New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6013891 | 57 (0.830) | 20 (0.370) | 18/214 | 2.8 | 29.3% | intergenic (+40/+70) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
? | NC_002947 | = 6013919 | 51 (0.930) | intergenic (+68/+42) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
TGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/6013718‑6013891 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcacgcccgctcccacaggtACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGGTAACCCTGGCTGTCCAG < NC_002947/6013919‑6013771 TGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTC > 2:144791/1‑150 TGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTC < 1:823509/150‑1 GCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGC < 1:944225/150‑1 GGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGG < 2:50595/150‑1 GGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGG < 2:211988/150‑1 GCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGC > 1:249283/1‑150 CGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTC < 2:621233/150‑1 TGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC < 2:814210/150‑1 TGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC > 2:233069/1‑150 TGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCAC > 2:1630346/1‑140 TGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCAC < 1:1630346/140‑1 GATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaagc < 2:745511/150‑6 agCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCAC > 1:1633940/3‑150 ATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCAC < 2:350109/150‑1 AGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT < 1:618177/150‑1 GAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG > 1:425594/1‑147 GAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG < 2:425594/147‑1 AGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACG > 1:1436654/1‑150 CGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCA > 1:1542437/1‑150 TTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGC‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAG > 1:947101/1‑150 CCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGCGT‑TCGAGAC < 2:374719/150‑1 GGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACC < 2:1436654/150‑1 gtGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGT < 2:1698051/148‑1 CCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCAC > 1:552705/1‑143 CCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCAC < 2:552705/143‑1 CCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGC < 1:1122398/141‑1 CCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGC > 2:1122398/1‑141 GCTGGCCCGGGTTAAGTCGCTGTAAGGTGGTGTTGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGC‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAG < 2:947101/150‑1 GTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGT < 1:215643/111‑1 GTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGT > 2:215643/1‑111 TCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGG > 2:1620118/1‑118 GAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTG > 1:232486/1‑105 GAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTG < 2:232486/105‑1 TTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGC > 2:254120/1‑77 TTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGC < 1:252796/77‑1 TTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGC > 2:252796/1‑77 TTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGC < 1:254120/77‑1 GGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGG‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCAGCAGGTGTCGCGTTTATTGGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGAGACTTCCCCCGGGCCAGCGATTCAAC > 1:521651/1‑150 ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGG > 2:1542437/1‑150 GCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGGTA > 1:1171775/1‑150 CCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACG‑CTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGA > 1:1620118/1‑118 CCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑AAAATAT‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGGTAAC > 1:896614/1‑150 CGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGGTAACC < 2:1057499/150‑1 GCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGGTAACCC > 2:841716/1‑150 TCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGGTAACCCTG < 1:1065881/150‑1 ACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGA < 1:1525106/91‑1 ACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGA > 2:1525106/1‑91 AGGTGCGGCAAAGCGT‑GCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTCACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGGTAACCCTGGCTGTC < 2:682787/150‑1 GTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGGTAACCCTGGCTGTCCA < 1:1421636/150‑1 TACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGGTAACCCTGGCTGTCCAG > 2:249283/1‑150 TGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/6013718‑6013891 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcacgcccgctcccacaggtACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGTCGCGTTTATTCGATGAAGCTGACCACACCACCTTCCAGCGACTTCACCCGGGCCAGCGATTCAACGCGGTAACCCTGGCTGTCCAG < NC_002947/6013919‑6013771 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |