Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,868,532 | G→T | 7.9% | intergenic (+28/‑903) | PP_2520 → / → PP_2522 | hypothetical protein/transposase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,868,532 | 0 | G | T | 7.9% | 235.9 / 6.8 | 77 | intergenic (+28/‑903) | PP_2520/PP_2522 | hypothetical protein/transposase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/31); new base T (3/3); total (42/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.66e-01 |
GCTAATGTCGCGTCAAGCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTGACTACATTCCCGCGCTGGCTGACGTGCCG > NC_002947/2868384‑2868678 | gcTAATGTCGCGTCAAGCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGt > 2:379075/1‑150 (MQ=255) cTAATGTCGCGTCAAGCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTc > 2:374259/1‑150 (MQ=255) tctGTCGCGTCAAGCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGACTGTACAAGCCCTCCTGCGCTGCTGGCGTTGTCAGCCTTCCTGGGGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCaa < 2:1653854/148‑1 (MQ=255) tCGCGTCAAGCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCaagaga > 1:1653854/1‑148 (MQ=255) gTCAAGCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTg > 1:122210/1‑150 (MQ=255) gTCAAGCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTg > 2:1532258/1‑150 (MQ=255) tCAAGCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGc < 1:374259/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCTTGACGAAGACTgag < 2:1520235/150‑3 (MQ=255) gCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCt > 1:820975/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTAAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTc < 2:1641249/150‑1 (MQ=255) tCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTAAGGTGATTTTTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCgtcgtc > 1:703167/1‑150 (MQ=255) cGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTAATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTATTTCTGAATGTGTAATCTCACCCGCTCAGTCTTCCTCAATGAGACTTCCCCTCGCCGTCGTCt < 2:498445/150‑1 (MQ=255) gcagcaAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTgg < 2:820975/150‑1 (MQ=255) gcagcaAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTgg > 1:1833059/1‑150 (MQ=255) gcagcaAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTgg < 2:929537/150‑1 (MQ=255) cagcaAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTggg < 1:379075/150‑1 (MQ=255) cagcaAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTggg < 2:1718995/150‑1 (MQ=255) caAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGAt > 1:1636405/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCCGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGAtt < 2:1633938/150‑1 (MQ=255) tGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATa > 1:11445/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATAc > 1:1501174/1‑150 (MQ=255) cTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGcc > 2:308573/1‑150 (MQ=255) cTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCATATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCGCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGcc < 2:1438869/150‑1 (MQ=255) tGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCt > 1:1461459/1‑150 (MQ=255) tGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCt > 1:867439/1‑150 (MQ=255) aGACCTCATGCGCTACTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGTTTATGGTTATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGTATTGATACAGGGCCTTCCATg > 1:1279810/1‑150 (MQ=255) aCCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATg > 1:1001335/1‑148 (MQ=255) aCCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCCTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATg < 2:1001335/148‑1 (MQ=255) aTGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGc < 2:1501174/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGc > 1:1547890/1‑150 (MQ=255) cgcTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACATAAATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGt < 1:1841650/150‑1 (MQ=255) gctgGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGCTGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCATTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGCCCTTCCATGCAAACGCTGTTGaa < 2:948665/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACga < 1:308573/150‑1 (MQ=255) gCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACgag < 1:1619676/150‑1 (MQ=255) gCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCAATGCAAACGCTGTTGAACgag < 2:122210/150‑1 (MQ=255) gTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAAc > 2:178500/1‑145 (MQ=255) gTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAAc < 1:178500/145‑1 (MQ=255) aGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCga > 2:1301918/1‑150 (MQ=255) gCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCgaag < 1:1532258/150‑1 (MQ=255) tGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCATCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGCGATTCTCGAAGAAGTAc > 2:584204/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCTTGACGAAGACTgag < 1:133140/76‑3 (MQ=37) ggTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCTTGACGAAGACTgag > 2:133140/1‑74 (MQ=38) ggTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTg > 2:367698/1‑91 (MQ=255) ggTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTg < 1:367698/91‑1 (MQ=255) gatgatgaCGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTcc > 2:1216069/1‑150 (MQ=255) atgaCGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCt > 2:1854196/1‑116 (MQ=255) atgaCGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCt < 1:1854196/116‑1 (MQ=255) ttATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGAt > 2:957284/1‑145 (MQ=255) ttATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGAt < 1:957284/145‑1 (MQ=255) tGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAgg < 1:1544519/150‑1 (MQ=255) gTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCtt < 2:600087/137‑1 (MQ=255) gTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCtt > 1:600087/1‑137 (MQ=255) gTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGc > 1:132663/1‑150 (MQ=255) gTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGc > 2:233455/1‑150 (MQ=255) gTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCACCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGc > 2:261015/1‑150 (MQ=255) gTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGATCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGc > 1:1095987/1‑150 (MQ=255) tGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAgg < 2:331732/85‑1 (MQ=255) tGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAgg > 1:331732/1‑85 (MQ=255) aTTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCaaa < 1:1539314/150‑1 (MQ=255) ttCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCt < 2:1267190/150‑1 (MQ=255) ttCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCt < 2:132663/150‑1 (MQ=255) tCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTg > 2:532362/1‑150 (MQ=255) cTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCATCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTGa < 1:584204/150‑1 (MQ=255) aaTGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGAATCTCGAAGAAGGACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCACAGTAGCTGACTa > 2:312244/1‑150 (MQ=255) tgtgATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCtt > 1:777858/1‑119 (MQ=255) tgtgATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCtt < 2:777858/119‑1 (MQ=255) tgATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTGACTACATTcc > 2:1253955/1‑150 (MQ=255) ccGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTGACTACATTCCCGCgctggc > 2:424741/1‑150 (MQ=255) ccGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTGACTACATTCCCGCgctggc > 1:1407106/1‑150 (MQ=255) tCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGCCGAGGTACTTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTGACTACATTCCCGCGCTGGCTGAc < 1:233455/150‑1 (MQ=255) gcAGTCTTCTTGACGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGt > 1:917462/2‑73 (MQ=38) gcAGTCTTCTTGACGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGt < 2:917462/72‑1 (MQ=38) gcAGTCTTCTTGACGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTGACTACATTCCCGCGCTGGCTGAc > 2:956102/2‑150 (MQ=255) gTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTGACTACATTCCCGCGCTGGCTGACGTg > 1:264150/1‑150 (MQ=255) ttCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTAc > 1:275439/1‑91 (MQ=255) ttCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTAc < 2:275439/91‑1 (MQ=255) ttCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTGACTACATTCCCGCGCTGGCTGACGTGCCg > 1:1385552/1‑150 (MQ=255) | GCTAATGTCGCGTCAAGCTGTGCCGCTCGGCAGCAAGCTGTTGGCCTGTAAAAGACCTCATGCGCTGCTGGCGTTGTCAGGCTTCCTGGTGATGATGACGCTTATGGTGATTTGTTTCTGAATGTGTGATCTCTCCCGCTCAGTCTTCGTCAAGAAGACTGCCCCTCGCCGTCGTCTGGGGATTGATACAGGGCCTTCCATGCAAACGCTGTTGAACGAGATTCTCGAAGAAGTACGTCCCTTGATCGGCAAGGGCAAAGTCGCTGACTACATTCCCGCGCTGGCTGACGTGCCG > NC_002947/2868384‑2868678 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |