| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,497,485 | G→A | 5.5% | S223N (AGC→AAC) | PP_2192 → | ECF family RNA polymerase sigma‑70 factor/transmembrane sensor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,497,485 | 0 | G | A | 5.5% | 213.6 / 2.4 | 73 | S223N (AGC→AAC) | PP_2192 | ECF family RNA polymerase sigma‑70 factor/transmembrane sensor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/33); new base A (2/2); total (38/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.64e-01 | |||||||||||
TCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAATGCTGCCACCTTCAGCGTGCAGCGC > NC_002947/2497340‑2497630 | tCGGTGGTGTTGGTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTg < 1:952564/150‑1 (MQ=255)tCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATCATTGCTGCGGTGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTg < 1:1772897/150‑1 (MQ=255)tCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTGGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACTGGTGAGGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTg < 1:447907/150‑1 (MQ=255) ggtggtGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGc > 2:107477/1‑150 (MQ=255) gtggtgTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCATAATTTGGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCg > 1:98724/1‑150 (MQ=255) gtgtTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTc > 2:1470851/1‑150 (MQ=255) tgtTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCa > 2:734904/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGc < 1:107477/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCAt < 1:1098632/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCAt > 1:1843389/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATg > 2:1787896/1‑150 (MQ=255) ccgcTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAAc < 1:1392105/150‑1 (MQ=255) gcTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACgg > 1:572552/1‑150 (MQ=255) tgGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCgtg < 2:709677/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGngtg < 2:1186436/150‑1 (MQ=255) cGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTTTTCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTgg > 2:1214457/1‑150 (MQ=255) ttGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAAc > 2:794491/1‑137 (MQ=255) ttGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAAc < 1:794491/137‑1 (MQ=255) agcaAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATg < 1:1702716/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTgg < 1:599912/111‑1 (MQ=255) aaGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTgg > 2:599912/1‑111 (MQ=255) aaGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCgg < 2:920333/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCgg > 1:1127639/1‑150 (MQ=255) tggcgaCTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGAGGCGGGTGAg > 1:543850/6‑150 (MQ=255) ccGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAg < 1:318833/150‑1 (MQ=255) aTACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCg < 1:1205170/150‑1 (MQ=255) gCCGATTACCACACCGCCGTGCGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCgag > 2:640488/1‑150 (MQ=255) cGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACCGGTGGTGGTAGTCTATTTGGGTGCGGCGTTGTTCgggca > 2:781349/1‑146 (MQ=255) cGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAACGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGAc > 2:186895/1‑150 (MQ=255) cGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAACGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGAc > 2:1138297/1‑150 (MQ=255) gATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTgg < 2:1782247/91‑1 (MQ=255) gATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTgg > 1:1782247/1‑91 (MQ=255) ccACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGc < 1:1291119/98‑1 (MQ=255) ccACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGc > 2:1291119/1‑98 (MQ=255) cacaCCGCCGTGGTCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCg < 1:521923/94‑1 (MQ=255) cacaCCGCCGTGGTCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCg > 2:521923/1‑94 (MQ=255) acacCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGAtcggaagag > 2:1476111/1‑144 (MQ=255) gTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACACTGAAAGATGGCACACGGGTGAAGCGGAACAGGGCCAGTGACTTGAGCGTGGAGTTCAGCGAGAATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGAACGCCGATGATTCACGt > 2:602584/1‑150 (MQ=255) gAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCGTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGttt > 1:712091/1‑150 (MQ=255) gAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGttt > 2:1259477/1‑150 (MQ=255) gAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGttt < 1:1013557/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTtgtg < 2:1092735/150‑1 (MQ=255) gCAGGTCATTTCCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTTTGTTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGt < 1:81040/150‑1 (MQ=255) gTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGAGATTCGATGCGGGCGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGaa > 2:536806/1‑150 (MQ=255) tCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACCCGAAGAGCGTCGTGTGGGGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGaaa > 2:989196/1‑150 (MQ=255) cATTACCCTGACAGATGGCACAGGGGTGATGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAAc < 2:799705/150‑1 (MQ=255) cATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAAc < 1:1248435/150‑1 (MQ=255) aTTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACg > 1:1432693/1‑150 (MQ=255) aTTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACg > 2:653720/1‑150 (MQ=255) cccTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCg < 2:1843389/150‑1 (MQ=255) ccTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGAGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCgg > 1:247268/1‑150 (MQ=255) cTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGt < 1:1393138/150‑1 (MQ=255) aGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCgg > 2:286504/1‑86 (MQ=255) aGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCgg > 2:287281/1‑86 (MQ=255) aGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCgg < 1:287281/86‑1 (MQ=255) aGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCgg < 1:286504/86‑1 (MQ=255) aGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGcgcg > 1:1683497/1‑150 (MQ=255) aTGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTgcgc < 2:255047/147‑1 (MQ=255) aTGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTgcgc > 1:255047/1‑147 (MQ=255) acacGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTACCTAAAGCATGTACTGCGTTTGATTCTCGATCCGGAAGAGGCTTTGTCCGTACAATTCGTTGGTTTTGGTCCTGTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAg < 1:1469672/150‑1 (MQ=255) cacGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAACGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAgg < 1:186895/150‑1 (MQ=255) cacGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAACGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAgg < 1:1138297/150‑1 (MQ=255) ggTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCaa > 2:812037/1‑150 (MQ=255) aCGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAAtgct < 1:1847155/150‑1 (MQ=255) aCGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAAtgct < 2:572552/150‑1 (MQ=255) aCGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAAtgct < 1:1167280/150‑1 (MQ=255) gCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAAtgctgc < 1:781349/150‑1 (MQ=255) gCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGATCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGGGGCGTTATCGGAGGAACCCGCGCGTTCACTGCCGTGTGTTGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAAggctgg > 1:697393/1‑149 (MQ=255) aaCAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAATGCTGCCAcc > 1:1149966/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAATGCTGCCACCTTCa > 1:1711124/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCgg < 2:422729/115‑1 (MQ=255) cTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATGCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCgg > 1:422729/1‑115 (MQ=255) ttGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGAGGCGGGTGAGGCGGTGTAAGAGACCGCGGGTGATTCCCATCTATTTTTTATCAAATCGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAATGCTGCCACCTTCAGCGTGCAgcgc > 1:895508/1‑150 (MQ=255) | TCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAATGCTGCCACCTTCAGCGTGCAGCGC > NC_002947/2497340‑2497630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |