Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,532,796 | C→T | 9.2% | G144S (GGC→AGC) | PP_3121 ← | transcriptional regulator, LysR family |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,532,796 | 0 | C | T | 9.2% | 169.0 / 6.1 | 66 | G144S (GGC→AGC) | PP_3121 | transcriptional regulator, LysR family |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/30); new base T (3/3); total (32/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.76e-01 |
GCCACGAAATCTTCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCGGCATGGCTGCCACC > NC_002947/3532648‑3532944 | gCCACGAAATCTTCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGccc > 1:1711960/1‑150 (MQ=255) ccACGAAATCTTCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCa > 2:936770/1‑150 (MQ=255) ccACGAAATCTTCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCa < 2:81021/150‑1 (MQ=255) aCGAAATCTTCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGt > 2:395487/1‑150 (MQ=255) cGAAATCTTCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGtt > 1:1156354/1‑150 (MQ=255) cGAAATCTTCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGtt < 1:401706/150‑1 (MQ=255) cGAAATCTTCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGtt > 1:1425878/1‑150 (MQ=255) aTCTTCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGAc < 2:1614643/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGAcgcg > 1:1329459/1‑150 (MQ=255) tCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACgcgg < 1:1879551/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACCACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGAAGCCCAGGTCGCCGCGGCGATGGCGTACCAGTTc > 2:309524/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTc < 1:395487/150‑1 (MQ=255) cAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTcc > 1:1921543/1‑150 (MQ=255) aGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCt < 2:1215125/150‑1 (MQ=255) cttgggCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTg > 1:1371795/4‑150 (MQ=255) cTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTg > 1:1210502/1‑150 (MQ=255) ggggGAGCAGTGTCAACGGCCAGTCGGCGGGCACTACGTCCACGAAGCGCTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGCTGGCGTAACAGTTCCTGTACCTGtt < 2:688230/150‑1 (MQ=255) ggggCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGtt < 2:1210502/150‑1 (MQ=255) gggCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTg > 1:453779/1‑150 (MQ=255) ggCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGc > 1:169999/1‑150 (MQ=255) cggcggCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGa < 1:1594068/150‑1 (MQ=255) ggcCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGGGTACCAGTTCCTGTACCTGtt < 2:1508381/122‑1 (MQ=255) ggcCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGtt > 1:1508381/1‑122 (MQ=255) gcCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCTCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTg > 2:280770/1‑150 (MQ=255) gcCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCTCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTg > 2:280798/1‑150 (MQ=255) gcCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCTCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTg > 2:280708/1‑150 (MQ=255) ccACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGa > 2:1711944/1‑150 (MQ=255) ccACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGa < 2:1450999/150‑1 (MQ=255) tACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGAt < 2:59876/92‑1 (MQ=255) tACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGAt > 1:59876/1‑92 (MQ=255) aCGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTg < 2:1227667/150‑1 (MQ=255) cGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTgg < 1:1003177/150‑1 (MQ=255) ggCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGATGTCCAGCCCATCGATGTTTTCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGGGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATTACGTCGTGCACGGGTACGTTTGCCTTggg < 2:1553171/150‑1 (MQ=255) ggCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGCTGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTggg < 1:1667790/150‑1 (MQ=255) ggCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTAGCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTggg > 1:527146/1‑150 (MQ=255) aaCGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTa < 1:1472147/104‑1 (MQ=255) aaCGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTa > 2:1472147/1‑104 (MQ=255) aCGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAg > 1:451913/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAgc < 2:1156354/150‑1 (MQ=255) gAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTg > 1:769510/1‑142 (MQ=255) gAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTg < 2:769510/142‑1 (MQ=255) gAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAgcg > 1:1055591/1‑150 (MQ=255) aaGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAgcgc < 1:418683/150‑1 (MQ=255) gCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTg > 2:1258028/1‑150 (MQ=255) gTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCa > 1:1647030/1‑62 (MQ=255) gTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCa < 2:1647030/62‑1 (MQ=255) cATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGaaa < 2:1921543/150‑1 (MQ=255) aTGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAac < 2:1425878/150‑1 (MQ=255) aCGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCCAAGCCGATGCACAGTTCGACGCTGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTTGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGa < 1:881888/150‑1 (MQ=255) aaGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTTAGTGTAGGGGAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTgg > 1:1039679/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGGTGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTgggg > 2:929788/1‑150 (MQ=255) tCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGTTTTCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGc > 1:1434771/1‑150 (MQ=255) cAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCTCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCaa < 1:280798/150‑1 (MQ=255) cAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCTCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCaa < 1:280708/150‑1 (MQ=255) cAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCTCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCaa < 1:280770/150‑1 (MQ=255) gCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACa > 2:866630/1‑150 (MQ=255) tCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCaaaa > 1:1822068/1‑150 (MQ=255) gCTCGCAGCCGACGCCCAGTTCGACTCTGCGTTGACGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCAAGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCg < 1:882666/150‑1 (MQ=255) gCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCCCGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCg < 1:883305/150‑1 (MQ=255) cGAAGCCGATGCCCAGTTCGGCGCGGCGATGGCGTACCAGTTACTGTACCGGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCGGCa < 2:251325/150‑1 (MQ=255) aaGCCGATGCCCATTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTGCCTGTGTGCTTGATCAGTGGGTACTTTGACCTTGGATTAGAGCTGGCGAAACCCATTGTGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCGGCATg < 1:896607/150‑1 (MQ=255) aGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCGGCATgg > 1:940090/1‑150 (MQ=255) aGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCCTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCGGCATgg > 2:66707/1‑150 (MQ=255) tGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCGGCATGGCTGCCa < 1:866630/150‑1 (MQ=255) tGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCGGCATGGCTGCCa < 2:1711960/150‑1 (MQ=255) gCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTgggg < 1:600935/114‑1 (MQ=255) gCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTgggg > 2:600935/1‑114 (MQ=255) cccAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCGGCATGGCTGCCAcc < 2:1866137/150‑1 (MQ=255) | GCCACGAAATCTTCGGCCATCAGCTGTGCCCAGCTGACCTGGGGCAGCAGTGCCAAGGGCGAGTCGGCGGCCACTACGGCAACGAAGCGGTCCATGTACAACGGGTGGAAGTCCAGCCCATCGATGTTATCCGGCTCGAAGCCGATGCCCAGTTCGACGCGGCGATGGCGTACCAGTTCCTGTACCTGTTCGTTGATCACGTCGTGCACCGTGACGTTGACCTTGGGGTAGCGCTGGCGAAACACCTTGAGCGAGTGGGGCAACAGGTTGCCGGCAAAAGCCGGCATGGCTGCCACC > NC_002947/3532648‑3532944 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |