Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,525,497 | C→T | 6.2% | A159A (GCC→GCT) | fadBA → | type II 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,525,497 | 0 | C | T | 6.2% | 181.0 / 2.1 | 64 | A159A (GCC→GCT) | fadBA | type II 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/29); new base T (2/2); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.45e-01 |
ATCAACGTCAACCTGATCGGCAGCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAGGTACGTGCTTC > NC_002947/2525351‑2525646 | atcaACGTCAACCTGATCGGCAGCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCAATATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGgccgcc < 1:814767/150‑1 (MQ=255) tcaACGTCAACCTGATCGGCAGCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCt > 1:767590/1‑150 (MQ=255) aCCTGATCGGCAGCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCt < 2:1701050/150‑1 (MQ=255) ccTGATCGGCAGCTTCAGCCGGTTGCGTCTGGCTGCGGCGTGCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCACCAACACGGCCTCCAGTGCCGCCTACGACCGCCAGATGGGCCAGGCCGGCGTcg‑ccggccc > 2:213571/1‑146 (MQ=255) cTGATCGGCAGCTTCAACCTGTTGAGTCAGGGTTCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTcc > 1:988939/1‑150 (MQ=255) tGATCGGCAGCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCa > 2:1277026/1‑150 (MQ=255) gATCGGCAGCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCaa < 1:82944/150‑1 (MQ=255) ggCAGCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCTGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGt > 2:1599606/1‑150 (MQ=255) ggCAGCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCTGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGt > 2:1599269/1‑150 (MQ=255) ggCAGCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGt < 1:1388076/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCAACCTGTTGCGTGTGGCTGCGGCGGACATGGCCGAAGGGGCTGCCGATTAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACTCGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGc < 2:426136/150‑1 (MQ=255) gCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGACATGGCCGAAGTGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCa < 2:780536/150‑1 (MQ=255) cTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTGCG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCAt > 2:1086699/1‑150 (MQ=255) gCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCAAAGGGGCTGCCGATGATAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGAc > 2:1263213/1‑150 (MQ=255) ggCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTgcc < 1:899163/150‑1 (MQ=255) gcggcgGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGGGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGAGCTCAACGTGGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTgccggcc < 1:329688/150‑1 (MQ=255) ccATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTAGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGCTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCAGCcgcgcgcg > 2:244461/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGaa > 1:817105/1‑150 (MQ=255) cGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGc > 2:744644/1‑150 (MQ=255) cGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATAGGCCAGGCCGCCTACG‑CCCACATGAAATGTCCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGc < 1:330869/150‑1 (MQ=255) gAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCa > 2:1912766/1‑150 (MQ=255) gggCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCt > 1:1865221/1‑150 (MQ=255) gCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGc > 2:331839/1‑150 (MQ=255) ccGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTCCAGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCa > 1:346720/1‑150 (MQ=255) gATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCa > 1:1444219/1‑106 (MQ=255) gATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCa < 2:1444219/106‑1 (MQ=255) tGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCC‑ACGTTTTCCACCAAGGGTGCCATTGGCAGCCTGACCTTGACGGCTGCGCGGGAACTGGCACGCTTCGGCATCCg > 1:34660/1‑150 (MQ=255) gagaGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCgt < 1:829322/150‑1 (MQ=255) agCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTT‑GGCATCCGTGtga < 2:1254497/150‑1 (MQ=255) cggcgAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGtgat < 2:1865221/150‑1 (MQ=255) aGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCa < 1:1263213/150‑1 (MQ=255) gCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCAt < 2:590594/150‑1 (MQ=255) tGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGc > 1:688477/1‑150 (MQ=255) gggTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTc < 2:351075/150‑1 (MQ=255) tcatcatcaACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCgg < 1:660848/150‑1 (MQ=255) tcatcatcaACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCgg > 2:451982/1‑150 (MQ=255) tcatcaACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTa > 2:1701158/1‑150 (MQ=255) atcgACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATc > 2:1459930/1‑150 (MQ=255) tcaACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCgg > 1:822830/1‑144 (MQ=255) tcaACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCgg < 2:822830/144‑1 (MQ=255) tcaACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCt > 2:245699/1‑150 (MQ=255) tcaACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCGACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCt < 1:591942/150‑1 (MQ=255) caACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGc > 2:1127459/1‑75 (MQ=255) caACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGc < 1:1127459/75‑1 (MQ=255) aaCACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCttt > 1:220820/1‑150 (MQ=255) acacGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTg > 1:1528506/1‑150 (MQ=255) acGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGa > 2:1406290/1‑149 (MQ=255) acGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGa < 1:1406290/149‑1 (MQ=255) ggCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAAc < 1:1701158/150‑1 (MQ=255) gccgccTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTatgatg < 2:1659599/150‑1 (MQ=255) ccgccTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATgg > 1:1000262/1‑150 (MQ=255) aCGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGa < 1:1912766/150‑1 (MQ=255) ccAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTgg < 1:432718/77‑1 (MQ=255) ccAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTgg > 2:432718/1‑77 (MQ=255) ccAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATcc > 2:1698033/1‑92 (MQ=255) ccAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATcc < 1:1698033/92‑1 (MQ=255) ccAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTcc > 2:1417627/1‑111 (MQ=255) ccAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTcc < 1:1417627/111‑1 (MQ=255) cAGATTGGCCAGGACGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGAt < 2:877048/150‑1 (MQ=255) aTTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAg < 2:767590/150‑1 (MQ=255) aTTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCCAATGGCCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAg < 1:1277026/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAGGTAc > 1:305936/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAGGTAc > 1:1014836/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAGGTACGt < 1:1599606/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAGGTACGt < 1:1599269/150‑1 (MQ=255) cgccTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAGGTGCTTGCTTc > 1:1021691/1‑150 (MQ=255) | ATCAACGTCAACCTGATCGGCAGCTTCAACCTGTTGCGTCTGGCTGCGGCGGCCATGGCCGAAGGGGCTGCCGATGAGAGCGGCGAGCGTGGGGTCATCATCAACACGGCCTCCATTGCCGCCTATGACGGCCAGATTGGCCAGGCCGCCTACG‑CCGCCTCCAAGGGTGCCATTGCCAGCCTGACCTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAGGTACGTGCTTC > NC_002947/2525351‑2525646 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |