| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,667,414 | C→G | 5.2% | Y378* (TAC→TAG) | nuoL → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,667,414 | 0 | C | G | 5.2% | 242.6 / 3.8 | 77 | Y378* (TAC→TAG) | nuoL | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/40); new base G (2/2); total (35/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.91e-01 | |||||||||||
GGGACGCGGCGATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCATGACCTC > NC_002947/4667269‑4667563 | gggACGCGGCGATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCa < 2:323710/150‑1 (MQ=255)gggACGCGGCGATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCa < 2:1425129/150‑1 (MQ=255) gACGCGGCGATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCGGTTCCGTGCCTCCGGTGCCGTTGTCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGACACTGCCACTGGCCTACGCCAGc > 1:1571366/1‑150 (MQ=255) gcggcgATCTTCCACCTGTTGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTTCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTc < 2:210235/150‑1 (MQ=255) gcggcgATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCGTAGGCCAGcggc < 1:1926293/150‑4 (MQ=255) gcggcgATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTc > 1:1207667/1‑150 (MQ=255) ggcgATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAGGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCAACACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCGGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGt > 1:323401/1‑150 (MQ=255) ggcgATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTTATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCAACCAGATAGGCGGCAATCGGGAAAAACTGCCGCGGGCCTACGCCAGCTTCgg > 2:1647885/1‑149 (MQ=255) ggcgATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGt < 2:476528/150‑1 (MQ=255) gcgATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTg < 1:1290931/150‑1 (MQ=255) gcgATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTg > 1:786583/1‑150 (MQ=255) gcgATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTg > 2:713990/1‑150 (MQ=255) gcgATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTg < 1:640395/150‑1 (MQ=255) ttCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACCTATCAAAACCCAAAAACCTACTGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCggt > 2:527747/1‑150 (MQ=255) cTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCg > 1:1140043/1‑150 (MQ=255) ccACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGCTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTggc > 2:351869/1‑150 (MQ=255) caccTTCTGCAATGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTggcggc < 1:27447/148‑1 (MQ=255) tcttcAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGc < 1:1561756/150‑1 (MQ=255) tcttcAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGc < 1:1580348/150‑1 (MQ=255) tcttcAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGc > 2:924834/1‑150 (MQ=255) ttcAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCg > 1:1746559/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATc > 2:839894/1‑147 (MQ=255) gCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATc < 1:839894/147‑1 (MQ=255) ccTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGAc > 1:900223/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGAc > 1:793281/1‑150 (MQ=255) gtcccTTGCCTCCGTTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAgg < 2:489229/147‑1 (MQ=255) cTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTc < 1:924834/150‑1 (MQ=255) cTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTc > 2:635893/1‑150 (MQ=255) ttGCCTCCGGTTCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCt > 2:72944/1‑150 (MQ=255) ttGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCGTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTATGCTTCt > 2:711848/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCa < 1:100787/150‑1 (MQ=255) cggtgcggtgATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCaa < 1:235806/150‑1 (MQ=255) ggtgcggtgATCGTTGCCTGCCGCCACGCGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAGCTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAg < 2:1631896/150‑1 (MQ=255) ggtgATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACga < 2:793281/150‑1 (MQ=255) tCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATcc > 2:1480976/1‑150 (MQ=255) ttGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCctct < 1:713990/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCctct > 2:475517/1‑150 (MQ=255) gcctgccACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTgg < 1:1907119/150‑1 (MQ=255) ctgccACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCggtggt < 1:346860/85‑1 (MQ=255) ctgccACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCggtggt > 2:346860/1‑85 (MQ=255) tgccACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGaa < 2:900223/150‑1 (MQ=255) ccaccaCGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGc > 2:1413854/1‑150 (MQ=255) ccaccaCGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTACCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGc > 1:1366820/1‑150 (MQ=255) caccacGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGcc < 1:274950/150‑1 (MQ=255) accacGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCt < 1:351869/150‑1 (MQ=255) accacGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGAAGGCATCTACTGCAATGACGGGATCCTCTGGGAAGCCt > 2:958279/1‑150 (MQ=255) cacGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGCGCTTGTCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTc < 2:1417874/150‑1 (MQ=255) acGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCg < 2:1398483/150‑1 (MQ=255) gAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAgg < 1:1038601/110‑1 (MQ=255) gAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAgg > 2:1038601/1‑110 (MQ=255) gCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTAc > 2:836592/1‑115 (MQ=255) gCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTAc < 1:836592/115‑1 (MQ=255) gAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCgg > 2:1762951/1‑150 (MQ=255) aaCATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTggcg < 2:1732783/81‑1 (MQ=255) aaCATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTggcg > 1:1732783/1‑81 (MQ=255) ttCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACAcc > 1:1652978/1‑150 (MQ=255) tctaGATGGTCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCg < 2:1151945/147‑1 (MQ=255) tCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCTGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGACGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCg < 1:1647885/150‑1 (MQ=255) aaGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTCCGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGc < 1:958279/150‑1 (MQ=255) gggCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCctgct > 2:1232275/1‑150 (MQ=255) gcggcCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGAcc > 2:1472166/1‑83 (MQ=255) gcggcCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGAcc < 1:1472166/83‑1 (MQ=255) tgtgGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCg < 2:786583/150‑1 (MQ=255) ggAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGcc < 2:1761006/150‑1 (MQ=255) aagaaACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGCCGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCCGCTGTATGCCGGCCTg > 1:767282/1‑150 (MQ=255) aagaaACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTg < 1:72944/150‑1 (MQ=255) gaaACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGt < 1:714597/150‑1 (MQ=255) aaaCTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTa < 2:1571366/150‑1 (MQ=255) tGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGgcg > 1:1903909/1‑150 (MQ=255) gaagCTGGCGTAGGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCaa < 1:949132/114‑1 (MQ=255) gaagCTGGCGTAGGCCAGCTTCGGGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCaa > 2:949132/4‑117 (MQ=255) gCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGgcgc < 2:1746559/150‑1 (MQ=255) agCTGGCGTAGGCCAGCTTCGTGGGCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGt > 2:5428/2‑150 (MQ=255) ggCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCAt < 2:1140043/150‑1 (MQ=255) ccTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCATGa < 1:1232275/150‑1 (MQ=255) ccTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCATGa < 1:1055383/150‑1 (MQ=255) cTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCATgcc > 2:1880026/1‑148 (MQ=255) cGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCATGACCTc > 2:1448338/1‑150 (MQ=255) | GGGACGCGGCGATCTTCCACCTGATGACCCACGCCTTCTTCAAGGCCCTGCTGTTCCTTGCCTCCGGTGCGGTGATCGTTGCCTGCCACCACGAGCAGAACATCTTCAAGATGGGCGGCCTGTGGAAGAAACTGCCGCTGGCCTACGCCAGCTTCGTGGTCGGTGGTGCGGCACTGGCGGCCCTGCCGATCGTGACCGTAGGCTTCTACTCCAAGGACGAGATCCTCTGGGAAGCCTTCGCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCATGACCTC > NC_002947/4667269‑4667563 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |