| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,914,733 | C→G | 6.3% | R33P (CGG→CCG) | PP_3454 ← | transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,914,733 | 0 | C | G | 6.3% | 247.6 / 7.4 | 79 | R33P (CGG→CCG) | PP_3454 | transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/34); new base G (2/3); total (42/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.75e-01 | |||||||||||
GTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGCGAGCGCTTCGCGG > NC_002947/3914592‑3914880 | gTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCGGGGCGATc < 1:1506693/150‑1 (MQ=255) gCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCatgt < 2:1610441/150‑4 (MQ=255) gCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCt < 2:46563/150‑1 (MQ=255) aTGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCAGAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCCGCAGCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTgg > 2:285828/1‑150 (MQ=255) gAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGa > 2:1649367/1‑140 (MQ=255) gAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGa < 1:1649367/140‑1 (MQ=255) ggATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGAAGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACAt < 1:439853/150‑1 (MQ=255) ttGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGa > 2:1829175/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGaa < 2:755615/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTCTGCGACTACTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGATCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGt > 1:704439/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGACGATCACCTGGGCATGGAAGTc > 2:1250307/1‑150 (MQ=255) aGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTcg > 2:1441041/1‑150 (MQ=255) tGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTcgttgcgt > 1:540014/1‑150 (MQ=255) gCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTcgttgcgtt < 2:796851/150‑1 (MQ=255) aCTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCa < 2:1899083/150‑1 (MQ=255) gcagcaGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTgg > 2:1256547/1‑150 (MQ=255) cagcCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCGGGGCGATCat > 2:1896740/1‑110 (MQ=255) cagcCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCGGGGCGATCat < 1:1896740/111‑2 (MQ=255) gcCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCa < 1:937742/150‑1 (MQ=255) acaGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCgg < 1:369848/95‑1 (MQ=255) acaGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCgg > 2:369848/1‑95 (MQ=255) tGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAgg > 1:365829/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAgg > 2:143537/1‑150 (MQ=255) gCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCCAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCt < 2:230819/150‑1 (MQ=255) aTCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTgtc < 1:926148/150‑1 (MQ=255) aTCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTgtc > 1:738995/1‑150 (MQ=255) gATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCAGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCA‑GTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCt > 2:1924332/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGa > 2:358200/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGa < 2:1690387/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGAc < 1:811673/150‑1 (MQ=255) tCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGaaaa > 2:231273/1‑150 (MQ=255) tCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGaaaa > 1:1045868/1‑150 (MQ=255) cAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAAt < 1:334859/150‑1 (MQ=255) tCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTc < 1:1256547/150‑1 (MQ=255) tCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTc > 1:1659221/1‑150 (MQ=255) tCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTc < 1:285828/150‑1 (MQ=255) aaGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCgg < 1:1045623/150‑1 (MQ=255) aaGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTATTCCACCAGGAAAAGGTTCgg > 2:1295452/1‑150 (MQ=255) gATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCAt > 2:1556530/1‑150 (MQ=255) aTGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCTGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATa < 2:1811528/150‑1 (MQ=255) aTGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATa < 1:1441041/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTg > 1:326717/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGGCTGCGACCAGGAAAATGTTCGCCATAGGTg > 2:398666/1‑150 (MQ=255) cAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGc > 1:633926/1‑150 (MQ=255) cAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGc > 2:1840232/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTgg < 2:1779452/150‑1 (MQ=255) gCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGt > 1:132139/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCGTGGGCgg > 1:186279/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCt > 2:32010/1‑150 (MQ=255) ttGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTgg < 2:1784703/150‑1 (MQ=255) gCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGt < 2:1916525/150‑1 (MQ=255) ccGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTc < 2:1559484/57‑1 (MQ=255) ccGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTc > 1:1559484/1‑57 (MQ=255) ccGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTgg < 2:702367/139‑1 (MQ=255) ccGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTgg > 1:702367/1‑139 (MQ=255) ccGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGtt > 2:1309306/1‑150 (MQ=255) cGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTg > 1:1097298/1‑150 (MQ=255) cGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCACCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACa > 2:1815624/1‑91 (MQ=255) cGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCACCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACa < 1:1815624/91‑1 (MQ=255) aCGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGaa < 2:929224/150‑1 (MQ=255) aCGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGaa < 1:398666/150‑1 (MQ=255) aCGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGaa < 2:132139/150‑1 (MQ=255) tCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAg < 1:1241327/59‑1 (MQ=255) tCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAg > 2:1241327/1‑59 (MQ=255) tCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGcc > 2:1757502/1‑150 (MQ=255) cGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCt < 1:1829175/150‑1 (MQ=255) tCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCtgt > 1:1776048/1‑150 (MQ=255) aGCATATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGc > 1:1752610/1‑150 (MQ=255) aGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGc > 2:878154/1‑150 (MQ=255) gCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGCg > 1:384912/1‑150 (MQ=255) cacaTGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGCGa > 1:1560126/1‑150 (MQ=255) aggtGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGaa > 2:615437/4‑134 (MQ=255) aggtGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGaa < 1:615437/131‑1 (MQ=255) aTGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGCGAgcg > 2:932712/1‑150 (MQ=255) aTCGCCCGGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTc > 1:1675666/1‑100 (MQ=255) aTCGCCCGGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTc < 2:1675666/100‑1 (MQ=255) gCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGCGAGCGCTTcgc < 1:143537/150‑1 (MQ=255) gCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGCGAGCGCTTcgc < 2:1776048/150‑1 (MQ=255) gCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGCGAGCGCTTcgc < 1:1840232/150‑1 (MQ=255) ccccGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTACGCCTGTGGGGAGCGCTTcgca > 2:1047323/1‑149 (MQ=255) cccGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGCGAGCGCTTCGCgg < 2:540014/150‑1 (MQ=255) cacGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTATCGTTCGAACAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGCGAGCGCTTCGCgg > 2:268604/3‑150 (MQ=255) | GTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGCGAGCGCTTCGCGG > NC_002947/3914592‑3914880 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |