| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,820,281 | C→A | 8.2% | V3652F (GTC→TTC) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,820,281 | 0 | C | A | 8.2% | 224.5 / 7.1 | 74 | V3652F (GTC→TTC) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/32); new base A (3/3); total (38/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.20e-01 | |||||||||||
CAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTGGGCGTGATTGAGCA > NC_002947/4820132‑4820424 | cAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGAc > 2:608090/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAg > 2:969882/1‑150 (MQ=255) cccGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGt < 1:608090/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACACCGTCGTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTc > 1:1563826/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTc < 1:130363/150‑1 (MQ=255) tCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAg < 2:812736/150‑1 (MQ=255) cGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAgcgc > 2:166809/1‑150 (MQ=255) cGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAgcgc < 1:166809/150‑1 (MQ=255) ggTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCt > 1:373569/1‑150 (MQ=255) cAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CGGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCg > 1:122345/1‑150 (MQ=255) cAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCg > 1:405759/1‑150 (MQ=255) aGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCGCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCACCACGCGCGCGAACT‑‑‑TCATCAGGCGATCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGa > 2:989498/1‑150 (MQ=255) tcctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGATACAACTGAAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAAc < 1:989498/150‑1 (MQ=255) tcctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTc < 2:819102/146‑1 (MQ=255) tcctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTc > 1:819102/1‑146 (MQ=255) tcctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAAc > 1:219706/1‑150 (MQ=255) ctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGAAGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGa > 2:293402/1‑150 (MQ=255) ctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGAAGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGa > 2:294543/1‑150 (MQ=255) ctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGAAGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGa > 2:293325/1‑150 (MQ=255) tccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGAc < 2:1030905/150‑1 (MQ=255) cagcagGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAg > 2:137685/1‑150 (MQ=255) gcagGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGt < 2:1705552/150‑1 (MQ=255) agGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGc < 2:137307/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTCCTGGGCGCTCGGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGCATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACCGGCGCAGGgcc < 2:762001/150‑1 (MQ=255) cTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTAGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCa > 1:568449/1‑150 (MQ=255) ttGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CGGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAg < 2:122345/150‑1 (MQ=255) ttGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAg > 1:1415449/1‑138 (MQ=255) ttGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAg < 2:1415449/138‑1 (MQ=255) tCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGtcc > 2:203966/1‑149 (MQ=255) tCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGtca > 1:1001169/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCGCTCAGCATCTGTAGCTCGCTCGCCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGtcat < 2:714546/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGt > 2:521261/1‑150 (MQ=255) aGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACAccgcc < 1:969882/150‑1 (MQ=255) tcgctcACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTc > 2:175750/1‑150 (MQ=255) gctcACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAg > 1:269797/1‑150 (MQ=255) tcACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCa > 1:462047/1‑147 (MQ=255) tcACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCa < 2:462047/147‑1 (MQ=255) aCCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGcc > 2:1889761/1‑113 (MQ=255) aCCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGcc < 1:1889761/113‑1 (MQ=255) aCCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCggg > 2:1413598/1‑150 (MQ=255) tCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTAGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAg > 2:1089407/1‑150 (MQ=255) cccTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGtt > 2:571390/1‑150 (MQ=255) ccTTCAAAACCTTGTACCCGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGCCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGGGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGCTg > 2:1632840/1‑150 (MQ=255) ccTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTg > 2:1444270/1‑150 (MQ=255) ttCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGgt < 1:203966/150‑1 (MQ=255) ttCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGgt < 1:1444270/150‑1 (MQ=255) ttCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGgt < 2:1563826/150‑1 (MQ=255) ccTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAg < 1:1536921/95‑1 (MQ=255) ccTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAg > 2:1536921/1‑95 (MQ=255) cTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGAAGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTAc < 1:294543/150‑1 (MQ=255) cTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGAAGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTAc < 1:293402/150‑1 (MQ=255) cTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGAAGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTAc < 1:293325/150‑1 (MQ=255) ttGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGGAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACg > 1:1308177/1‑150 (MQ=255) ttGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACg > 2:1438897/1‑150 (MQ=255) tACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCCCCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGcc < 1:183794/150‑1 (MQ=255) tACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGcc > 2:494182/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCgg > 1:745407/1‑127 (MQ=255) ccAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCgg < 2:745407/127‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCg > 2:669902/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGt < 1:137685/150‑1 (MQ=255) ag‑‑‑cagGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCCCCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTg < 2:123474/150‑1 (MQ=255) ag‑‑‑cagGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTg < 2:219706/150‑1 (MQ=255) ggCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGt < 1:1494954/150‑1 (MQ=255) ttGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAgg > 1:291053/1‑150 (MQ=255) ttGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAgg > 1:84311/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCGGGCGCTCGACGGTCGGGTAGGCGAAGTAGCGCGGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGAGcaag < 2:568449/150‑4 (MQ=255) tCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTgg < 2:297272/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTgg < 1:521261/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTGGGc < 1:494182/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCCCCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTGGGCg > 1:602857/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCCGGGCg > 1:1794481/1‑150 (MQ=255) gcagGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCCCCCGGGTACCACACCGCCGTCATCGGTAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTGGGCGTGAt < 1:1177515/150‑1 (MQ=255) cagGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTGGGCGTNAtt < 2:1193680/150‑1 (MQ=255) agGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACCCCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTGGGGGTGGTTg > 1:328093/1‑150 (MQ=255) gcTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGGCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTGGGCGTGATTGAGCa < 1:571390/150‑1 (MQ=255) | CAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAG‑‑‑CAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTGGGCGTGATTGAGCA > NC_002947/4820132‑4820424 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |