Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,475,329 | T→G | 5.6% | intergenic (‑85/+72) | tal ← / ← dusA | transaldolase/tRNA dihydrouridine synthase DusA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,475,329 | 0 | T | G | 5.6% | 195.4 / 3.8 | 73 | intergenic (‑85/+72) | tal/dusA | transaldolase/tRNA dihydrouridine synthase DusA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/28); new base G (2/2); total (42/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.31e-01 |
GTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTGCCGACAG > NC_002947/2475185‑2475478 | ggccccGGGGGCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGccc < 1:665351/148‑1 (MQ=255) agacattcacaaggcggctgaacccttggcggtgtttgaccaggccgtggagttgttgcaggggcggtgacctcagagggagggaacctcgggcttgcttgcgactcgaatcttcacctttcgtacagccctgTGCGGACCCGCTGGccc < 2:1229168‑M1/17‑1 (MQ=255) cGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGcaca < 2:757397/150‑1 (MQ=255) gCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTa > 1:461115/1‑150 (MQ=255) gCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTa > 1:1116989/1‑150 (MQ=255) gCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTa > 1:461105/1‑150 (MQ=255) gACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCGGTACg > 1:756174/1‑150 (MQ=255) ccACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGaa > 2:1262989/1‑150 (MQ=255) cACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCCGCTTGGAGGTCATGGGTGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGaaa < 1:547838/150‑1 (MQ=255) cACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTCCCAGCTTCGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACACATCGCTTCCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGaaa < 1:125153/150‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAg > 1:147325/1‑150 (MQ=255) ggtggtGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGt < 1:1639485/150‑1 (MQ=255) ggtggtGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGt < 1:1639606/150‑1 (MQ=255) ggtggtGAACTGCTTGAGATGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTAAAGGGCCGCCGAAACGCTGCGGGCCTGCTTGCCCGCACAGGTCTGTACGAAAGGt > 2:1753720/1‑150 (MQ=255) gtggtgAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTg < 2:1515210/150‑1 (MQ=255) tggtgAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGa < 1:905181/150‑1 (MQ=255) ggtgAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGaa < 2:1253372/150‑1 (MQ=255) cTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCg > 1:569404/1‑150 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTGCCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTc < 2:824717/150‑1 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCACCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACACGCTGGCCCGCACAAGGCCGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTc > 1:1866317/1‑150 (MQ=255) ttgttCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGGCCAGCGGGTCCGcagg > 1:243616/1‑114 (MQ=255) ttCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGGCATGTGCATTTACTCGGCATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGCCgcaagca‑a > 1:365917/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGcc > 2:278158/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGcc > 1:1189623/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGGAGGTCATGCGCTTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGCCATTACCCGAGCCCCGGCAGCCCCTCAAGCGCCGCCGCCACCCTGCGGCCCCCCTGCCCCCCCCAGGGCTCTACGACCGGTGCACATTCGAGTCtcacgccaccc > 2:839127/1‑145 (MQ=255) gCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTa > 1:99291/1‑116 (MQ=255) gCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTa < 2:99291/116‑1 (MQ=255) ttGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGGATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCCGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAg > 2:1119624/1‑150 (MQ=255) ttGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAg > 1:1049389/1‑150 (MQ=255) gAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGtt < 1:632266/150‑1 (MQ=255) gAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGtt > 2:604281/1‑150 (MQ=255) aGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGCACCGCCGTCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTtc < 2:259748/150‑1 (MQ=255) aTGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTtccctcc > 1:57007/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTtccctcc > 1:271523/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTtccc < 1:1024399/147‑1 (MQ=255) aTGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTtccc > 2:1024399/1‑147 (MQ=255) gggCGTGCCCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTccctccct < 2:1042000/150‑1 (MQ=255) gTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGa < 2:147325/150‑1 (MQ=255) gTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGa < 1:1262989/150‑1 (MQ=255) gTGCTATGTCCTGTGCATTTACTTGACATTATCCGAGACCTGGCAGCCGCGCAAGGACCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAGAGGGGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGa > 2:420245/1‑150 (MQ=255) tctGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTc > 1:979763/1‑150 (MQ=255) aTTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGca > 2:1489048/1‑150 (MQ=255) aTTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGca > 1:1815262/1‑150 (MQ=255) aTTTACTCGACATTACCCGAGCCCAGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGca > 1:258135/1‑150 (MQ=255) tCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCaacaacc > 2:1765056/1‑149 (MQ=255) aCATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACACCTCCa > 2:22931/1‑150 (MQ=255) gttgctgccGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACGGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTCCAACCACTCCACGGCCTg > 2:769690/8‑150 (MQ=255) ccGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGTTTAAGATTCGAGTCGCAAGAA‑ACCCCGACTTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTg > 1:1869686/1‑150 (MQ=255) ccGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTg > 1:250355/1‑150 (MQ=255) ccGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCCCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTg > 2:1363988/1‑150 (MQ=255) ccGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACACTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTAAGAAAGGGGAAGATTCGCGACGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTg > 1:134037/1‑150 (MQ=255) ccccGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCaa > 2:1339559/1‑150 (MQ=255) cttcacctttcgtacagccctgTGCGGGCCAGCGGGTCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCaa < 1:1229168‑M1/128‑1 (MQ=255) cGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCTAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCaa < 1:278158/150‑1 (MQ=255) aaGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAg < 1:158977/83‑1 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aaCCCTGCCGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTtgt < 1:893776/150‑1 (MQ=255) aaCCATGCGGCCCCGCTGGCACGCACAGGGCTGCACTAACGGTGTAGACTCGAGCCGAAAGTA‑TGCCCTTTGTTCCCTCCCTCTTAGGTCACCGCCCCTGCAACACCCCCACGGCCTGGTCAAACTCCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTtgt < 1:894876/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCAACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGaa > 1:1337955/1‑150 (MQ=255) cTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGtt < 1:921831/70‑1 (MQ=255) cTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGtt > 2:921831/1‑70 (MQ=255) TGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATg < 2:1889378‑M1/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCACGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCTCCGCCCCTGCAACAACTCCACCGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTGc < 2:979763/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCCCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTGc < 1:1363988/150‑1 (MQ=255) cccGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTGcc < 2:271523/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGCCTAGA‑ACAGACGTACCGGTCCAGGATTTCTCCGTTGCATTTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGTTCAAACACCGCCAAGGTGGCAGCCGCCTTGTGAATGTCTGCCg > 1:35751/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTGCCGa > 2:1738849/1‑150 (MQ=255) atGGCCCGAAAACGGTTTTACTAAATGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTGCCGACa < 2:1049389/149‑1 (MQ=255) tGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCCCCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTGCCGACAg < 1:604281/150‑1 (MQ=255) | GTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGAAGATTCGAGTCGCAAGCA‑AGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTGCCGACAG > NC_002947/2475185‑2475478 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |