| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,238,061 | G→A | 6.1% | A78V (GCG→GTG) | catB ← | muconate cycloisomerase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,238,061 | 0 | G | A | 6.1% | 187.0 / 2.0 | 65 | A78V (GCG→GTG) | catB | muconate cycloisomerase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/35); new base A (2/2); total (28/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.79e-01 | |||||||||||
CAGTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATG > NC_002947/4237913‑4238210 | cagTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGc < 2:709022/150‑1 (MQ=255) ggtCGCTGGCCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTg < 2:1272406/148‑1 (MQ=255) tGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGa < 1:1054889/150‑1 (MQ=255) tGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGa < 1:200817/150‑1 (MQ=255) gACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAg < 2:79980/150‑1 (MQ=255) gACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCGTGCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCACCTTGTCCAGCTTGACCATGGCCGCCTTCATGTTGTCTACCCTCACCCCAATCAACGCTGTGGCGAg < 2:1165002/150‑1 (MQ=255) aCCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTG‑TACCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGt > 1:659397/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTAc < 2:1890505/150‑1 (MQ=255) cAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGAt > 2:1245437/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATg < 1:1712889/150‑1 (MQ=255) gCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGtt < 1:1631448/150‑1 (MQ=255) cGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTg < 1:1073199/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAGCGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGa < 1:294864/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGa < 1:1666296/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGa > 2:1082793/1‑150 (MQ=255) tgAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCTTTCgg < 2:479504/149‑1 (MQ=255) gCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTg < 1:1198637/137‑1 (MQ=255) gCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTg > 2:1198637/1‑137 (MQ=255) aaGGCGCTTTCTATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCtt < 1:662974/150‑1 (MQ=255) ggCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTc > 1:1757784/1‑150 (MQ=255) gcTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGATTTCGTa < 1:211815/150‑1 (MQ=255) tttCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGAt > 2:447587/1‑130 (MQ=255) tttCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGAt < 1:447587/130‑1 (MQ=255) tGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCACCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACg > 2:1265004/1‑150 (MQ=255) ggACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTCCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAg < 1:1245437/150‑1 (MQ=255) tGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCAc < 1:1393736/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAt > 1:27072/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAt > 1:1003716/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAt > 1:911956/1‑150 (MQ=255) gtTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtggtggt < 2:27072/150‑1 (MQ=255) tGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtggtggtgg < 1:1082793/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGa < 1:1205511/138‑1 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGa > 2:1205511/1‑138 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCtt > 2:1447897/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGTCGAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCGCGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGa < 2:1297543/150‑1 (MQ=255) ccAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGa < 2:1298316/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtggtg > 1:477282/1‑136 (MQ=255) cAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtggtg < 2:477282/136‑1 (MQ=255) cAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGAt > 1:550601/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGAt > 2:70110/1‑150 (MQ=255) gCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTgg < 2:765424/84‑1 (MQ=255) gCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTgg > 1:765424/1‑84 (MQ=255) ttGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCt > 2:243723/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGc < 1:1798170/113‑1 (MQ=255) tCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGc > 2:1798170/1‑113 (MQ=255) tCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACACTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTcc > 1:274368/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACACTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTcc > 1:274302/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCAc > 1:1264758/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCggg < 2:304880/91‑1 (MQ=255) gCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCggg > 1:304880/1‑91 (MQ=255) gCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGAAGCTTCAACGATTCCTTCCACGc > 2:107092/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCAGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGcc < 2:911956/150‑1 (MQ=255) ttGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCa < 1:1675525/150‑1 (MQ=255) tGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCAt < 1:1265004/150‑1 (MQ=255) aGCAGGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCg < 2:1435072/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAACCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGc < 2:985233/150‑1 (MQ=255) tgttgtCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCa < 2:181440/150‑1 (MQ=255) ttgtCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAAt > 1:775323/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATaccac > 2:1868805/1‑150 (MQ=255) cGGCAGGCCAATCAACACTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCGGTCGCAATACCACCAg < 2:274302/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGCCAATCAACACTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAg < 2:274368/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAgg < 2:1765648/150‑1 (MQ=255) gCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGCTGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTctg > 2:853805/1‑150 (MQ=255) aTCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTctgctgc > 1:322380/1‑150 (MQ=255) aaCGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCtgctgctgc > 1:532176/1‑150 (MQ=255) gCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATg < 2:1003716/150‑1 (MQ=255) | CAGTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATG > NC_002947/4237913‑4238210 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |