| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4796257 = | 20 (1.060) | 4 (0.220) | 4/234 | NT | 17.0% | coding (231/1359 nt) | pvdH | diaminobutyrate‑2‑oxoglutarate transaminase |
| ? | NC_002947 | 4796290 = | 20 (1.120) | coding (198/1359 nt) | pvdH | diaminobutyrate‑2‑oxoglutarate transaminase | |||||
AGTGCCGGTCGGGCCACAGAACTGCACCTTGGCCTCGCGGCGCAGCGCCTCGGGCAGGATGCCGAACAGGTCCTGGACGAAGCGGTCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTGGCGGCCTTCGACGTCTTCGACGTGGATGCCACGGGCACGCCTGAGCGCCAGCGG > NC_002947/4796119‑4796394 | aGTGCCGGTCGGGCCACAGAACTGCACCTTGGCCTCGCGGCGCAGCGCCCCGGGCAGGATGCCGAACAGGTCCTGGACGAAGCGGTCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGAt < 1:445210/150‑1 (MQ=255) ccACAGAACTGCACCTTGGCCTCGCGGCGCAGCGCCTCGGGCAGGATGCCGAACAGGTCCTGGACGAAGCGGTCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGaccacc < 1:406264/150‑1 (MQ=255) aGAACTGCACCTTGGCCTCGCGGCGCAGCGCCTCGGGCAGGATGCCGACCAGAACGTAGACGAAGCGGTCATTGTGCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCg > 1:317277/1‑150 (MQ=255) atctgCCTCGCGGCGCAGCGCCTCGGGCAGGATGCCGAACAGGTCCTGGACGAAGCGGTCCTTGACCGGTGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTtgtg < 1:83674/146‑1 (MQ=255) ccTCGCGGCGCAGCGCCTCGGGCAGGATGCCGAACAGGTCCTGGACGAAGCGGTCCTTGACCGGTGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGTATCTCCTCTACCACCACCGGGTGGTTGTggagat > 2:83674/1‑146 (MQ=255) tCGCGGCGCAGCGCCTCGGGCAGGATGCCGAACAGGTCCTGGACGAAGCGGGCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCccagg > 1:220263/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCGCCTCGGGCAGGATGCAGAACCGGCACTGGACGAAGCGGTCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCccagggccag < 2:337962/150‑1 (MQ=255) cTCGGGCAGGATGCCGAACAGGTCCTGGACGAAGCGGTCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGc > 1:76315/1‑150 (MQ=255) tCGGGCAGGATGCCGAACAGGTCCTGGACGAAGCGGTCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCa > 2:482920/1‑150 (MQ=255) gaagacgtcgaaggccgccagttcatcgactgcctggccggtgccggcaccctggccctgggccacaacCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTgg > 1:226232‑M1/70‑109 (MQ=255) gaagacgtcgaaggccgccagttcatcgactgcctggccggtgccggcaccctggccctgggccacaacCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTgg < 2:226232‑M1/40‑1 (MQ=255) gTCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTGGCGGCcttcgac < 2:76315/150‑1 (MQ=255) tCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTggcg < 1:217947/140‑1 (MQ=255) tCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTggcg > 2:217947/1‑140 (MQ=255) tcgactgcctggccggtgccggcaccctggccctgggccacaacCACCCGCTGGATCGCCTCGaccaccacc < 1:418265‑M1/28‑1 (MQ=255) tcgactgcctggccggtgccggcaccctggccctgggccacaacCACCCGCTGGATCGCCTCGaccaccacc > 2:418265‑M1/45‑72 (MQ=255) gggTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTggcg < 2:86715/130‑1 (MQ=255) gggTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTggcg > 1:86715/1‑130 (MQ=255) ggtCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCAACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGCGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTGGCGGCCTTCGACGTCTTCGACGTGGAt < 2:164346/150‑1 (MQ=255) tCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTGGCGGCCTTGGACGTCTTCGACGTGGATGc > 2:498773/1‑150 (MQ=255) tCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTGGCGGCCTCCGACGTCTTCGACGTGGATGc > 2:131685/1‑150 (MQ=255) aGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTGGCGGCCTCCGACGTCTTCGACGTGGATGCCACGGGCACGCCTGAgc < 1:131685/150‑1 (MQ=255) gCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTGGCGGCCTTCGACGTCTTCGACGTGGATGCCACGGGCACGCCTGAgcg > 2:355878/1‑150 (MQ=255) cTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTGGCGGCCTTCGACGTCTTCGACGTGGATGCCACGGGCACGCCTGAGCGCCAGCgg < 1:498773/150‑1 (MQ=255) | AGTGCCGGTCGGGCCACAGAACTGCACCTTGGCCTCGCGGCGCAGCGCCTCGGGCAGGATGCCGAACAGGTCCTGGACGAAGCGGTCCTTGACCGGGGTGGTCAGGTCCAAGGTGTGCAGCGGCAACTCGTCAGCCAGCACCCGCTGGATCGCCTCGACCACCACCGGGTGGTTGTGGCCCAGGGCCAGGGTGCCGGCACCGGCCAGGCAGTCGATGAACTGGCGGCCTTCGACGTCTTCGACGTGGATGCCACGGGCACGCCTGAGCGCCAGCGG > NC_002947/4796119‑4796394 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |