New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5201627 = | 90 (1.010) | 25 (0.390) | 18/188 | 3.7 | 27.8% | intergenic (‑65/‑115) | PP_4582/PP_4583 | membrane protein/putative Peptidase |
? | NC_002947 | 5201722 = | 65 (1.020) | intergenic (‑160/‑20) | PP_4582/PP_4583 | membrane protein/putative Peptidase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
CGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAA > NC_002947/5201478‑5201774 | tggTGGGCTTCAAGCTCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGtt > 1:1438312/2‑150 (MQ=255) ggTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGttt < 1:1938937/150‑1 (MQ=255) gAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGcc < 1:1099578/150‑1 (MQ=255) ggCTTCAAGCTCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCt < 2:1438312/149‑1 (MQ=255) gCTTGAAGCCCACTAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCTGTCATAGTTTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCtg < 2:1219235/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCtgt > 1:108253/1‑150 (MQ=255) cTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCtgt > 2:1732425/1‑150 (MQ=255) cTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGAGGTGGTTTGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCtgt > 1:1850174/1‑150 (MQ=255) ttGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCtgtg > 2:680178/1‑150 (MQ=255) gAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCt < 1:481477/145‑1 (MQ=255) gAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCt > 2:481477/1‑145 (MQ=255) gCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGc < 1:834349/150‑1 (MQ=255) cggcagGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTc > 2:68730/3‑150 (MQ=255) cagcagGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTc > 1:1527577/1‑150 (MQ=255) agGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:1527577/150‑1 (MQ=255) aCCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGAAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTaa > 1:490003/1‑150 (MQ=255) ccTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTCAAc > 1:767754/1‑150 (MQ=255) ccTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 2:510069/1‑150 (MQ=255) ccTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCCGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:1345765/150‑1 (MQ=255) aGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTATCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGAGGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:513608/150‑1 (MQ=255) tACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcc > 1:2030567/1‑150 (MQ=255) tACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAAca > 1:2271529/1‑149 (MQ=255) tACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTACTCGTCCTCGGTTATGCTGGACGTTCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTccaaca > 1:397560/1‑146 (MQ=38) tGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCg > 1:1425703/1‑150 (MQ=255) cGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGt < 2:1246608/150‑1 (MQ=255) tACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGc < 1:1877487/150‑1 (MQ=255) cAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGa < 2:1599200/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGAt > 2:1292112/1‑150 (MQ=255) cccAGTCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑Ct > 2:610250/1‑150 (MQ=255) cccAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg > 2:2161060/1‑119 (MQ=255) cccAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:2161060/119‑1 (MQ=255) cccAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑Ct < 2:2276409/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATcc‑cgg > 1:1959036/1‑148 (MQ=255) aGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCTAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGtt < 1:844521/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGCGGTGCGATCC‑CTGTTg < 1:510069/150‑1 (MQ=255) ggTGTAGTCGTTCTTGGTCATGGTGTTGGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGTCTATGATAACCACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCgg < 2:305307/150‑1 (MQ=39) ggTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCgg < 2:197663/150‑1 (MQ=255) ggTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCgg < 1:610250/150‑1 (MQ=255) ggTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTCTGCCGGCCTCTTCGCGGGAAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCgg > 2:881163/1‑150 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCggg < 1:755048/150‑1 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCggg < 1:1055927/150‑1 (MQ=255) gtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:927389/106‑1 (MQ=255) gtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg > 2:927389/1‑106 (MQ=255) gtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTCGAGCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGtt > 1:1166000/1‑150 (MQ=255) gtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGtt > 1:627344/1‑150 (MQ=255) gTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:334506/103‑1 (MQ=255) gTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg > 1:334506/1‑103 (MQ=255) gTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTAc > 1:744360/1‑150 (MQ=255) gTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCcg > 1:1001014/1‑150 (MQ=255) tcGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCCGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGGTGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:1333800/1‑150 (MQ=255) tcGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 1:1687988/107‑1 (MQ=255) tcGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt > 2:1687988/1‑107 (MQ=255) tcGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:2030567/150‑1 (MQ=255) tcGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTAAACCcgctcc < 1:68730/150‑4 (MQ=255) aTGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTAccc > 1:1189872/1‑139 (MQ=255) aTGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTAccc < 2:1189872/139‑1 (MQ=255) tGGTGTTCGTGCAAGCGCGGCAGTGCGGTGCCTAGTGTGACCACGTCTGCGCGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGCGTAACCCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 2:1959036/150‑1 (MQ=21) tGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 1:1292112/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < 2:1425703/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < 2:627344/150‑1 (MQ=255) gtgtTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAA‑CAGGGATCGCACCGAGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg > 1:973614/1‑148 (MQ=14) gTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 1:1784656/1‑87 (MQ=255) gTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:1784656/87‑1 (MQ=255) tGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCtgtg < 2:814652/65‑1 (MQ=255) tGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCtgtg > 1:814652/1‑65 (MQ=255) tGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CCGTTGGAGCGGGATTACCCGCGAAGGGGCCGGcaccgaca > 2:1482197/1‑145 (MQ=255) aaGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCTCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACACGCAACt > 2:1338207/1‑150 (MQ=255) aaGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACt > 1:1884727/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGCGCGGAGACAGTGTTTGCCTTTGCCGGCGTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAAGTcc > 2:1970538/1‑150 (MQ=38) cAGTCAAAGAGATGCTTATTATTAACGATTCTGCGGCCGCAGAGATTTTTTCCCTGTGCCGCCCTCTTCCCCTGTACGCCCCCTTTTCGCTCGCTGCCAACG‑CTATGGGAGCGGGTTGATCAACGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCaa < 2:1884727/150‑1 (MQ=255) gCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCa > 1:1406940/1‑150 (MQ=255) aaaGAGATGCCTATGATAATCACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATcc‑c < 1:2103024/98‑1 (MQ=255) aaaGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATcc‑c > 2:2103024/1‑98 (MQ=255) gaTGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCggg < 2:1859463/105‑1 (MQ=255) gaTGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGCCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCggg > 1:1859463/1‑105 (MQ=255) tATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAAt > 2:1809184/1‑150 (MQ=255) tATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGGTGACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACTACAAACAAAAGACCtgctac > 2:1840049/1‑145 (MQ=37) gATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:2024558/1‑64 (MQ=255) gATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:2024558/64‑1 (MQ=255) gATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 1:136990/108‑1 (MQ=255) gATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:136990/1‑108 (MQ=255) acTTTTCCGGGCGCAGGCAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 1:15799/63‑1 (MQ=255) acTTTTCCGGGCGCAGGCAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 2:15799/1‑63 (MQ=255) aCAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAAt > 1:1815548/1‑124 (MQ=255) aCAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAAt < 2:1815548/124‑1 (MQ=255) aCAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTg > 1:1886351/1‑150 (MQ=255) atcgtTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGcc > 1:79272/4‑150 (MQ=255) gtTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCaa > 1:87814/1‑150 (MQ=255) tttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTg < 1:1559432/48‑1 (MQ=255) tttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTg > 2:1559432/1‑48 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCgg < 2:573347/65‑1 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCgg > 1:573347/1‑65 (MQ=255) | CGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCC‑CTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAA > NC_002947/5201478‑5201774 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |