cAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTc < 1:1055656/150‑1 (MQ=255) aGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCg > 1:1577563/1‑150 (MQ=255) gACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAg < 1:1513299/150‑1 (MQ=255) gACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAg < 1:1163544/150‑1 (MQ=255) cccGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAGcc < 1:120840/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAGccc > 1:1858100/1‑150 (MQ=255) cGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAGCCCg < 2:31468/150‑1 (MQ=255) gcagcaTGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCAcc > 1:1698386/1‑73 (MQ=255) gcagcaTGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCAcc < 2:1698386/73‑1 (MQ=255) cagcaTGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAGCCCGTg < 1:790644/150‑1 (MQ=255) agcaTGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAGCCCGTgg < 2:532520/150‑1 (MQ=255) ctgCACCCGGCTCACCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAGCCCGTGGCGCa > 1:759687/3‑150 (MQ=255) aGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGCGCGCTGGGAGTGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAGCCCGTGGCGCAGGACAGCCTGCAg < 1:887714/150‑1 (MQ=255) aGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAGCCCGTGGCGCAGGACAGCCTGCAg < 2:1858100/150‑1 (MQ=255) | TGCAGCCGGGTATGTATGCCGGCGTGCGGCTGGATGCTGCGCAGCCGTCGACCGTGCTGGCCGTGCCGGAAACCGCGATCACCTACACCGCCTATGGGCAGACGGTGTTTGTCGCGACCCAGGACCCGCAGCATGGCACCCGGGTGAGCCGG‑GTGCAGGTAACCACCGGTGAGCGCTGGCAGGGGCGGGTGGAAATCACCTCCGGCCTGACGCCCGGTGACCGTGTGGTGGTTTCCGGCCAGCTGAAACTGAGTGATGGCATGCCGGTCGAGCCCGTGGCGCAGGACAGCCTGCAG > NC_002947/2347518‑2347813 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |