| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,144,958 | G→A | 7.2% | S108N (AGC→AAC) | PP_2760 → | ribose ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,144,958 | 0 | G | A | 7.2% | 276.9 / 6.4 | 96 | S108N (AGC→AAC) | PP_2760 | ribose ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (49/40); new base A (3/4); total (52/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
TTGCCTTCGGCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCGAAAACACCGTGC > NC_002947/3144814‑3145107 | ttgccttCGGCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATcg > 1:325130/1‑150 (MQ=255) tgccttCGGCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGCTGACAACATcgc < 1:1162644/150‑1 (MQ=255) gccttCGGCCTGCCCACTGGGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGTTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCTGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGCTGACAACATcgaa < 2:382453/150‑3 (MQ=255) cttCGGCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTAG‑GCGATGTTGGCAGCATcgctgg > 1:272814/1‑147 (MQ=255) ttCGGCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCcgcg > 2:273134/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGCTGCAAACATcgccg > 2:839838/1‑148 (MQ=255) ttCGGCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGCTGACAACATcgccg < 1:839838/148‑1 (MQ=255) ttCGGCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGGGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCcgcg > 2:807548/1‑150 (MQ=255) gCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGCTGACAACATcgc > 2:507137/1‑142 (MQ=255) gCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGCTGACAACATcgc < 1:507137/142‑1 (MQ=255) cTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGGGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCtt > 1:722490/1‑150 (MQ=255) gACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTgg < 1:1689099/150‑1 (MQ=255) cACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGGGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCAc > 2:1553114/1‑150 (MQ=255) tcGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTAG‑GCGGTGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCa > 1:407312/1‑150 (MQ=255) gcggcggcTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCg > 2:341730/1‑150 (MQ=255) cTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGCGGGCGGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCt < 1:1454268/150‑1 (MQ=255) tCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTAG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTg > 1:384598/1‑150 (MQ=255) gAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGaa < 2:830634/150‑1 (MQ=255) gAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGaa > 2:1305016/1‑150 (MQ=255) ggtgTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCGCGCTGAGTGGGCt > 2:1542432/1‑150 (MQ=255) gtgtCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCtg < 2:1784169/150‑1 (MQ=255) gtCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGCCCGTTGG‑‑AGGCTGAACAGCGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCtggt < 2:731357/150‑1 (MQ=255) tCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCtggtg > 1:658334/1‑150 (MQ=255) ggCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGGCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGGGGTCg > 1:1853501/1‑150 (MQ=255) gCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCgg > 1:251504/1‑150 (MQ=255) cTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGGGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTTG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGt > 1:411732/1‑150 (MQ=255) cTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATc < 2:312498/120‑1 (MQ=255) cTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCCCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATc > 1:312498/1‑120 (MQ=255) ttGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCtt < 2:546985/101‑1 (MQ=255) ttGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCtt > 1:546985/1‑101 (MQ=255) ttGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGtt > 1:486422/1‑150 (MQ=255) gATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTc > 2:1412254/1‑150 (MQ=255) gATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTc > 1:268970/1‑150 (MQ=255) gATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTc < 2:909941/150‑1 (MQ=255) gcTGTCGCGGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCg > 2:505642/2‑150 (MQ=255) cTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGt < 1:341730/150‑1 (MQ=255) tGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGtt > 1:933915/1‑150 (MQ=255) tGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGtt > 2:461673/1‑150 (MQ=255) tGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGtt > 2:1554875/1‑150 (MQ=255) tGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCACGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGtt > 1:1544089/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGGCGGCCAACCTCGTGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTTGTGCGCAATT‑TCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGttt < 1:1553114/150‑1 (MQ=255) gcggcCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGccgccg < 2:1231792/150‑1 (MQ=255) ggcCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCgct > 1:1749447/1‑150 (MQ=255) ggcCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCgct > 1:1229335/1‑150 (MQ=255) cAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCgctgct > 1:92214/1‑150 (MQ=255) cAACCTCGGGTTGTCCGCTGCG‑‑CCATGCCCGAGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCgctgct < 1:941198/150‑1 (MQ=255) aaCCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTAAG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGctgctg < 1:1367084/150‑1 (MQ=255) ccTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGc > 1:1827325/1‑150 (MQ=255) tCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCtggtgg < 1:1689832/117‑1 (MQ=255) tCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCtggtgg > 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aTGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCtgg < 1:807548/150‑1 (MQ=255) gCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCtggtg < 2:486422/150‑1 (MQ=255) gCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTAAGCGTAGGTGCGACGTTTGTCACTGTCCGGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCtggtg < 2:1366158/150‑1 (MQ=255) cc‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCtggtgg > 1:596455/1‑150 (MQ=255) cTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCggg < 1:824361/150‑1 (MQ=255) tGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGc > 2:1738214/1‑150 (MQ=255) aacGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGTCTACCGGCGCATTCCTTTTTCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGaa > 1:974866/1‑150 (MQ=255) acGCCGGTTTCG‑GCTATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAAc < 1:1271277/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTCCCTATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTg < 1:1366481/150‑1 (MQ=255) tttCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCt > 2:543150/1‑150 (MQ=255) tttCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGACCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTg < 2:1067673/145‑1 (MQ=255) tttCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGACCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTg > 1:1067673/1‑145 (MQ=255) cG‑GCGATGCTGACAACATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGAc > 2:827517/1‑150 (MQ=255) gCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCg > 2:137554/1‑150 (MQ=255) gATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCGaa < 2:251504/150‑1 (MQ=255) gATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCGaa < 1:461673/150‑1 (MQ=255) ttgtCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCGAAAaca > 2:1546255/1‑150 (MQ=255) ttgtCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCGAAAaca < 1:1738214/150‑1 (MQ=255) aGCATCGCCGCGACGCTTGGCAGTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGGTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGATCTGGTGCTGACCGAAAACACCGtg < 2:272814/150‑1 (MQ=255) aGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCGAAAACACCGtg > 1:937013/1‑150 (MQ=255) aGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCGAAAACACCGtg < 1:1546255/150‑1 (MQ=255) gCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCGAAAACACCGtgc > 2:840598/1‑150 (MQ=255) gCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCCATGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCGGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCGAAAACACCGtgc > 2:686859/1‑150 (MQ=255) | TTGCCTTCGGCCTGACCACGGTGATCATCGGCGGCGGCTCGAACGTGGTGTCCGGTGGGCTTGATCTGTCGCTGGCGGCCAACCTCGGGTTGTCCGCTGCGGTCTATGCC‑‑AGCCTGAACAACGCCGGTTTCG‑GCGATGTTGTCAGCATCGCCGCGACGCTTGGCACTGGCCTGGCCATCGGCACGCTGAATGCGCTGGTGGTGGTCGGTTTCCGTTTGCCGCCGCTGCTGGCGACCCTGGCCACGATGAACCTGGTGGCCGGGCTGGAACTGGTGCTGACCGAAAACACCGTGC > NC_002947/3144814‑3145107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |