Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,080,456 | C→T | 5.7% | L129L (CTG→CTA) | PP_2690 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,080,456 | 0 | C | T | 5.7% | 202.6 / 2.5 | 71 | L129L (CTG→CTA) | PP_2690 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/30); new base T (2/2); total (39/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.71e-01 |
CCTGCTCGGGTGAACAGCACCATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTCCACCACCGTGGCGGCGCAGCGCAACACGCTCTGGC > NC_002947/3080307‑3080604 | ccTGCTCGGGTGAACAGCACCATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGc > 2:1180116/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCGGGTGAACAGCACCATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGc > 2:1179825/1‑150 (MQ=255) gCTCGGGTGAACAGCACCATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGc < 2:189885/150‑1 (MQ=255) cTCGGGTGAACAGCACCATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGcc > 2:690807/1‑150 (MQ=255) tCGGGTGAACAGCACCATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGccc < 2:323301/150‑1 (MQ=255) tGAACAGCACCATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGcc > 2:1240501/1‑149 (MQ=255) aGCACCATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGGATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCGTCCCCTGCACAGCt > 1:1340937/1‑150 (MQ=255) cACCATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCTTGTGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGGGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGc < 1:773387/150‑1 (MQ=255) ccATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGccc < 1:518230/150‑1 (MQ=255) aTTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGTCCGGGGTTCACTGCGCAGTTCCGGGCGCGGCACGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGGCTCGGCGGGCGTCCTCCGCGCGGGCTTGCCCGTGGCCCCCCTGCACCGCTGCCCgg > 2:665656/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACCGCTGCCGGGCtgccgtg > 2:1543288/1‑144 (MQ=255) ttGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTa > 2:1430097/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGc < 1:1460455/150‑1 (MQ=255) ccGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGTAGCCCCTGCACAGCt < 2:1112072/128‑1 (MQ=255) ccGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGTAGCCCCTGCACAGCt < 2:1110095/128‑1 (MQ=255) ccGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGTAGCCCCTGCACAGCt > 1:1112072/1‑128 (MQ=255) ccGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGTAGCCCCTGCACAGCt > 1:1110095/1‑128 (MQ=255) ccGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCTCGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCcagca > 2:992705/1‑150 (MQ=255) cTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCcagcaaca < 1:1283057/150‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCCACCGCaaa > 1:753980/1‑150 (MQ=255) aTGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCaaa < 1:23420/150‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCaaa < 1:850290/150‑1 (MQ=255) ggggCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGTCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTtgt < 1:1564617/150‑1 (MQ=255) gggCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCCGCAACAGCAAACGGTtgtg > 2:239649/1‑150 (MQ=255) gggCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTtgtg < 1:879162/150‑1 (MQ=255) gggCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCATCGCGTCGTGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTtgtg > 1:1176101/1‑150 (MQ=255) ccGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCa > 1:215051/1‑150 (MQ=255) ccGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCa > 2:599469/1‑150 (MQ=255) gTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTgg > 2:1228894/1‑150 (MQ=255) tttCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAACTCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGc < 1:1444800/150‑1 (MQ=255) tttCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGc > 2:1303925/1‑150 (MQ=255) aCTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCg < 1:377938/147‑1 (MQ=255) aCTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCg > 2:377938/1‑147 (MQ=255) cTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCgg < 2:965108/105‑1 (MQ=255) cTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCgg > 1:965108/1‑105 (MQ=255) tGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCaaa < 1:1606927/128‑1 (MQ=255) tGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCaaa > 2:1606927/1‑128 (MQ=255) tGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATgc > 1:139648/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGc > 1:1109871/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGc > 1:744442/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGc < 1:268818/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGAGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGc > 2:1402353/1‑150 (MQ=255) gcgGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGT‑GTAGTTCAGCCTGaa > 2:902311/1‑149 (MQ=255) gcgGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑c < 1:1430097/150‑1 (MQ=255) cATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑Ccaca > 1:1320820/1‑150 (MQ=255) ccGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCAGCTGGCGCCCTACCAGAGGGCCTGCACTTGCAACCCCGGCACAGCTGCCCTTCTCTGGTAGCCCAACAACAGCAAACAGTTGTTGCAGTGCGGCATGC‑GCAGGTCGACCTTC‑CCACAgcgc > 2:690300/1‑150 (MQ=255) cggcggTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCa < 1:690807/150‑1 (MQ=255) aaaaTCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTTAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTTTCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCtt < 1:1179825/150‑1 (MQ=255) aaaaTCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAAATGCAAACGGCTGTGTCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCtt < 1:1180116/150‑1 (MQ=255) aaaTCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTg < 1:1605232/150‑1 (MQ=255) aaaGCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGGGCATGGCCTTg < 1:1000373/150‑1 (MQ=255) tCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAAATAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCt > 1:704710/1‑150 (MQ=255) cccAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTgccg > 1:1621390/1‑150 (MQ=255) gTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAg > 1:938206/1‑150 (MQ=255) gTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTc < 1:1228894/150‑1 (MQ=255) tATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTcc < 1:902311/150‑1 (MQ=255) tATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTcc > 1:1838745/1‑150 (MQ=255) gcgggcgTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACTGTTGTGGCAGTGGAGCCTCCACCCGTTC‑‑CTGGAGCCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTCcaccac > 1:424941/1‑150 (MQ=255) gggcgTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTCCACCACCg > 1:1656353/1‑150 (MQ=255) tccCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGc < 1:1164251/82‑1 (MQ=255) tccCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGc > 2:1164251/1‑82 (MQ=255) tccCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑c > 1:456127/1‑103 (MQ=255) tccCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑c < 2:456127/103‑1 (MQ=255) tccCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTgccgc > 2:1582348/1‑128 (MQ=255) tccCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTgccgc < 1:1582348/128‑1 (MQ=255) cccAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTCCACCACCGTGGCGgcgc < 1:1394545/150‑1 (MQ=255) aGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTCCACCACCGTGGCGgcgcagc < 1:876555/150‑1 (MQ=255) tGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTCCACCACCGTGGCGGCGCAGCGCAACACg < 1:599469/150‑1 (MQ=255) aCGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTCCACCACCGTGGCGGCGCAGCGCAACACGctc > 1:1764326/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTtgtg < 2:1771655/57‑1 (MQ=255) gTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTtgtg > 1:1771655/1‑57 (MQ=255) gCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTCCACCACCGTGGCGGCGCAGCGCAACACGCTCTGGc > 2:1720423/1‑150 (MQ=255) gCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTCCACCACCGTGGCGGCGCAGCGCAACACGCTCTGGc > 1:1751669/1‑150 (MQ=255) | CCTGCTCGGGTGAACAGCACCATTACGTCTTGCGCGGCCGCTTCAATGGCCTGGGGCCGGGTTTCACTGCTCAGTTCCGGGCGCGGCATGCCGGCGGTAAAATCGGCCCAGTGGTATCGGCGGGCGTCCTCCCAGCGGGCTTGCACGTGCAGCCCCTGCACAGCTGCCCGGCTCAGGTAGCCCAGCAACAGCAAACGGTTGTGGCAGTGGCGTATGC‑GCAGTTCAGCCTGA‑CCACAGCGCATGGCCTTGGCTGCCGCCAGTTCCACCACCGTGGCGGCGCAGCGCAACACGCTCTGGC > NC_002947/3080307‑3080604 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |