New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 176399 | NA (NA) | 44 (0.810) +CGAAA |
16/256 | 3.0 | 40.9% | intergenic (+43/‑420) | PP_5SA/PP_16SB | 5S ribosomal RNA/16S ribosomal RNA |
? | NC_002947 | = 182013 | 66 (1.180) | intergenic (+2/+63) | PP_5SB/PP_0160 | 5S ribosomal RNA/ferrioxamine receptor |
GGAACCACCTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGAAGTTAAA > NC_002947/176259‑176544 | ggAACCACCTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGt < 1:749019/150‑1 (MQ=32) gAACCACCTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTa > 2:323871/1‑150 (MQ=32) ccaccTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTGTATCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGTATTTTGTCTTTAAGTAGaa > 2:338103/1‑150 (MQ=11) cccatcccGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCt > 2:186617/1‑150 (MQ=255) catcccGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGTGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTc > 1:215389/1‑150 (MQ=255) aaaCGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAgg < 1:323871/150‑1 (MQ=255) aaCGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTc < 2:875524/130‑1 (MQ=255) aaCGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTc > 1:875524/1‑130 (MQ=255) cATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGaa < 2:842184/112‑1 (MQ=35) cATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGaa > 1:842184/1‑112 (MQ=35) cGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAg > 2:464472/1‑150 (MQ=255) tgtgGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAggt > 2:149060/1‑150 (MQ=255) tgGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAggtgg > 1:1067548/1‑150 (MQ=255) gggTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCaa > 1:971250/1‑121 (MQ=255) gggTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCaa < 2:971250/121‑1 (MQ=255) gggTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAg > 1:67572/1‑122 (MQ=255) gggTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAg < 2:67572/122‑1 (MQ=255) gTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGa > 1:104278/1‑150 (MQ=255) ccATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAgtgt > 1:457335/1‑150 (MQ=255) aTGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGttt < 1:149060/150‑1 (MQ=255) gtgAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGttttt > 1:1255971/1‑150 (MQ=255) agTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATg < 1:464472/150‑1 (MQ=255) aGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTg < 2:104278/150‑1 (MQ=255) tCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACNCCTCTACAAGCGNGCAGGTNGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGtat > 1:966911/1‑150 (MQ=38) tCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGt < 1:642418/148‑1 (MQ=255) tCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGt > 2:642418/1‑148 (MQ=255) aTCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGtatta > 2:100622/1‑150 (MQ=255) gTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCt < 1:466802/141‑1 (MQ=255) gTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCt > 2:466802/1‑141 (MQ=255) tCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGtatt < 2:1125840/145‑1 (MQ=255) tCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGtatt > 1:1125840/1‑145 (MQ=255) tCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCa > 2:890458/1‑150 (MQ=255) ttCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTccc < 1:100622/150‑1 (MQ=255) ttCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTccc > 2:356946/1‑150 (MQ=255) cATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCcgc < 1:483330/150‑1 (MQ=255) tttCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAgtgt > 1:1142227/1‑119 (MQ=255) tttCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAgtgt < 2:1142227/119‑1 (MQ=255) tttCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCCGTATTATTCACCTCCCGcga > 2:742850/1‑150 (MQ=255) cAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAATGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACgaga > 1:1010262/1‑150 (MQ=255) aTCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGc < 1:777422/62‑1 (MQ=255) aTCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGc > 2:777422/1‑62 (MQ=255) tCTTCGTATGCAGGTATGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTTGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGa < 2:966911/150‑1 (MQ=255) cATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAg < 2:215389/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGttttt < 1:1072514/100‑1 (MQ=255) aTGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGttttt > 2:1072514/1‑100 (MQ=255) gTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGcgac > 1:1006604/1‑122 (MQ=255) gTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGcgac < 2:1006604/122‑1 (MQ=255) gTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGa > 2:1093827/1‑150 (MQ=255) tAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCCGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGaa < 1:742850/150‑1 (MQ=255) gTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGAAGTTaa > 2:375154/1‑150 (MQ=255) ttttGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGAAGTTaaa < 1:890458/150‑1 (MQ=255) | GGAACCACCTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGAAGTTAAA > NC_002947/176259‑176544 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |