| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,161,249 | A→T | 5.1% | Q26L (CAG→CTG) | PP_2776 → | homocysteine S‑methyltransferase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,161,249 | 0 | A | T | 5.1% | 233.4 / 4.0 | 79 | Q26L (CAG→CTG) | PP_2776 | homocysteine S‑methyltransferase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/45); new base T (2/2); total (32/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.66e-01 | |||||||||||
GGTCGCCGCCAATCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGAGGAACGCTTTGCGC > NC_002947/3161107‑3161395 | ggTCGCCGCCAATCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGaa < 1:1739282/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCCAATTAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATg > 1:443507/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCAATCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATg < 2:1443575/150‑1 (MQ=255) ccgccCATCAGCCGACCGTCGATCGTTGGTTGCGTACCACTGGCACCCAGCTGGCTGCCCAACGACTCGGCGTGCCTCGACTTTGCTCGCTGCCAGGCCGGGACGAGAACTCTATCGGATCGGGGTACCATTCCCGCCGCCGGCATGGTc > 2:592653/1‑150 (MQ=255) ccgccAATCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCTGCCGGaag > 1:666564/1‑145 (MQ=255) ccgccAATCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCTGCCGGaag < 2:666564/146‑2 (MQ=255) ccgccAATCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTc < 1:537256/150‑1 (MQ=255) ccgccAATCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTc < 2:1674572/150‑1 (MQ=255) ccAATCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCATGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGc > 1:1564324/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTTGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGTCAGCCGGAATGGTCGGCACTg < 2:166950/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTg > 1:1879097/1‑150 (MQ=255) cGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCt < 1:215409/150‑1 (MQ=255) aCCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGTACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGt < 1:646104/150‑1 (MQ=255) cGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCGGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTc > 1:1716524/1‑150 (MQ=255) cGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTc > 1:1428389/1‑150 (MQ=255) tCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGtt > 1:1531651/1‑147 (MQ=255) tCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGtt < 2:1531651/147‑1 (MQ=255) tCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGa > 2:750070/1‑150 (MQ=255) cGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGaa < 2:616412/150‑1 (MQ=255) ggttgAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGtt > 1:1012032/1‑138 (MQ=255) ggttgAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGtt < 2:1012032/138‑1 (MQ=255) ttgAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAAt > 2:1890964/1‑150 (MQ=255) ctgggTGCCAGTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTTGCGCTGTTCGGAGCGCCCGAAt > 2:750985/5‑150 (MQ=255) tgAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACCATGCCTCAAGCGGATGGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATa < 1:705045/150‑1 (MQ=255) gTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGt < 1:178242/150‑1 (MQ=255) tGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTg < 1:1412753/150‑1 (MQ=255) gCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGa < 2:1823177/150‑1 (MQ=255) ccACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAGTGGCTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGAc > 1:257811/1‑150 (MQ=255) cACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACg > 2:1871350/1‑150 (MQ=255) cACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACg > 2:115156/1‑150 (MQ=255) cTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCa > 2:866699/1‑150 (MQ=255) tGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGt > 1:501335/1‑143 (MQ=255) tGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGt < 2:501335/143‑1 (MQ=255) ggCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAgg < 1:552272/150‑1 (MQ=255) cACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGtt < 1:866699/150‑1 (MQ=255) aCCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTc > 2:213691/1‑122 (MQ=255) aCCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTc < 1:213692/122‑1 (MQ=255) aCCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTc < 1:213691/122‑1 (MQ=255) aCCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTc > 2:213692/1‑122 (MQ=255) ggTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCCGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGa < 1:803035/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGc < 2:1879097/150‑1 (MQ=255) gCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGGTATAAGCGCCCGCATACGTGACGACAGTTCACCGAGCGTTCa > 1:144/1‑150 (MQ=255) ccAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCAtt < 1:782871/150‑1 (MQ=255) cAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCAtcg > 1:1596954/1‑148 (MQ=255) gACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTgccgc < 2:1629186/150‑1 (MQ=255) tCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCgg > 2:1419939/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCgggg < 2:1284279/150‑1 (MQ=255) gCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAgg < 1:115156/150‑1 (MQ=255) cTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGt > 2:455324/1‑150 (MQ=255) ttGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAACCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATcacc < 1:1637681/150‑1 (MQ=255) cGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCaa < 2:83030/150‑1 (MQ=255) gATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAAc < 1:1189736/150‑1 (MQ=255) gtggGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCt > 2:1516981/1‑150 (MQ=255) gtggGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCt > 1:981601/1‑150 (MQ=255) gaCGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGATATCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCggtgg < 1:489048/150‑1 (MQ=255) aCGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCggtggt < 1:1286879/150‑1 (MQ=255) gagaACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGgcgc < 2:130522/57‑1 (MQ=255) gagaACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGgcgc > 1:130522/1‑57 (MQ=255) gagaACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGc < 2:68825/150‑1 (MQ=255) aaatCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGGACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGt < 2:370757/147‑1 (MQ=255) cTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGttt < 1:236411/150‑1 (MQ=255) cTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGttt < 1:1871350/150‑1 (MQ=255) tCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCt > 1:414644/1‑132 (MQ=255) tCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCt < 2:414644/132‑1 (MQ=255) aaGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTa < 2:471634/114‑1 (MQ=255) aaGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTa > 1:471634/1‑114 (MQ=255) gATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTgg > 1:454845/1‑150 (MQ=255) cGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGa < 2:335440/150‑1 (MQ=255) cGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGa < 1:455324/150‑1 (MQ=255) cGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGa < 1:1240697/150‑1 (MQ=255) cGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGa < 2:1398832/150‑1 (MQ=255) cGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTCCCAAGCGACCGAATATGTAAGACGGTCTCACCGCGCCGACATTTCCGCCTTGTCCATGTTAAGTACCACCAACAGCTACTCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGa < 2:1161872/150‑1 (MQ=255) accattCCGGCTGCCGGAAGGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGtt < 2:82281/128‑1 (MQ=255) aCCATTCCGGCTGCCGGAAGGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGtt > 1:82281/1‑132 (MQ=255) ttCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGAGGAACGCttt > 1:212104/1‑150 (MQ=255) ttCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGAGGAACGCttt > 1:1776558/1‑150 (MQ=255) ttCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGAGGAACGCttt < 2:1776558/150‑1 (MQ=255) tCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGAGGAACGCTTTg < 2:443507/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATCCGTGCCGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTTCCGCTGGAGCCAGCGAAATCGCGACGAACGGCTACGGGGTTGTGCCGTTTCACATTGGCGAGGAACGCTTTgcgc < 1:976421/150‑1 (MQ=255) | GGTCGCCGCCAATCAGGCGACCGTCGATCGTTGGTTGAGTGCCACTGGCACCCAGGTGGCTGCCCAATGACTCGGCGTGCCTGGACTTTGCTCGATGGTGGGATGGGACGAGAACTCAAGCGGATCGGCGCACCCTTCCGGCAGCCGGAATGGTCGGCACTGGCGCTGTTCGAAGCGCCCGAATACGTGACGCAGGTTCACCGAGCGTTCATTGCCGCCGGGGCCAGGGTAATCACCACCAACAGCTACGCGGTGGTGCCGTTTCACATTGGCGAGGAACGCTTTGCGC > NC_002947/3161107‑3161395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |