| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3689486 | 19 (1.010) | 4 (0.220) | 4/236 | NT | 17.3% | coding (463/654 nt) | PP_3254 | nucleosidase |
| ? | NC_002947 | = 3689511 | 20 (1.110) | coding (488/654 nt) | PP_3254 | nucleosidase | |||||
CCGTTATGAAACACCCTTGTCCGACACCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTAAATACATTTCCGATGATGCCGGCAGCGAAGCCGCGGGGGATTGGGCGGTACAAGTGCA > NC_002947/3689374‑3689631 | ccGTTATGAAACACCCTTGTCCGACACCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTa > 1:134687/1‑150 (MQ=255) aaCACCCTTGTCCGACACCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGTCGACCACGTCGTAAGGCGCG‑TCGCcatggttgatctcgaagctgt < 2:90146‑M2/150‑22 (MQ=255) cacCCTTGTCCGACACCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGTCGACCACGTCGTAAGGCGCG‑TCGCcatggttgatctcgaagctgtca > 1:90146‑M2/1‑127 (MQ=255) ccTTGTCCGACACCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGGCTTGa > 1:463164/1‑150 (MQ=255) cGACACCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGtcgaccacgtcgtaaggcgcgtcgccatggtt < 1:212183‑M1/124‑33 (MQ=255) cGACACCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGtcgaccacgtcgtaaggcgcgtcgccatggtt > 2:212183‑M1/1‑92 (MQ=255) acacCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCggg > 2:297183/1‑150 (MQ=255) acacCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCggg < 2:134687/150‑1 (MQ=255) acCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGt > 1:502623/1‑150 (MQ=255) tACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATcc < 1:297183/150‑1 (MQ=255) gcAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTaaa > 2:386101/1‑150 (MQ=255) tACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTAAATACa < 2:502623/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTGTGGAACCCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTAAATAc > 2:7979/1‑142 (MQ=255) ccTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTAAATAc < 1:7979/142‑1 (MQ=255) gAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTAAAt < 2:362160/130‑1 (MQ=255) gAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTAAAt > 1:362160/1‑130 (MQ=255) tGACAGCTTCGAGATCAACCATGgcgacgcgccttacgacgtggtcgacatggttgatctcgaagctgtcaccgctgccacaggtttccacagccaggccgggtattgccgccccgtgttcgagtaccaccggggtgtcggacaagggtg > 1:90146‑M1/1‑23 (MQ=255) tGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTAAATACATTTCCgat < 1:323406/124‑1 (MQ=255) tGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTAAATACATTTCCgat > 2:323406/1‑124 (MQ=255) aCAGCTTCGAGATCAACCATGgcgacgcgccttacgacgtggtcgacatggttgatctcgaagctgtcaccgctgccacaggtttccacagccaggccgggtattgccgccccgtgttcgagtaccaccggggtgtcggacaagggtgtt < 2:90146‑M1/150‑130 (MQ=255) aGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCt > 1:350337/1‑62 (MQ=255) aGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCt < 2:350337/62‑1 (MQ=255) gagaTCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTACCTGTAGGTTTCACATATGTCTTATGATGACGGCAGCGAAGCCACGGGGGATTGGGCGGTa > 2:13361/1‑150 (MQ=255) cAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCtt < 2:198896/94‑1 (MQ=255) cAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCtt > 1:198896/1‑94 (MQ=255) aaCCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGAcatggttgatctcgaagctgtcaccgctgccacaggtttccacagccaggccgggtattgccgccccgtgttcgagtaccaccggggtgtcg > 2:212183‑M2/1‑32 (MQ=255) aaCCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGAcatggttgatctcgaagctgtcaccgctgccacaggtttccacagccaggccgggtattgccgccccgtgttcgagtaccaccggggtgtcg < 1:212183‑M2/124‑93 (MQ=255) ccATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTAAATACATTTCCGATGATGCCGGCAGCGAAGCCGCGGGGGATTGGGCGGTACAAGTGCa < 2:11306/150‑1 (MQ=255) | CCGTTATGAAACACCCTTGTCCGACACCCCGGTGGTACTCGAACACGGGGCGGCAATACCCGGCCTGGCTGTGGAAACCTGTGGCAGCGGTGACAGCTTCGAGATCAACCATGGCGACG‑CGCCTTACGACGTGGTCGACATGGAAGCCTACGTGCTGGCATTGATCGCGCGGGGTGAAGGTATCCCGTTCGTGTGCCTTAAATACATTTCCGATGATGCCGGCAGCGAAGCCGCGGGGGATTGGGCGGTACAAGTGCA > NC_002947/3689374‑3689631 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |