New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2295818 = | 49 (0.890) | 12 (0.260) | 9/232 | 4.4 | 23.2% | intergenic (+21/+112) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | 2295903 = | 39 (0.860) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
GGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2295988‑2295818 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > NC_002947/2295903‑2296047 GGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTC > 1:174715/1‑150 GAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAAACATGGTCCGCTGATTAAACATCGACCTTCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCG > 1:1077650/1‑150 CTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTTCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 1:907242/150‑1 GGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGGGTGGGAGCGGGCATGCCGGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGC < 1:536505/150‑1 GGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGC < 1:7064/150‑1 AGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGTAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCC < 1:457685/150‑1 GGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGC > 1:94937/1‑150 GCTGGCTTCGGAGCTGGTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCA < 2:486112/150‑1 TGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA > 2:206929/1‑150 TCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCG < 1:824672/108‑1 TCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCG > 2:824672/1‑108 ACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGA < 2:123458/131‑1 ACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGA > 1:123458/1‑131 GGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAA < 2:290653/127‑1 GGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAA > 1:290653/1‑127 ATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAG > 1:1027329/1‑150 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGA > 1:308703/1‑72 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGA < 2:308703/72‑1 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGA > 2:1056361/1‑72 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGA < 1:1056361/72‑1 CCGCGAAGCGGGCACCGAGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAG > 2:854369/1‑150 GAAGCGGGCACCGCGGAGGATGGCACCTAGCCTGCCGGTGTTCTCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACTATGATTGCCTTGAAAAACTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCC > 1:307930/1‑150 GGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAC > 2:1097365/1‑150 GGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGGCCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAGCGACTACGTTTCGAGCCC > 1:976226/1‑150 GCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCG < 1:1180379/150‑1 ggCCGCTCCCTCACTGACACATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCCCCCCTCCCGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAA < 2:1195235/148‑1 CCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAA > 2:977638/1‑72 CCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAA < 1:977638/72‑1 GCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTG < 1:842757/150‑1 CCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > 1:1229215/1‑150 CCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > 1:1177153/1‑150 CACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCG < 2:473144/37‑1 CACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCG > 1:473144/1‑37 GGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2295988‑2295818 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > NC_002947/2295903‑2296047 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |