Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,783,141 | G→A | 6.3% | I1406I (ATC→ATT) | pvdJ ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,783,141 | 0 | G | A | 6.3% | 235.4 / 4.0 | 79 | I1406I (ATC→ATT) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/39); new base A (2/3); total (37/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
TCGTTGGCGGGCACGAACAGCGCACCGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTCGCG > NC_002947/4782992‑4783290 | tcGTTGGCGGGCACGAACAGCGCACCGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCg > 2:1438773/1‑150 (MQ=255) tGGCGGACACGAACAGCGCACCGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCGCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATAc < 1:1825476/150‑1 (MQ=255) gAACAGCGCACCGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCgg < 1:1210857/150‑1 (MQ=255) gAACAGCGCACCGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCgg < 1:1438773/150‑1 (MQ=255) aCAGCGCACCGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCNGGa < 2:1189396/150‑1 (MQ=255) aCAGCGCACCGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGa < 2:412356/150‑1 (MQ=255) gcgnACCGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCt > 2:1193972/1‑150 (MQ=255) ccACCGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCg < 2:1376256/149‑1 (MQ=255) cGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCa > 2:353786/1‑150 (MQ=255) cGCCCTCCACGCTCACGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGCTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCa > 2:549583/1‑150 (MQ=255) cccTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAAc < 1:462064/150‑1 (MQ=255) ccTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAAct < 1:1409821/150‑1 (MQ=255) gCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAActgct < 1:351358/150‑1 (MQ=255) tCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACtgctgc > 2:1034529/1‑150 (MQ=255) cTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTg < 1:866100/150‑1 (MQ=255) gAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGAt < 1:1155505/150‑1 (MQ=255) aaGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGAtg > 2:301715/1‑150 (MQ=255) gCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGAtgtg > 2:1600265/1‑150 (MQ=255) tGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGtt < 1:301715/150‑1 (MQ=255) aTCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGAt < 1:88468/150‑1 (MQ=255) aTCGAACTGGCCGAGGGAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGAt > 1:831322/1‑150 (MQ=255) tCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATg > 1:1907742/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGgc < 1:1193972/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTg < 1:33236/146‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTg > 2:33236/1‑146 (MQ=255) tgcGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTTCGTGTGGTGTTTGATTCTGtccgc > 1:1499741/3‑150 (MQ=255) gCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGgccgc > 2:1732446/1‑150 (MQ=255) cGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCa > 2:615935/1‑150 (MQ=255) gTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCt > 1:1486725/1‑150 (MQ=255) gTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCAATACCTTTGGCCGGGACCTCg > 2:264384/1‑109 (MQ=255) gTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCAATACCTTTGGCCGGGACCTCg > 2:264287/1‑109 (MQ=255) gTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCAATACCTTTGGCCGGGACCTCg < 1:264287/109‑1 (MQ=255) gTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCAATACCTTTGGCCGGGACCTCg < 1:264384/109‑1 (MQ=255) tAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCtt < 1:615935/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCATGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTGGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTgg > 2:1016935/1‑150 (MQ=255) ggTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATg < 2:279881/127‑1 (MQ=255) ggTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATg > 1:279881/1‑127 (MQ=255) ggTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCGGGGCGAACGCGGCCTCGCCCAGGTAACGCACCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGAACCCGGCCAACTGCCGCTTGCTGTGCTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCgg > 2:844756/1‑150 (MQ=255) gTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGgt < 1:839438/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTTGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAg > 1:51961/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGa < 1:842063/110‑1 (MQ=255) ccGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGa > 2:842063/1‑110 (MQ=255) gcgGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGtt > 1:1013109/1‑150 (MQ=255) gcgGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGtt < 1:1600265/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCa > 1:591828/1‑150 (MQ=255) cTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCAc < 1:1732446/150‑1 (MQ=255) tGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTg > 2:787957/1‑117 (MQ=255) tGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTg < 1:787957/117‑1 (MQ=255) ggCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCggg < 1:650396/150‑1 (MQ=255) cAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGaa < 1:353786/150‑1 (MQ=255) aCGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACa < 2:830367/150‑1 (MQ=255) gCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCTGGACCCCGGCCAATCACTTCTACTTGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACTGGGAACAGa > 1:430911/1‑150 (MQ=255) gCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGa < 2:1242869/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGGCCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGt > 2:1027942/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACAATAATGTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGaa < 1:1552629/150‑1 (MQ=255) taggCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCaa < 2:1088173/69‑1 (MQ=255) taggCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCaa > 1:1088173/3‑71 (MQ=255) aCGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCGTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGACCCAGCCAACgg > 2:1003607/1‑150 (MQ=255) gcgGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTg > 2:1879874/1‑150 (MQ=255) gcgGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTg < 1:1016935/150‑1 (MQ=255) gcgGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTg < 1:430815/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATgtgt > 2:552066/1‑73 (MQ=255) ttCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATgtgt < 1:552066/73‑1 (MQ=255) ttCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCt > 1:1585608/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCag < 1:1209155/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGTAACGAACCACCCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCag > 2:21244/1‑150 (MQ=255) ccAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCa > 2:578013/1‑93 (MQ=255) ccAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCa < 1:578013/93‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCaggtc > 2:972902/1‑150 (MQ=255) gTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCaggtcgag < 1:1879874/150‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGgtgt < 1:703905/91‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGgtgt > 2:703905/1‑91 (MQ=255) gcagcaCGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGAc > 2:1443768/1‑111 (MQ=255) gcagcaCGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGAc < 1:1443768/111‑1 (MQ=255) gcaCGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCAcc < 1:505210/98‑1 (MQ=255) gcaCGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCAcc > 2:505210/1‑98 (MQ=255) gCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGgt > 2:344325/1‑82 (MQ=255) gCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGgt < 1:344325/82‑1 (MQ=255) gCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGATCCAGGAACAGACTGCTGAATCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAg < 2:1499741/150‑1 (MQ=255) cGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTcgc < 2:1237405/150‑1 (MQ=255) gATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATg > 1:1800007/1‑49 (MQ=255) gATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATg < 2:1800007/49‑1 (MQ=255) gATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTcgcg < 1:787349/150‑1 (MQ=255) | TCGTTGGCGGGCACGAACAGCGCACCGCCCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTCGCG > NC_002947/4782992‑4783290 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |