| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,651,399 | C→T | 5.2% | P80S (CCG→TCG) | PP_3217 → | aliphatic sulfonate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,651,399 | 0 | C | T | 5.2% | 223.2 / 2.2 | 77 | P80S (CCG→TCG) | PP_3217 | aliphatic sulfonate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/29); new base T (2/2); total (46/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
TACAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCGGCCATCT > NC_002947/3651255‑3651543 | tACAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGAATGCTTGTTGACTCGCCGccc < 2:1911676/150‑1 (MQ=255) aCAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCCGGCTCCCCGGAGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGcccc < 2:1606630/150‑1 (MQ=255) aaCGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTg > 2:256133/1‑150 (MQ=255) gCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGGCGCGTCGcccagcagg < 2:46071/150‑7 (MQ=255) tCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCt > 1:719519/1‑150 (MQ=255) gTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCg < 2:719519/150‑1 (MQ=255) tGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCCCGCCGTGGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCgg > 1:1669979/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGgc < 2:1727970/150‑1 (MQ=255) aGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCCATCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGgc > 1:1771428/1‑150 (MQ=255) cgccgGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGcc > 2:1219017/1‑150 (MQ=255) cgccgGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGcc > 1:1777705/1‑150 (MQ=255) gTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCgg > 1:653637/1‑128 (MQ=255) gTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCgg < 2:653637/128‑1 (MQ=255) tGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAgg > 2:785777/1‑150 (MQ=255) tGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGACCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAgg > 1:1636825/1‑150 (MQ=255) gatAGAACAACTGCCTTACCCCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGt < 2:204598/148‑1 (MQ=255) cTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTg > 2:306896/1‑150 (MQ=255) tAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGa > 2:937017/1‑150 (MQ=255) gAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGAtt > 2:1328420/1‑150 (MQ=255) caacTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCg < 1:256133/150‑1 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGcgccgc > 2:1518385/1‑102 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGcgccgc < 1:1518385/102‑1 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCg < 2:1711180/146‑1 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCg > 1:1711180/1‑146 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCa > 2:1276048/1‑150 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCa < 2:1777705/150‑1 (MQ=255) ccTTACACCGTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCCCATGGACGGCCGAATCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGGGATTTGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTGCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGc < 1:424406/150‑1 (MQ=255) ttACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCg > 2:1867457/1‑150 (MQ=255) ttACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCg > 1:1099021/1‑150 (MQ=255) ttACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCg < 1:537300/150‑1 (MQ=255) acCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAg > 1:573914/1‑150 (MQ=255) ccTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTg < 1:684615/134‑1 (MQ=255) ccTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTg > 2:684615/1‑134 (MQ=255) ccTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGaa < 2:573914/150‑1 (MQ=255) ccTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGaa < 1:785777/150‑1 (MQ=255) ccTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGaa > 2:928631/1‑150 (MQ=255) cTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAAc > 2:1869714/1‑150 (MQ=255) ggAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAg < 1:1219017/150‑1 (MQ=255) gAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAg‑‑g > 2:546494/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGt > 1:1234944/1‑150 (MQ=255) aGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTgg < 1:367385/150‑1 (MQ=255) ttCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGcc > 2:1306006/1‑150 (MQ=255) cGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGGTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCt > 2:833362/1‑150 (MQ=255) gCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTg > 1:1384838/1‑90 (MQ=255) gCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTg < 2:1384838/90‑1 (MQ=255) gCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTg < 2:855911/150‑1 (MQ=255) cAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTgg < 2:1568170/150‑1 (MQ=255) cccGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCaa > 2:1497863/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAg < 1:1328420/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAg > 2:1673318/1‑150 (MQ=255) ggCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATtc < 1:1276048/150‑1 (MQ=255) gCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGccc < 1:745713/57‑1 (MQ=255) gCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGccc > 2:745713/1‑57 (MQ=255) gCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGGCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATtct > 1:972452/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTcc > 2:1908211/1‑150 (MQ=255) aaGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACTTCCTAG‑‑TGTTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGa < 1:833362/150‑1 (MQ=255) aGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGTCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTg < 2:606117/121‑1 (MQ=255) aGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGTCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTg > 1:606117/1‑121 (MQ=255) tCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCcaca > 2:1501306/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCcaca > 2:1215650/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCcaca > 2:1097868/1‑150 (MQ=255) cGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCAACGAGCACCAGGTGGGCGGCGTTGCCGGGGGGGCGCCGATCAAATGCATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCa < 1:1867457/150‑1 (MQ=255) ggCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAg < 1:546494/150‑1 (MQ=255) tctcGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCt > 2:32280/1‑150 (MQ=255) tcGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTgc < 1:306896/150‑1 (MQ=255) tcGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTgc > 1:918120/1‑150 (MQ=255) ggCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCaaa > 2:248980/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCg > 1:1171204/1‑65 (MQ=255) gCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCg < 2:1171204/65‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAG‑CCGTC‑AAGTTGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGCCCTGCGCGGCAAAc > 1:594016/1‑150 (MQ=255) ctgctgGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGaa > 2:1626163/1‑77 (MQ=255) ctgctgGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGaa < 1:1626163/77‑1 (MQ=255) tgctgGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAAcgcg > 2:1330003/1‑150 (MQ=255) tgGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCgg > 2:1765864/1‑150 (MQ=255) ggggCGGCGCGTCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGTGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTgg > 2:934242/2‑87 (MQ=255) ggggCGGCGCGTCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTgg < 1:934242/86‑1 (MQ=255) ggggCGGCGCGTCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCgg > 1:276533/2‑150 (MQ=255) gACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCGGCCATc > 2:1236164/1‑150 (MQ=255) aCGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCGGCCATCt > 1:1323526/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAg < 2:336398/120‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAg > 1:336398/1‑120 (MQ=255) | TACAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAG‑‑GCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCGGCCATCT > NC_002947/3651255‑3651543 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |