| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4583538 | 65 (0.950) | 17 (0.290) | 15/228 | 3.7 | 24.8% | intergenic (‑67/+104) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 4583599 | 48 (0.830) | intergenic (‑128/+43) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4583377‑4583538‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccccgtaggagcgggtttaTCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGGATCGAGCAAGCTCGGATGTCTGTGCATGCAATTGAAAGGAGTCGCACATGGCCAA < NC_002947/4583599‑4583464 TCGAAGAAGGACTTGATGTGCAGCTGGTACATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGGCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCAAAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTA > 1:224733/1‑150TCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTA < 1:1026678/150‑1 CGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAG < 2:1123734/150‑1 GAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGG > 2:86758/1‑150 ACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGG > 1:111496/1‑150 ACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGG < 2:572583/150‑1 ACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGG < 2:1276888/150‑1 ACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCAACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGG < 2:1151723/150‑1 ACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCAGGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGG < 1:505604/150‑1 TTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGCGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTA > 1:1262121/1‑150 TTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGCGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTA < 2:1262121/150‑1 AGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAAg > 1:820116/1‑149 CTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCAT > 2:145395/1‑150 CACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTT < 1:1192176/113‑1 CACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTT > 2:1192176/1‑113 CACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGACCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTC > 2:942090/1‑150 ACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTA > 1:1521526/1‑113 ACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTA < 2:1521526/113‑1 ACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCC < 1:1353853/96‑1 ACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCC > 2:1353853/1‑96 GCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATC < 2:1609640/150‑1 CTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGC < 1:145395/150‑1 GCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATGGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGG < 2:111496/150‑1 GGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAA < 1:86758/150‑1 GGAAAGCTTGGCCATGTGCGACTTCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGACCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCC < 2:1643679/150‑1 CGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGACCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 1:942090/150‑1 TCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGC < 2:1103505/130‑1 TCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGC > 1:1103505/1‑130 CTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAAC < 2:151034/124‑1 CTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAAC > 1:151034/1‑124 TTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGG < 2:750130/117‑1 TTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGG > 1:750130/1‑117 TCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAA > 2:737893/1‑89 TCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAA < 1:737893/89‑1 CCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGGATAGCGCAAGCCCGGATGTCTGTGCATGCAATTGAAAGTATTCGCACATG < 2:1383370/150‑1 CCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGGATCGAGCAAGCTCGGATGTCTGTGCATGCAATTGAAAGGAGTCGCACATGG < 2:1423380/150‑1 CCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGGATCGAGCAAGCTCGGATGTCTGTG < 2:377715/123‑1 CCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGGATCGAGCAAGCTCGGATGTCTGTG > 1:377715/1‑123 TAGGAGCGGCTTTATGCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGGATCGAGCAAGCTCGGATGTCTGTGCATGCAATTGAAAGGAGTCGCACATGGCCAA < 2:552385/150‑1 TCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4583377‑4583538‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccccgtaggagcgggtttaTCCGCGAA‑‑‑CAC‑CGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGGATCGAGCAAGCTCGGATGTCTGTGCATGCAATTGAAAGGAGTCGCACATGGCCAA < NC_002947/4583599‑4583464 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |