Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,824,317 | G→C | 8.8% | S2306R (AGC→AGG) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,824,317 | 0 | G | C | 8.8% | 275.4 / 15.9 | 92 | S2306R (AGC→AGG) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/40); new base C (4/4); total (48/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.42e-01 |
ATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAG > NC_002947/4824171‑4824466 | aTCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGGAGGCCTGCTGCTCCGGCAGACTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTg > 2:28436/1‑150 (MQ=38) tCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTgg > 2:1419405/1‑150 (MQ=255) aCCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTggcg < 2:1630298/150‑1 (MQ=255) cGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTggcggc < 1:1566794/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGCCTggcggccta < 1:446576/150‑4 (MQ=255) cTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGATTGTGCATCGGTGCGTCGCTGTAGGCCGCCAGGCGGGCGGCATc < 2:1454788/150‑1 (MQ=38) gCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTc > 2:885293/1‑150 (MQ=255) tGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTcc > 2:1089837/1‑150 (MQ=255) ccATGGCGAGTTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAAATGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCa > 2:672985/2‑150 (MQ=12) cATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAg > 2:321843/1‑150 (MQ=255) cATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAAGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAg > 2:1125472/1‑150 (MQ=255) gAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCa < 1:1094798/150‑1 (MQ=255) attcgcGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCa > 1:1006038/6‑150 (MQ=255) tCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTg > 1:708624/1‑150 (MQ=255) tCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGGGCTGCGGCAAGAAGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTg > 2:1446667/1‑150 (MQ=255) gCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGc < 1:196892/150‑1 (MQ=255) cATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCa > 1:1751388/1‑142 (MQ=255) cATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCa < 2:1751388/142‑1 (MQ=255) aTGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCAc < 2:295913/150‑1 (MQ=255) cTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCt < 1:1257303/150‑1 (MQ=255) tGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGCCTggcggcctaca < 1:536960/123‑6 (MQ=255) tGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGCCTggcggcctaca > 2:536960/1‑118 (MQ=255) gACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTc > 1:786375/1‑150 (MQ=255) ccacGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCa < 1:728118/150‑1 (MQ=255) cacGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGGGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAAAGGCCCATAGGCGTACCCCGCCAGTCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAg > 1:1664437/1‑150 (MQ=255) ccTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCCCGGTGGCCGGCGTCTGCGGCAGACAAAAGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGc > 2:162360/1‑150 (MQ=255) cTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTTAGGTTGTCCAGCGGGGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGcc > 2:789955/1‑150 (MQ=255) ttGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGccc > 1:640932/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGgtg < 2:708624/150‑1 (MQ=255) tGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGgtgt < 2:786375/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGGGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTgc > 1:1327121/1‑150 (MQ=255) gTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAGGCCTGGGGCTCCTTCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTgcagc > 2:1822625/1‑150 (MQ=255) gTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTgcagc > 2:1100261/1‑150 (MQ=255) tGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTgcagca < 1:650296/150‑1 (MQ=255) tGGAGCCGGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTgcagca < 1:140431/150‑1 (MQ=255) gAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCagcagc < 1:321843/150‑1 (MQ=255) gAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCagcagc < 2:1211355/150‑1 (MQ=255) gtgtAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctgg > 1:1446599/1‑150 (MQ=255) tgtAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctggc < 1:1100261/150‑1 (MQ=255) gtAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctggct < 1:1419405/150‑1 (MQ=255) aGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGa < 1:885293/150‑1 (MQ=255) aTCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAg > 1:190129/1‑93 (MQ=255) aTCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAg < 2:190129/93‑1 (MQ=255) aTCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTCGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagc > 2:257984/1‑150 (MQ=255) tCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagca > 1:1825241/1‑150 (MQ=255) tCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagca < 2:1749709/150‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCACCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagca < 2:985844/150‑1 (MQ=255) cAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagcag < 2:1098631/150‑1 (MQ=255) gTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCaa > 2:1517033/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCg < 1:169184/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGAt > 1:905662/1‑150 (MQ=255) tGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCGTCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCGGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATg > 2:114659/1‑150 (MQ=255) tgcGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCGAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTg > 1:1379796/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCt > 1:1199323/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCTGAGATTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCt > 1:1199003/1‑150 (MQ=255) 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gatgccgccAGCCTGGCGGCCTCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTAc > 1:1878176/4‑150 (MQ=255) gatgccgccAGCCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCgg > 1:1007201/4‑146 (MQ=255) gatgccgccAGCCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCgg < 2:1007201/143‑1 (MQ=255) gatgccgccAGCCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTAc > 2:1651292/4‑150 (MQ=255) gccgccAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCg < 2:1471861/150‑1 (MQ=255) gccgccAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCg < 2:1379796/150‑1 (MQ=255) cgccAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCggg < 2:1920255/150‑1 (MQ=255) cgccAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCggg < 1:1125472/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGAAAGCCGATGCGGATGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGt > 1:202648/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGt < 1:1651292/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCagcagc < 1:1022141/73‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCagcagc > 2:1022141/1‑73 (MQ=255) gCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAg > 2:85639/1‑150 (MQ=255) | ATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAG > NC_002947/4824171‑4824466 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |