| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,344,389 | C→G | 6.6% | Q261H (CAG→CAC) | PP_2941 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,344,389 | 0 | C | G | 6.6% | 238.4 / 7.5 | 76 | Q261H (CAG→CAC) | PP_2941 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/34); new base G (2/3); total (39/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.49e-01 | |||||||||||
CCATTCTCGAAGGGAAGGTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCATCCACTC > NC_002947/3344241‑3344538 | ccATTCTCGAAGGGAAGGTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACt < 2:1036640/150‑1 (MQ=255) aTTCTCGAAGGGAAGGTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGa > 2:1306637/1‑150 (MQ=255) cGAAGGGAAGGTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCAGTGAAGCgg < 1:1098076/150‑1 (MQ=255) gaagggaaggTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTGGATGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGc < 1:1277609/150‑1 (MQ=255) aaggTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTAtc < 2:1206175/150‑1 (MQ=255) aaggTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTAtc > 1:1606061/1‑150 (MQ=255) aaggTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTAtc > 2:1813888/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCgg < 1:396639/137‑1 (MQ=255) aTGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCgg > 2:396639/1‑137 (MQ=255) aaCAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCtt > 2:676814/1‑150 (MQ=255) aCGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGc < 1:1606017/150‑1 (MQ=255) aGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTATAGTAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTg < 1:51419/150‑1 (MQ=255) gTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGGCCCCGATGCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTgg > 2:51419/1‑150 (MQ=255) tCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGc > 2:1135341/1‑150 (MQ=255) gAAAAGTCGAGCTGGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCCCAGCGCCGTGAGTACGAACATTTGCaaa > 2:802228/1‑149 (MQ=255) gAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAAt > 1:415586/1‑150 (MQ=255) aGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCt < 1:1813888/150‑1 (MQ=255) gCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCtg > 2:378285/1‑150 (MQ=255) gCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCtg > 2:906036/1‑150 (MQ=255) cTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCa > 1:880678/1‑150 (MQ=255) cTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCCCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCa > 2:853900/1‑150 (MQ=255) ttGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCAc < 1:1135341/150‑1 (MQ=255) ctgcCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGTTTCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGAt < 1:595126/150‑1 (MQ=255) ctgcCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGCGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGAt < 1:583544/150‑1 (MQ=255) gcCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATAc < 1:802228/150‑1 (MQ=255) gcCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATAc < 1:378285/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCTACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATAcc > 2:1347110/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATAcc > 1:410610/1‑150 (MQ=255) aGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTTGACCACCTGCGAATCTGTGCATCCGATTCACTGAAGGGCCTCTATAAGCTCAGCTTCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATAGCAc > 1:133007/1‑150 (MQ=255) aGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCAc > 1:743223/1‑150 (MQ=255) gTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTc > 1:948642/1‑150 (MQ=255) aGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCTACCGAAGCGACGGAGGAGTCGAAGGATGCCGAAACGATGCGGCCGCTTCACTGAAGCGGGTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGaa < 2:415586/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAgg > 2:211310/1‑150 (MQ=255) cGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCg < 2:1606061/150‑1 (MQ=255) gAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCgg > 1:213398/1‑150 (MQ=255) gACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACAtt < 1:627806/97‑1 (MQ=255) gACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACAtt > 2:627806/1‑97 (MQ=255) aCCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCgg < 1:1078997/63‑1 (MQ=255) aCCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCgg > 2:1078997/1‑63 (MQ=255) cccACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAgg < 1:1163797/150‑1 (MQ=255) ccACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGt > 1:1615738/1‑150 (MQ=255) aCCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTg > 1:891650/1‑150 (MQ=255) gCAACCACGGGCAGGTCTACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAgc < 1:1347110/150‑1 (MQ=255) gggCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTg > 1:235683/1‑150 (MQ=255) ggCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGc < 2:54293/150‑1 (MQ=255) aGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTAGAAGACCTCGGCTGACTCGCCCAGGTTGAACGGCATCTTCTCg > 2:1545606/1‑150 (MQ=255) ggTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCgg < 1:211310/150‑1 (MQ=255) gTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAgg > 2:915006/1‑110 (MQ=255) gTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAgg < 1:915006/110‑1 (MQ=255) gACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCgg < 1:1690837/113‑1 (MQ=255) gACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCgg > 2:1690837/1‑113 (MQ=255) caccTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGt < 1:1741521/148‑1 (MQ=255) caccTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGt > 2:1741521/1‑148 (MQ=255) ccTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCt > 2:1870703/1‑143 (MQ=255) ccTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGc > 2:1352010/1‑150 (MQ=255) ccTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGc < 2:743223/150‑1 (MQ=255) ccTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCGTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCt < 1:1870703/143‑1 (MQ=255) gCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCg > 1:1428798/1‑150 (MQ=255) gCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCg > 2:13959/1‑150 (MQ=255) gtgCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTcgcg < 1:1306637/150‑1 (MQ=255) agaGCCGCTTCAGTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTc > 1:782777/3‑126 (MQ=255) agaGCCGCTTCAGTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTc < 2:782777/124‑1 (MQ=255) aGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTc < 1:231694/68‑1 (MQ=255) aGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTc > 2:231694/1‑68 (MQ=255) aGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGtt < 2:357306/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTCAGTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTcgc < 2:657067/144‑1 (MQ=255) gCCGCTTCAGTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTcgc > 1:657067/1‑144 (MQ=255) gCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAgg > 2:810950/1‑106 (MQ=255) gCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAgg < 1:810950/106‑1 (MQ=255) gCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCAt < 1:676814/150‑1 (MQ=255) cTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCATc < 1:13959/150‑1 (MQ=255) cTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGCGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGcc > 1:1916329/1‑111 (MQ=255) cTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGCGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGcc < 2:1916329/111‑1 (MQ=255) cACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCATCCAc < 2:1428798/150‑1 (MQ=255) aCTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCggctg < 1:1441496/87‑1 (MQ=255) aCTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCggctg > 2:1441496/1‑87 (MQ=255) cTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTAACAGGTTGCCTCCACTc > 2:1847305/1‑150 (MQ=255) | CCATTCTCGAAGGGAAGGTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCATCCACTC > NC_002947/3344241‑3344538 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |