New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 4861238 | 56 (1.010) | intergenic (‑144/+93) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGT > NC_002947/4861049‑4861345 | gATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 1:1092720‑M1/1‑149 (MQ=255) ggCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacat < 2:1499746‑M1/150‑12 (MQ=255) gCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAt > 2:864639/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAt > 2:879917/1‑150 (MQ=255) caaGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGAATTTGTTTTACCTTGCATATTAATACAGCAGCTTGGGGTGGTGAGTGGAGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTa < 1:963891/148‑1 (MQ=37) gATACGGGTTTCGTCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGc > 2:584608/1‑150 (MQ=255) gATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGc < 1:1371340/150‑1 (MQ=255) aCGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGt < 2:1527577/150‑1 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAgg > 2:394788/1‑126 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa < 2:1227867/150‑1 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa > 1:1227867/1‑150 (MQ=255) ggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGAt < 1:1170983/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCAC‑CGCCCTAGGGcatgtgac < 2:1611373/150‑8 (MQ=38) 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ctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaa < 2:198069‑M2/150‑21 (MQ=255) gcaaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagag > 1:1520980‑M2/1‑127 (MQ=255) gcaaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagag < 1:111659‑M2/150‑24 (MQ=255) caaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGt > 2:687152/1‑119 (MQ=255) caaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGt < 1:687152/119‑1 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGcc < 2:601153/103‑1 (MQ=255) 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cccGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgc > 2:1413580‑M1/1‑8 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatc < 2:1092720‑M2/150‑102 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatc < 1:206996‑M2/150‑102 (MQ=255) ccGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcc > 1:1102496‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggaccgggtttacccgcgaagaggctggcacactcaacagccacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgcttggcaagagaacacaactcc > 2:813964‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccacc > 1:305041‑M2/1‑48 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:556328/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCt < 2:754280/150‑1 (MQ=255) cTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctgggaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccat < 1:1325990‑M1/150‑147 (MQ=255) cTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccat < 2:979691‑M1/150‑147 (MQ=255) cTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccat < 2:419171‑M2/150‑106 (MQ=255) cTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg < 1:578970/150‑1 (MQ=255) tCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccatg < 2:1537160‑M1/150‑148 (MQ=255) cctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccatga < 1:1539724‑M1/150‑149 (MQ=255) | GATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGT > NC_002947/4861049‑4861345 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |