New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5386730 = | 39 (1.300) | 6 (0.210) | 6/264 | 2.6 | 14.3% | coding (192/2811 nt) | dld2 | D‑lactate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5386761 = | 35 (1.240) | coding (223/2811 nt) | dld2 | D‑lactate dehydrogenase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTCCACCCTGGCCTTCGGCACCGACGCCAGCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGATCGGCGCCCAGGCCAACGCCTGGCTGGCCCCCTTC > NC_002947/5386613‑5386907 | cTCCACCCTGGCCTTCGGCACCGACGCCAGCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAg > 1:223245/1‑150 (MQ=255) tCCACCCTGGCCTTCGGCACCGACGCCATCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGc > 1:97286/1‑150 (MQ=255) tCCACCCTGGCCTTCGGCACCGACGCCAGCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGc < 2:36954/150‑1 (MQ=255) cACCCTGGCCTTCGGCACCGACGCCAGCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCt < 1:593154/150‑1 (MQ=255) cACCCTGGCCTTCGGCACCGACGCCAGCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCt < 2:614699/150‑1 (MQ=255) cACCCTGGCCTTCGGCACCGACGCCAGCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCt < 2:526160/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCTTCGGCACCGACGCCAGCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTc > 2:191053/1‑150 (MQ=255) cacgccgggttgcaggcgaatctgctcgccctggcgacgaatttcgcggccgttccagttatcgccgagcacgatcagcaccgagtcgctgatggcctggccagacaggctGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCa > 2:308759‑M1/112‑143 (MQ=255) cacgccgggttgcaggcgaatctgctcgccctggcgacgaatttcgcggccgttccagttatcgccgagcacgatcagcaccgagtcgctgatggcctggccagacaggctGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCa < 1:308759‑M1/32‑1 (MQ=255) tGGCCTTCGGCACCGACGCCAGCTTCTACCGCTTGAGCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGAACCAGACTGTCTg > 2:55877/1‑150 (MQ=255) aggcgaatctgctcgccctggcgacgaatttcgcggccgttccagttatcgccgagcacgatcagcaccgagtcgctgatggcctggccagacaggctGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCt > 1:391376‑M1/99‑138 (MQ=255) aggcgaatctgctcgccctggcgacgaatttcgcggccgttccagttatcgccgagcacgatcagcaccgagtcgctgatggcctggccagacaggctGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCt < 2:391376‑M1/40‑1 (MQ=255) cAGCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGt < 1:85095/128‑1 (MQ=255) cAGCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGt > 2:85095/1‑128 (MQ=255) cccAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGc > 1:14748/1‑150 (MQ=255) ccAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCg > 2:407184/1‑150 (MQ=255) ccAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCg > 1:631713/1‑150 (MQ=255) gtgCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGCTCTGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAAc > 1:483702/1‑150 (MQ=255) gcgTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGcc < 1:191053/150‑1 (MQ=255) gcgTCCAGTCCTAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGcc < 2:347715/150‑1 (MQ=255) ggTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGaaa < 2:483702/149‑1 (MQ=255) tCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACAAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGATGCGGTGCGGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAAtt > 2:333948/1‑150 (MQ=255) gTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGc < 1:407184/150‑1 (MQ=255) gTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGc > 1:23095/1‑150 (MQ=255) ccTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGAt > 2:197774/1‑150 (MQ=255) cTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGAtt > 1:700508/1‑150 (MQ=255) aTCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTAGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGc > 2:342632/1‑150 (MQ=255) aaCTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGc > 1:136139/1‑150 (MQ=255) aCTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGCGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCa > 2:98816/1‑150 (MQ=255) ggCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATGCGCCTGCAAcc < 2:631713/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAAccc > 1:107373/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAAccc > 1:445070/1‑150 (MQ=255) agacaggctggtgccggcagcgcggaaggtgaccggcaccAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCt > 1:391376‑M2/41‑138 (MQ=255) agacaggctggtgccggcagcgcggaaggtgaccggcaccAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCt < 2:391376‑M2/98‑1 (MQ=255) cgAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGAt < 1:333948/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGTAACCCGGCGTGATc < 1:197774/150‑1 (MQ=255) aGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACGCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGATCg < 2:97286/150‑1 (MQ=255) tggtgccggcagcgcggaaggtgaccggcaccAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTg < 1:308759‑M2/111‑1 (MQ=255) tggtgccggcagcgcggaaggtgaccggcaccAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTg > 2:308759‑M2/33‑143 (MQ=255) gggTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGATCGgcg > 2:687896/1‑150 (MQ=255) gtgccggcagcgcggaaggtgaccggcaccAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGaa < 1:75614‑M2/59‑1 (MQ=255) gtgccggcagcgcggaaggtgaccggcaccAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGaa > 2:75614‑M2/31‑89 (MQ=255) cTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGATCGGCGCCCAGGCCAACGc > 1:587345/1‑150 (MQ=255) ccGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGATCGGCGCCCAGGCCAACGCctg < 2:445070/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTTGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGATCGGCGCCCAGGCCAACGCctggct < 1:55877/150‑1 (MQ=255) gcctgcaccAGTCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGATCGGCGCCCAGGCCAACGCCTGGCTGGcc < 1:278960‑M2/141‑1 (MQ=255) accAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGATCGGCGCCCAGGCCAACGCCTGGCTGGCCCCCTTc > 1:396592‑M2/4‑150 (MQ=255) accAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGATCGGCGCCCAGGCCAACGCCTGGCTGGCCCCCTTc > 1:463171‑M2/4‑150 (MQ=255) | CTCCACCCTGGCCTTCGGCACCGACGCCAGCTTCTACCGCTTGATCCCCAAGCTGGTGGTGCGCGTCGAGTCCGAGGACGAAGTGGTCGGCCTGATCAAACTGGCCCAGCGCGAGCGGGTGCCGGTCACCTTCCGCGCTGCCGGCACCAGCCTGTCTGGCCAGGCCATCAGCGACTCGGTGCTGATCGTGCTCGGCGATAACTGGAACGGCCGCGAAATTCGTCGCCAGGGCGAGCAGATTCGCCTGCAACCCGGCGTGATCGGCGCCCAGGCCAACGCCTGGCTGGCCCCCTTC > NC_002947/5386613‑5386907 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |