| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,024,258 | G→C | 5.3% | intergenic (+30/+124) | dapA‑II → / ← PP_2640 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase/GNAT family acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,024,258 | 0 | G | C | 5.3% | 242.8 / 3.7 | 76 | intergenic (+30/+124) | dapA‑II/PP_2640 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase/GNAT family acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/37); new base C (2/2); total (37/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
AGGCGGCATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGGCG > NC_002947/3024113‑3024405 | aGGCGGCATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCGAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAgccgc < 1:633320/150‑1 (MQ=255) gcggcATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCGGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCGACGGTTGATGGCGGGTTGACAAgccgccc > 2:1546983/1‑149 (MQ=255) tGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCttggttgg < 1:1586217/150‑1 (MQ=255) aaaGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTc > 2:1110519/1‑150 (MQ=255) aGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCACCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCgg < 1:313781/150‑1 (MQ=255) gCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCggg < 2:1110312/150‑1 (MQ=255) gCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCggg < 1:60048/150‑1 (MQ=255) aTTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTcgg < 1:481421/150‑1 (MQ=255) aGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGAt > 1:363689/1‑150 (MQ=255) aGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGAt < 2:697145/150‑1 (MQ=255) aCGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGc > 1:131224/1‑150 (MQ=255) gAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGAt < 1:246762/146‑1 (MQ=255) gAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGAt > 2:246762/1‑146 (MQ=255) gAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCt > 1:759232/1‑150 (MQ=255) gAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGCTTGTCAACCCGCca > 1:690400/1‑117 (MQ=255) gAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCGGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGCTTGTCAACCCGCca < 2:690400/117‑1 (MQ=255) cTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTcgc < 2:1406458/150‑1 (MQ=255) ccATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCggg > 2:384698/1‑123 (MQ=255) ccATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCggg < 1:384698/123‑1 (MQ=255) ccATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTCAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGGCCAGCCGCCACACCCTTGGCTGGTTCGGCGCCGGCGGCTGCCTCGCGCACGGAttc > 2:318884/1‑149 (MQ=255) aTGCAGACGTTCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCt < 1:200263/150‑1 (MQ=255) aTGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCt < 1:199949/150‑1 (MQ=255) gCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCtt > 1:638311/1‑99 (MQ=255) gCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCtt < 2:638311/99‑1 (MQ=255) gCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAAcg > 1:1847637/1‑150 (MQ=255) gCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAAcg < 1:678210/150‑1 (MQ=255) gAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCt > 2:1291297/1‑150 (MQ=255) aTACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCgg < 2:1557369/104‑1 (MQ=255) aTACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCgg > 1:1557369/1‑104 (MQ=255) caccCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGCTTGTCAACCCGCca > 2:1869672/1‑82 (MQ=255) caccCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGCTTGTCAACCCGCca < 1:1869672/82‑1 (MQ=255) cccGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGAAGTAAGCAGTAGCCTTTAATGATGGGTGGTGGATAAGCTGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACaga > 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aCTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAg < 1:1110519/150‑1 (MQ=255) aCTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAg < 1:1291297/150‑1 (MQ=255) cTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAgg > 1:981630/1‑150 (MQ=255) tGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCttggttg > 1:1058331/1‑80 (MQ=255) tGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCttggttg < 2:1058331/80‑1 (MQ=255) tGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAggg > 1:1699661/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAgc < 2:402993/61‑1 (MQ=255) cAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAgc > 1:402993/1‑61 (MQ=255) cAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGcc < 1:1748285/150‑1 (MQ=255) aaaGCGTGCTGTGTTTACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCg > 2:390186/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACTGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCGACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCTGCGGATGCCTCGCGAGCGGAGTTCTGCCAGCAACGCGCTGCGACAGAGTATTGCCAGGGCCGcaaa < 2:755849/150‑4 (MQ=255) tGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGcaaagc > 2:1245031/1‑145 (MQ=255) tgtTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGccc > 1:702026/1‑150 (MQ=255) tgtTCACTCAGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGccc > 1:89016/1‑150 (MQ=255) ttCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGAt < 2:1308558/81‑1 (MQ=255) ttCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGAt > 1:1308558/1‑81 (MQ=255) ttaCTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCAAAGCGGCCCTgg < 1:390186/148‑2 (MQ=255) aCTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGcc < 1:1560451/144‑1 (MQ=255) aCTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGcc > 2:1560451/1‑144 (MQ=255) tCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAg < 2:1801188/86‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAg > 1:1801188/1‑86 (MQ=255) gcCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGAccc < 2:204861/149‑1 (MQ=255) gcCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGAccc > 1:204861/1‑149 (MQ=255) ccggAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCa < 2:174256/147‑1 (MQ=255) cTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAg < 2:759232/150‑1 (MQ=255) tGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAgg < 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< 2:981630/150‑1 (MQ=255) ggCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGctggctgg < 2:931089/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTc < 1:67033/119‑1 (MQ=255) gCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTc > 2:67033/1‑119 (MQ=255) gggTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTc > 2:249230/1‑150 (MQ=255) gggTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGAGTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTc > 2:1383175/1‑150 (MQ=255) gTTGACAAGCCGAGACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCATTTACGCTCTGAGACAGAGTATTGACAGGGTAGTTTTGTGATTTGATCCCGACCCCATTTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCgg < 1:1383175/150‑1 (MQ=255) tGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCa < 1:568338/150‑1 (MQ=255) aCAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAgg > 2:625996/1‑150 (MQ=255) cAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGgc < 2:89016/150‑1 (MQ=255) aaGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGgcg > 1:455788/1‑150 (MQ=255) aaGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGgcg > 1:1286344/1‑150 (MQ=255) gccgccACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGACAGGGCCGCAAAGCGGCCCt > 1:1397121/1‑104 (MQ=255) | AGGCGGCATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGGCG > NC_002947/3024113‑3024405 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |