| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,924,175 | C→G | 7.1% | L22L (CTG→CTC) | PP_4333 ← | CheW domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,924,175 | 0 | C | G | 7.1% | 346.2 / 14.4 | 113 | L22L (CTG→CTC) | PP_4333 | CheW domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/58); new base G (4/4); total (51/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GGGCAAAGCTGGCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAACCCACGGCTCTTG > NC_002947/4924027‑4924318 | gggCAAAGCTGGCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTgcagca < 1:586299/150‑1 (MQ=255) ggCAAAGCTGGCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGcagcag < 2:1890365/150‑1 (MQ=255) gCAAAGCTGGCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAgg > 2:348608/1‑150 (MQ=255) aaaGCTGGCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGcc > 1:1249861/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCTGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGt > 2:1135952/1‑150 (MQ=255) gcggcggcTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTAc < 2:253953/150‑1 (MQ=255) gcggcTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGAt < 1:1196767/150‑1 (MQ=255) ggcTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCCGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTGCTGCAGGAGGccaccga < 2:1123138/140‑6 (MQ=255) ggcTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCCGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTGCTGCAGGAGGccaccga > 1:1123138/1‑135 (MQ=255) gcTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGc < 2:1249861/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCC‑CCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAg > 2:1278867/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAgg < 1:567457/150‑1 (MQ=255) ggcggGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGc < 2:852795/150‑1 (MQ=255) gggCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTAGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCAt > 1:1545572/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGCGCATCAGCT‑GGACAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTg > 1:1772734/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGcc > 1:1252961/1‑150 (MQ=255) cGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCgg < 2:201894/150‑1 (MQ=255) ggctgTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGGGCACCGCCGCGGCGAACGCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCGTCCTGCAGCAGGCGGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTg < 2:217625/150‑1 (MQ=255) ggctgTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTg < 1:335032/150‑1 (MQ=255) gcctgTCGGGTATCGGGTGCCTGCTCCGCGCGCACCGCCTCGGCGAACTGGTCCGGCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTg < 2:106525/148‑1 (MQ=255) gggCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGcc < 2:666956/150‑1 (MQ=255) gCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCgg > 2:1374665/1‑150 (MQ=255) gCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCgg < 1:1708162/150‑1 (MQ=255) cATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCggg < 2:525471/150‑1 (MQ=255) aaccgcgTGCCTGCCCCTCGCTCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCggg < 1:1271344/147‑1 (MQ=255) aTCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCa > 1:1574001/1‑116 (MQ=255) aTCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCa < 2:1574001/116‑1 (MQ=255) tCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGtt < 2:1276498/150‑1 (MQ=255) tCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGtt < 2:1559515/150‑1 (MQ=255) tCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGtt < 2:887828/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGttt < 1:1100515/150‑1 (MQ=255) gcgTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTg > 1:1783789/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGtca > 2:772266/1‑150 (MQ=255) tGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGtcatc < 1:1602391/150‑1 (MQ=255) 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cgcgCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCATGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTAc < 1:1491837/150‑1 (MQ=255) cgcgCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTAc < 1:81815/150‑1 (MQ=255) aCCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCCCAGGGCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCATGGACGAATGCAGGGCCCGATGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCCGGAGTGATCCATCAGGCTACCTGCa > 2:691463/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAggg < 1:225036/93‑1 (MQ=255) ccTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGc > 2:1098541/1‑150 (MQ=255) ggCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTc < 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tcAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCt > 2:639818/1‑150 (MQ=255) cAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGAGTGCGGGTCGATCTGGGGCCTGGTGCTGGTTTGCTGCGTTTGTGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTg > 1:1382668/1‑150 (MQ=255) ggTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTa < 1:690735/150‑1 (MQ=255) cTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAgcc < 1:274465/150‑3 (MQ=255) tttGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAg < 1:567017/117‑1 (MQ=255) tttGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAg > 2:567017/1‑117 (MQ=255) tttGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCg > 1:436425/1‑150 (MQ=255) ttGGCCTCGGTGGCCTCCTGCCGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGa < 2:663502/150‑1 (MQ=255) ctggacggCCTGCTGCAGGAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGa < 2:483935/139‑1 (MQ=255) cTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAAc > 2:351045/1‑150 (MQ=255) cTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAAc > 2:1915279/1‑150 (MQ=255) tCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAAcc < 1:772266/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAAccc < 2:1868721/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAg < 1:1878042/138‑1 (MQ=255) ggTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAg > 2:1878042/1‑138 (MQ=255) gacggCCTGCTGCAGGAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTTCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGt < 1:1783168/103‑1 (MQ=255) gacggCCTGCTGCAGGAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTTCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGt > 2:1783168/4‑106 (MQ=255) gTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAACCCAc < 2:1772734/150‑1 (MQ=255) ggCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAACCCACgg < 1:351045/150‑1 (MQ=255) gCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAg < 2:11095/80‑1 (MQ=255) gCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAg > 1:11095/1‑80 (MQ=255) ctcctGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTTCGTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAACCCACGGctc > 1:1841730/1‑150 (MQ=255) tcctGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAACCCACGGctct > 2:655866/1‑150 (MQ=255) cctGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAACCCACGGCTCtt < 1:1637059/150‑1 (MQ=255) ctGCAGGAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGt < 2:42579/101‑1 (MQ=255) ctGCAGGAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGt > 1:42579/1‑101 (MQ=255) ctGCAGCAGGCCTTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGATGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAACGCACGGCTCTTg > 2:1003223/1‑150 (MQ=255) | GGGCAAAGCTGGCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCTCAGGCCGGGCTGGCTGTCGGGCATCGCGTGCCTGCTCCTCGCGCACCGCCTCGGCGAACTCGTCCGCCACTGC‑CGGCTGCTCGCTCAGGTCTTTGGCCTCGGTGGCCTCCTGCAGCAGGCCGTCCAGGTACGATTGCAGGGCCATCTGGGGCCGGGTGCTGGTTTGCCGGGTTTGAGTCATCAGGCTACCTGCACTGCGTTCTTGTAGGTGAGCAGGTGCTTGAGCAGCGCCCTGTAGGCGATCAACCCACGGCTCTTG > NC_002947/4924027‑4924318 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |