| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,662,001 | C→T | 9.8% | L292L (CTG→CTA) | PP_3226 ← | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,662,001 | 0 | C | T | 9.8% | 158.0 / 6.6 | 61 | L292L (CTG→CTA) | PP_3226 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (23/32); new base T (3/3); total (26/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.95e-01 | |||||||||||
CGCGAGAGCCCGGGATTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCACGCCGTCGTATACGGCCGGCAGTAAC > NC_002947/3661852‑3662148 | cgcgAGAGCCCGGGATTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAAcagc > 2:1527944/1‑150 (MQ=255) gcgAGAGCCCGGGATTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAAcagca < 1:1798370/150‑1 (MQ=255) cgAGAGCCCGGGATTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGNCTGGNTGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAAcagcag > 1:297169/1‑150 (MQ=255) gagaGCCCGGGATTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAgg < 2:1671460/150‑1 (MQ=255) ccGGGATTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCg > 1:900481/1‑150 (MQ=255) cGGGATTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGa < 2:867709/150‑1 (MQ=255) cGGGATTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGa < 2:867361/150‑1 (MQ=255) gATTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGc < 1:847726/150‑1 (MQ=255) aTTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCg < 1:794169/150‑1 (MQ=255) cggcggCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCa < 1:1128531/150‑1 (MQ=255) gcggcCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGt < 1:337784/150‑1 (MQ=255) cTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGTAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATg > 2:1806956/1‑150 (MQ=255) gATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACAt > 1:352028/1‑146 (MQ=255) gATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACAt < 2:352028/146‑1 (MQ=255) aTGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAAcagcag > 2:1743299/1‑122 (MQ=255) aTGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAAcagcag < 1:1743299/122‑1 (MQ=255) ccAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGc > 1:857919/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGATTGAGATGCCCGACATGCTGGGGAGAGATGTGACCGGCGGCTGCACCTTCTGGCGGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGc > 2:688558/1‑150 (MQ=255) cAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCg > 2:1298919/1‑150 (MQ=255) tcttCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTAGTTGACTAACATCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGt < 1:1774114/148‑1 (MQ=255) aGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGTTGATCGTCCTGCGCTGAATGCCGGTTAGAGATGGGCCTGGCGGCGGCAACATCGAGCAGGCTCTGTTGGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGt > 1:36450/1‑150 (MQ=255) aGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGt < 2:1375444/150‑1 (MQ=255) ttCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCATAAGGTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTgg < 1:1139144/150‑1 (MQ=255) tCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGc < 2:518632/150‑1 (MQ=255) ccACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTgaga > 2:1774114/1‑147 (MQ=255) aCGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCGGGTACATGCTGGAAGCGTGGCAgg > 2:1259046/1‑150 (MQ=255) aCGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAgg > 2:1490840/1‑150 (MQ=255) aCGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGGGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCAGCAAGCGTGGCAgg > 1:1029081/1‑150 (MQ=255) cTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGTAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGc < 1:1806956/150‑1 (MQ=255) gATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAg > 1:1798509/1‑150 (MQ=255) cGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAgcggcg < 2:1489937/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCCGGCTGTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGgcgc > 2:1894612/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTcc < 1:1194605/150‑1 (MQ=255) aGATGCTTGAGATGCCCGGTATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCAACGTCGCGGAGTCGCTGGTTGGCGAAAAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGaa < 1:1170456/150‑1 (MQ=255) gATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAg > 2:1692814/1‑150 (MQ=255) gATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAg > 2:149122/1‑150 (MQ=255) ttGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGTAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCt < 1:1425078/103‑1 (MQ=255) ttGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGTAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCt > 2:1425078/1‑103 (MQ=255) ttGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGTAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCt > 2:472674/1‑103 (MQ=255) ttGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGTAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCt < 1:472674/103‑1 (MQ=255) gAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTgcg > 1:395551/1‑150 (MQ=255) aGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTg < 2:1498603/101‑1 (MQ=255) aGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTg > 1:1498603/1‑101 (MQ=255) aGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTgcgc < 1:95273/150‑1 (MQ=255) cccGGCATGCTGGGGTGAGATGTGGCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCGAGTACATGCGGGAAGGGTGGCAGTCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGCGGGTGTGGGCTGCtt > 1:728088/1‑150 (MQ=255) cGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCgctgct > 1:222228/1‑147 (MQ=255) cGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCgctgct < 2:222228/147‑1 (MQ=255) aTGGTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCGGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCAAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGaaa < 2:172864/150‑1 (MQ=255) gCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGc < 2:297169/150‑1 (MQ=255) cTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTAc > 2:1495805/1‑81 (MQ=255) cTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTAc < 1:1495805/81‑1 (MQ=255) gggTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGAACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCgc < 2:366614/150‑1 (MQ=255) gTGAGATGTGCCTGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCgcca < 1:1718840/150‑1 (MQ=255) gTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAg < 2:1243693/94‑1 (MQ=255) gTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAg > 1:1243693/1‑94 (MQ=255) gTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCgcca < 2:1028417/150‑1 (MQ=255) tGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCgccag < 2:395551/150‑1 (MQ=255) tgtgCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCGGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGt > 1:1492780/1‑150 (MQ=255) cACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCggg < 1:1490840/150‑1 (MQ=255) aacGTCGAGGGGGTTGTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGc > 2:789174/3‑150 (MQ=255) gTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTGCATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCAc < 1:1527944/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGTTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCAc < 2:900481/150‑1 (MQ=255) gCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCACGCcgt > 1:1108354/1‑150 (MQ=255) cAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCACGCcgtc < 1:1431035/150‑1 (MQ=255) ctctGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCACGCCGTCGtat < 1:727335/150‑1 (MQ=255) tGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCACGCCGTCGTATAcggccg < 1:688558/150‑1 (MQ=255) cagcagGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCACGCCGTCGTATACGGCCGGCAGTaa < 1:1894612/150‑1 (MQ=255) cagcagGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCACGCCGTCGTATACGGCCGGCAGTaa < 1:1692814/150‑1 (MQ=255) agcagGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCACGCCGTCGTATACGGCCGGCAGTAac > 2:350243/1‑150 (MQ=255) | CGCGAGAGCCCGGGATTGCCGGCGGCCTCGATGGCCAGTTCCACGGCCTGGATGGCGTTGGCGCTGACCAGATGCTTGAGCTGCCCGGCATGCTGGGGTGAGATGTGCCCGGCGGCGGCACCGTCGAGCAGGCTCTGGTTGGCGAACAGCAGGGTGTCGATGCGGCCCAGTACATGCTGGAAGCGTGGCAGGCTGGCCAGCGGCGCTCCCAGGTTGGAAGGTGTGCGCTGCTTGAGAAAGCCCGCCAGCCAGTCGCGCGCGGCGCGGGCCACGCCGTCGTATACGGCCGGCAGTAAC > NC_002947/3661852‑3662148 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |