Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,806,160 | A→T | 9.3% | S593T (TCG→ACG) | PP_4234 ← | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,806,160 | 0 | A | T | 9.3% | 276.3 / 17.1 | 97 | S593T (TCG→ACG) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/46); new base T (4/5); total (46/51) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.53e-01 |
GCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTC > NC_002947/4806012‑4806304 | gCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGaa > 1:984059/1‑150 (MQ=255) acgaTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGc > 1:824801/1‑150 (MQ=255) tGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAg < 1:1380058/150‑1 (MQ=255) gCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGa < 2:697768/150‑1 (MQ=255) cGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCcgacgag < 2:1537770/150‑2 (MQ=255) gACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCcgacgagg < 2:475483/150‑3 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCt < 2:1795676/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGAACATGGACGTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCt < 2:1095778/150‑1 (MQ=255) aGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTg > 1:1237945/1‑150 (MQ=255) aGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTg > 2:437144/1‑150 (MQ=255) ttGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGacc > 2:951423/1‑150 (MQ=255) gCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGaccac < 2:453456/150‑1 (MQ=255) cGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGAccacca > 2:1250113/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCaaa < 1:480962/150‑1 (MQ=255) gcgcGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCCGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTg < 2:100030/150‑1 (MQ=255) gggTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAg > 2:1033408/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGt < 2:1569979/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGt < 2:877906/150‑1 (MQ=255) ttGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTg < 1:401142/150‑1 (MQ=255) ttGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTg > 2:1459486/1‑150 (MQ=255) tGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTgg < 2:1923654/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGCGCGGCATCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTgg < 2:1029194/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGa > 1:894387/1‑150 (MQ=255) gcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTgg > 2:850268/1‑140 (MQ=255) gcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTgg < 1:850268/140‑1 (MQ=255) gcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTg < 1:948105/146‑1 (MQ=255) gcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTg < 1:948021/146‑1 (MQ=255) gcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCAATCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTg > 2:948105/1‑146 (MQ=255) gcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCGGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGta > 2:948021/1‑145 (MQ=255) cAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACAt < 1:1487686/150‑1 (MQ=255) gcggcgTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCg < 1:1895989/150‑1 (MQ=255) cTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAg > 2:1389784/1‑150 (MQ=255) cTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGATTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAg > 2:999552/1‑150 (MQ=255) tGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGc < 2:1915012/150‑1 (MQ=255) tCCGGCTTGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCcgacgag < 2:52262/101‑2 (MQ=255) tCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCCGacgag > 1:52262/1‑97 (MQ=255) tgATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCAGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGatat > 2:1116484/1‑150 (MQ=255) gATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATg < 1:1232829/150‑1 (MQ=255) aTCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGATGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGTAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATgg > 2:63362/1‑150 (MQ=255) gTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAg > 1:1294508/1‑150 (MQ=255) gTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCCTCGGCCGTTCGGCCGac > 2:165590/1‑80 (MQ=255) gTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCCTCGGCCGTTCGGCCGac < 1:165590/81‑2 (MQ=255) tACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGCGACGGGATGCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAgg > 2:268326/1‑150 (MQ=255) gTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCg < 1:530672/127‑1 (MQ=255) gTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCg > 2:530672/1‑127 (MQ=255) gTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCg > 2:1693712/1‑150 (MQ=255) tGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCgg > 1:522297/1‑150 (MQ=255) cTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTAGGTGCCGATATGGCGCAGGGTGATGCGGGCGTGGgcg > 2:108507/1‑150 (MQ=255) tCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGgcgc < 2:1042381/150‑1 (MQ=255) tCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGgcgc < 2:1294508/150‑1 (MQ=255) cAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCt < 1:1389784/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGaa < 1:966178/150‑1 (MQ=255) gCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGc < 1:40469/126‑1 (MQ=255) gCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGc > 2:40469/1‑126 (MQ=255) aGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCAGGGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCg > 1:912337/1‑150 (MQ=255) tctGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGgcgc > 1:1268717/1‑139 (MQ=255) tctGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGgcgc < 2:1268717/139‑1 (MQ=255) tctGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGaca > 2:1909233/1‑150 (MQ=255) ctGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGgcg < 1:638842/137‑1 (MQ=255) ctGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGgcg > 2:638842/1‑137 (MQ=255) tGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACt > 2:1105977/1‑150 (MQ=255) tGGCCATTAGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCAAACGGCCGAGGGAATCGCTGAACACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCGGGTGCCCAGCTCAGTGACGATATGGGGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACt > 1:615267/1‑150 (MQ=255) ggCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTg < 2:522297/150‑1 (MQ=255) gCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTgg < 1:1459486/150‑1 (MQ=255) aTTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCa > 1:1024741/1‑150 (MQ=255) cGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCg < 2:894387/150‑1 (MQ=255) cGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCg < 2:1331203/150‑1 (MQ=255) cGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCg < 2:1331137/150‑1 (MQ=255) gTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGACAGCGCTTACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCGCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCggg > 1:905755/1‑149 (MQ=255) gTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGgc > 1:22320/1‑150 (MQ=255) aCTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGcc > 1:110770/1‑150 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGc < 2:1738151/104‑1 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGc > 1:1738151/1‑104 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAAc > 1:1101341/1‑127 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAAc < 2:1101341/127‑1 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTc > 2:1785912/1‑150 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTc < 1:1121001/150‑1 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTc > 1:603691/1‑150 (MQ=255) gTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGaa < 1:1909233/150‑1 (MQ=255) tCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGAt < 1:1627041/103‑1 (MQ=255) tCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGAt > 2:1627041/1‑103 (MQ=255) tCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAAc < 1:1693712/150‑1 (MQ=255) tCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAAc < 2:144022/150‑1 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGCAGTGGCCGGTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCt > 1:437/1‑150 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCt > 1:1593991/1‑150 (MQ=255) aCCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTa < 1:1250113/150‑1 (MQ=255) tcTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCAGCGGCGCCTCGGAACCTGTAc > 2:124402/2‑150 (MQ=255) cccattcgACCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTAc > 2:471824/6‑150 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa < 1:851496/150‑1 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa < 2:824801/150‑1 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa < 2:1237945/150‑1 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa < 2:603691/150‑1 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa < 1:951423/150‑1 (MQ=255) tcgGCCGTTCGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAg > 1:1249824/1‑150 (MQ=255) tcgGCCGTTCGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAg > 1:1195061/1‑150 (MQ=255) tcgGCCGTTCGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAg < 2:1249824/150‑1 (MQ=255) tcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAg > 2:1011955/1‑150 (MQ=255) ggCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTc < 2:717903/150‑1 (MQ=255) | GCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTC > NC_002947/4806012‑4806304 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |